RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560321.5

KNSTRN-210, Transcript of kinetochore localized astrin (SPAG5) binding protein, humanhuman

TSL 3

Gene KNSTRN, Length 940 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNSTRN-210ENST00000560321 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.33■■■■■ 5.33
KNSTRN-210ENST00000560321 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.3■■■■■ 4.52
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCC9O60706 1549 aa42.63■■■■■ 4.42
KNSTRN-210ENST00000560321 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.96■■■■■ 4.15
KNSTRN-210ENST00000560321 NACADO15069 1562 aa40.79■■■■■ 4.12
KNSTRN-210ENST00000560321 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.65■■■■■ 4.1
KNSTRN-210ENST00000560321 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.38■■■■■ 4.06
KNSTRN-210ENST00000560321 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
KNSTRN-210ENST00000560321 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa40.02■■■■■ 4
KNSTRN-210ENST00000560321 UNC13AQ9UPW8 1703 aa39.97■■■■□ 3.99
KNSTRN-210ENST00000560321 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.72■■■■□ 3.95
KNSTRN-210ENST00000560321 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.54■■■■□ 3.92
KNSTRN-210ENST00000560321 SCRIBQ14160 1630 aa39.36■■■■□ 3.89
KNSTRN-210ENST00000560321 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.35■■■■□ 3.89
KNSTRN-210ENST00000560321 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.3■■■■□ 3.88
KNSTRN-210ENST00000560321 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
KNSTRN-210ENST00000560321 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.59■■■■□ 3.77
KNSTRN-210ENST00000560321 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.41■■■■□ 3.74
KNSTRN-210ENST00000560321 SMARCA4P51532 1647 aa37.62■■■■□ 3.61
KNSTRN-210ENST00000560321 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
KNSTRN-210ENST00000560321 NCAPD3P42695 1498 aa37.56■■■■□ 3.6
KNSTRN-210ENST00000560321 SMARCA2P51531 1590 aa37.55■■■■□ 3.6
KNSTRN-210ENST00000560321 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.48■■■■□ 3.59
KNSTRN-210ENST00000560321 HMGXB3Q12766 1538 aa37.38■■■■□ 3.57
KNSTRN-210ENST00000560321 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.25■■■■□ 3.55
KNSTRN-210ENST00000560321 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.24■■■■□ 3.55
KNSTRN-210ENST00000560321 MROH2BQ7Z745 1585 aa37.17■■■■□ 3.54
KNSTRN-210ENST00000560321 ERCC6Q03468 1493 aa36.92■■■■□ 3.5
KNSTRN-210ENST00000560321 WIZO95785 1651 aa36.8■■■■□ 3.48
KNSTRN-210ENST00000560321 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.73■■■■□ 3.47
KNSTRN-210ENST00000560321 NESP48681 1621 aa36.7■■■■□ 3.47
KNSTRN-210ENST00000560321 CUX2O14529 1486 aa36.66■■■■□ 3.46
KNSTRN-210ENST00000560321 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.6■■■■□ 3.45
KNSTRN-210ENST00000560321 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.51■■■■□ 3.44
KNSTRN-210ENST00000560321 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.45■■■■□ 3.43
KNSTRN-210ENST00000560321 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
KNSTRN-210ENST00000560321 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.38■■■■□ 3.41
KNSTRN-210ENST00000560321 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
KNSTRN-210ENST00000560321 CFTRP13569 1480 aa36.12■■■■□ 3.37
KNSTRN-210ENST00000560321 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.1■■■■□ 3.37
KNSTRN-210ENST00000560321 CEP164Q9UPV0 1460 aa36.09■■■■□ 3.37
KNSTRN-210ENST00000560321 FANCD2Q9BXW9 1451 aa36.04■■■■□ 3.36
KNSTRN-210ENST00000560321 PRDM2Q13029 1718 aa36■■■■□ 3.35
KNSTRN-210ENST00000560321 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.98■■■■□ 3.35
KNSTRN-210ENST00000560321 WDR62O43379 1518 aa35.97■■■■□ 3.35
KNSTRN-210ENST00000560321 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.94■■■■□ 3.34
KNSTRN-210ENST00000560321 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCC8Q09428 1581 aa35.54■■■■□ 3.28
KNSTRN-210ENST00000560321 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.42■■■■□ 3.26
KNSTRN-210ENST00000560321 TOPBP1Q92547 1522 aa35.4■■■■□ 3.26
KNSTRN-210ENST00000560321 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.37■■■■□ 3.25
KNSTRN-210ENST00000560321 IFT140Q96RY7 1462 aa35.35■■■■□ 3.25
KNSTRN-210ENST00000560321 OSCARQ8IYS5 282 aa35.09■■■■□ 3.21
KNSTRN-210ENST00000560321 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
KNSTRN-210ENST00000560321 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP35.04■■■■□ 3.2
KNSTRN-210ENST00000560321 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
KNSTRN-210ENST00000560321 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP35.03■■■■□ 3.2
KNSTRN-210ENST00000560321 SOGA1O94964 1423 aa34.95■■■■□ 3.19
KNSTRN-210ENST00000560321 CUX1P39880 1505 aa34.91■■■■□ 3.18
KNSTRN-210ENST00000560321 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.91■■■■□ 3.18
KNSTRN-210ENST00000560321 WDR97A6NE52 1622 aa34.89■■■■□ 3.18
KNSTRN-210ENST00000560321 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.86■■■■□ 3.176e-7■■■■□ 20.4
KNSTRN-210ENST00000560321 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.85■■■■□ 3.17
KNSTRN-210ENST00000560321 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.74■■■■□ 3.15
KNSTRN-210ENST00000560321 CHD1O14646 1710 aa34.72■■■■□ 3.15
KNSTRN-210ENST00000560321 FBLN2P98095 1184 aa34.66■■■■□ 3.14
KNSTRN-210ENST00000560321 TRIM41Q8WV44 630 aa34.63■■■■□ 3.13
KNSTRN-210ENST00000560321 GRIN2BQ13224 1484 aa34.62■■■■□ 3.13
KNSTRN-210ENST00000560321 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
KNSTRN-210ENST00000560321 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.59■■■■□ 3.13
KNSTRN-210ENST00000560321 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.59■■■■□ 3.13
KNSTRN-210ENST00000560321 TOP2BQ02880 1626 aa34.59■■■■□ 3.13
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.57■■■■□ 3.12
KNSTRN-210ENST00000560321 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.57■■■■□ 3.12
KNSTRN-210ENST00000560321 PBRM1Q86U86 1689 aa34.55■■■■□ 3.12
KNSTRN-210ENST00000560321 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.55■■■■□ 3.12
KNSTRN-210ENST00000560321 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.52■■■■□ 3.12
KNSTRN-210ENST00000560321 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.49■■■■□ 3.11
KNSTRN-210ENST00000560321 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.49■■■■□ 3.11
KNSTRN-210ENST00000560321 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.49■■■■□ 3.11
KNSTRN-210ENST00000560321 SYNJ1O43426 1573 aa34.47■■■■□ 3.11
KNSTRN-210ENST00000560321 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.47■■■■□ 3.11
KNSTRN-210ENST00000560321 SYNJ2O15056 1496 aa34.44■■■■□ 3.1
KNSTRN-210ENST00000560321 ARHGEF11O15085 1522 aa34.43■■■■□ 3.1
KNSTRN-210ENST00000560321 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.24■■■■□ 3.07
KNSTRN-210ENST00000560321 ERICH3Q5RHP9 1530 aa34.2■■■■□ 3.07
KNSTRN-210ENST00000560321 ADAMTS12P58397 1594 aa34.18■■■■□ 3.06
KNSTRN-210ENST00000560321 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.16■■■■□ 3.06
KNSTRN-210ENST00000560321 FHAD1B1AJZ9 1412 aa34.14■■■■□ 3.06
KNSTRN-210ENST00000560321 GRIN2AQ12879 1464 aa34.14■■■■□ 3.06
KNSTRN-210ENST00000560321 ARAP1Q96P48 1450 aa34.07■■■■□ 3.04
KNSTRN-210ENST00000560321 KIF27Q86VH2 1401 aa33.98■■■■□ 3.03
KNSTRN-210ENST00000560321 NUP160Q12769 1436 aa33.97■■■■□ 3.03
KNSTRN-210ENST00000560321 CEP170Q5SW79 1584 aa33.94■■■■□ 3.02
KNSTRN-210ENST00000560321 CUL7Q14999 1698 aa33.87■■■■□ 3.01
KNSTRN-210ENST00000560321 SHROOM2Q13796 1616 aa33.79■■■■□ 3
KNSTRN-210ENST00000560321 IGF1RP08069 1367 aa33.77■■■■□ 3
KNSTRN-210ENST00000560321 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.71■■■□□ 2.99
KNSTRN-210ENST00000560321 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.68■■■□□ 2.98
KNSTRN-210ENST00000560321 JPH4Q96JJ6 628 aa33.67■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms