RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559894.1

MESP1-202, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene MESP1, Length 451 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-202ENST00000559894 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.78■■■■□ 3.32
MESP1-202ENST00000559894 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.11■■■□□ 2.73
MESP1-202ENST00000559894 ABCC9O60706 1549 aa32.06■■■□□ 2.72
MESP1-202ENST00000559894 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.55■■■□□ 2.48
MESP1-202ENST00000559894 NACADO15069 1562 aa30.35■■■□□ 2.45
MESP1-202ENST00000559894 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.19■■■□□ 2.42
MESP1-202ENST00000559894 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.98■■■□□ 2.39
MESP1-202ENST00000559894 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.95■■■□□ 2.38
MESP1-202ENST00000559894 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.84■■■□□ 2.37
MESP1-202ENST00000559894 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.79■■■□□ 2.36
MESP1-202ENST00000559894 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.68■■■□□ 2.34
MESP1-202ENST00000559894 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.62■■■□□ 2.33
MESP1-202ENST00000559894 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.58■■■□□ 2.33
MESP1-202ENST00000559894 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.29■■■□□ 2.28
MESP1-202ENST00000559894 SCRIBQ14160 1630 aa29.26■■■□□ 2.27
MESP1-202ENST00000559894 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.95■■■□□ 2.23
MESP1-202ENST00000559894 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
MESP1-202ENST00000559894 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.88■■■□□ 2.21
MESP1-202ENST00000559894 NCAPD3P42695 1498 aa28.01■■■□□ 2.07
MESP1-202ENST00000559894 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.93■■■□□ 2.06
MESP1-202ENST00000559894 SMARCA4P51532 1647 aa27.91■■■□□ 2.06
MESP1-202ENST00000559894 SMARCA2P51531 1590 aa27.87■■■□□ 2.05
MESP1-202ENST00000559894 HMGXB3Q12766 1538 aa27.82■■■□□ 2.04
MESP1-202ENST00000559894 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
MESP1-202ENST00000559894 ERCC6Q03468 1493 aa27.71■■■□□ 2.03
MESP1-202ENST00000559894 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
MESP1-202ENST00000559894 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.65■■■□□ 2.02
MESP1-202ENST00000559894 CUX2O14529 1486 aa27.64■■■□□ 2.01
MESP1-202ENST00000559894 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.56■■■□□ 2
MESP1-202ENST00000559894 NESP48681 1621 aa27.53■■■□□ 2
MESP1-202ENST00000559894 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.53■■■□□ 2
MESP1-202ENST00000559894 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.39■■□□□ 1.97
MESP1-202ENST00000559894 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.96
MESP1-202ENST00000559894 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.24■■□□□ 1.95
MESP1-202ENST00000559894 WIZO95785 1651 aa27.23■■□□□ 1.95
MESP1-202ENST00000559894 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.18■■□□□ 1.94
MESP1-202ENST00000559894 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.16■■□□□ 1.94
MESP1-202ENST00000559894 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
MESP1-202ENST00000559894 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.99■■□□□ 1.91
MESP1-202ENST00000559894 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
MESP1-202ENST00000559894 WDR62O43379 1518 aa26.91■■□□□ 1.9
MESP1-202ENST00000559894 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.9■■□□□ 1.9
MESP1-202ENST00000559894 CFTRP13569 1480 aa26.87■■□□□ 1.89
MESP1-202ENST00000559894 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.87■■□□□ 1.89
MESP1-202ENST00000559894 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
MESP1-202ENST00000559894 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.6■■□□□ 1.85
MESP1-202ENST00000559894 PRDM2Q13029 1718 aa26.57■■□□□ 1.84
MESP1-202ENST00000559894 TRIM41Q8WV44 630 aa26.37■■□□□ 1.81
MESP1-202ENST00000559894 OSCARQ8IYS5 282 aa26.36■■□□□ 1.81
MESP1-202ENST00000559894 IFT140Q96RY7 1462 aa26.36■■□□□ 1.81
MESP1-202ENST00000559894 TOPBP1Q92547 1522 aa26.35■■□□□ 1.81
MESP1-202ENST00000559894 ABCC8Q09428 1581 aa26.32■■□□□ 1.8
MESP1-202ENST00000559894 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
MESP1-202ENST00000559894 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.27■■□□□ 1.8
MESP1-202ENST00000559894 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
MESP1-202ENST00000559894 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
MESP1-202ENST00000559894 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
MESP1-202ENST00000559894 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.76
MESP1-202ENST00000559894 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.01■■□□□ 1.75
MESP1-202ENST00000559894 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.01■■□□□ 1.75
MESP1-202ENST00000559894 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.01■■□□□ 1.75
MESP1-202ENST00000559894 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.98■■□□□ 1.75
MESP1-202ENST00000559894 SOGA1O94964 1423 aa25.97■■□□□ 1.75
MESP1-202ENST00000559894 ARHGEF11O15085 1522 aa25.94■■□□□ 1.74
MESP1-202ENST00000559894 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.93■■□□□ 1.74
MESP1-202ENST00000559894 CHD1O14646 1710 aa25.93■■□□□ 1.74
MESP1-202ENST00000559894 CUX1P39880 1505 aa25.9■■□□□ 1.74
MESP1-202ENST00000559894 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
MESP1-202ENST00000559894 FBLN2P98095 1184 aa25.89■■□□□ 1.74
MESP1-202ENST00000559894 WDR97A6NE52 1622 aa25.88■■□□□ 1.73
MESP1-202ENST00000559894 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
MESP1-202ENST00000559894 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.81■■□□□ 1.72
MESP1-202ENST00000559894 GRIN2BQ13224 1484 aa25.75■■□□□ 1.71
MESP1-202ENST00000559894 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
MESP1-202ENST00000559894 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.74■■□□□ 1.71
MESP1-202ENST00000559894 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
MESP1-202ENST00000559894 ARAP1Q96P48 1450 aa25.68■■□□□ 1.7
MESP1-202ENST00000559894 SYNJ2O15056 1496 aa25.66■■□□□ 1.7
MESP1-202ENST00000559894 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.66■■□□□ 1.7
MESP1-202ENST00000559894 SYNJ1O43426 1573 aa25.66■■□□□ 1.7
MESP1-202ENST00000559894 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.65■■□□□ 1.7
MESP1-202ENST00000559894 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.64■■□□□ 1.7
MESP1-202ENST00000559894 PBRM1Q86U86 1689 aa25.63■■□□□ 1.69
MESP1-202ENST00000559894 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
MESP1-202ENST00000559894 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
MESP1-202ENST00000559894 TOP2BQ02880 1626 aa25.51■■□□□ 1.67
MESP1-202ENST00000559894 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.51■■□□□ 1.67
MESP1-202ENST00000559894 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
MESP1-202ENST00000559894 GRIN2AQ12879 1464 aa25.41■■□□□ 1.66
MESP1-202ENST00000559894 ADAMTS12P58397 1594 aa25.41■■□□□ 1.66
MESP1-202ENST00000559894 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.34■■□□□ 1.65
MESP1-202ENST00000559894 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.33■■□□□ 1.65
MESP1-202ENST00000559894 NUP160Q12769 1436 aa25.32■■□□□ 1.64
MESP1-202ENST00000559894 CEP170Q5SW79 1584 aa25.31■■□□□ 1.64
MESP1-202ENST00000559894 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.23■■□□□ 1.63
MESP1-202ENST00000559894 SHROOM2Q13796 1616 aa25.19■■□□□ 1.62
MESP1-202ENST00000559894 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
MESP1-202ENST00000559894 JPH4Q96JJ6 628 aa25.05■■□□□ 1.6
MESP1-202ENST00000559894 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.05■■□□□ 1.6
MESP1-202ENST00000559894 KIF27Q86VH2 1401 aa25.03■■□□□ 1.6
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