RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559876.1

ISG20-208, Transcript of interferon stimulated exonuclease gene 20, human

TSL 3

Gene ISG20, Length 614 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ISG20-208	ENST00000559876	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		43.38	■■■■■ 4.53
ISG20-208	ENST00000559876	ABCC9	O60706	1549 aa		39.31	■■■■□ 3.88
ISG20-208	ENST00000559876	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39	■■■■□ 3.83
ISG20-208	ENST00000559876	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.23	■■■■□ 3.55
ISG20-208	ENST00000559876	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		37.18	■■■■□ 3.54
ISG20-208	ENST00000559876	NACAD	O15069	1562 aa		36.91	■■■■□ 3.5
ISG20-208	ENST00000559876	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		36.62	■■■■□ 3.45
ISG20-208	ENST00000559876	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.55	■■■■□ 3.44
ISG20-208	ENST00000559876	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.48	■■■■□ 3.43
ISG20-208	ENST00000559876	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.33	■■■■□ 3.41
ISG20-208	ENST00000559876	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.28	■■■■□ 3.4
ISG20-208	ENST00000559876	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	35.92	■■■■□ 3.34
ISG20-208	ENST00000559876	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		35.78	■■■■□ 3.32
ISG20-208	ENST00000559876	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.63	■■■■□ 3.29
ISG20-208	ENST00000559876	SCRIB	Q14160	1630 aa		35.57	■■■■□ 3.29
ISG20-208	ENST00000559876	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.5	■■■■□ 3.27
ISG20-208	ENST00000559876	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		35.41	■■■■□ 3.26
ISG20-208	ENST00000559876	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.35	■■■■□ 3.25
ISG20-208	ENST00000559876	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		34.22	■■■■□ 3.07
ISG20-208	ENST00000559876	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.12	■■■■□ 3.05
ISG20-208	ENST00000559876	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.01	■■■■□ 3.03
ISG20-208	ENST00000559876	CUX2	O14529	1486 aa		33.93	■■■■□ 3.02
ISG20-208	ENST00000559876	SMARCA4	P51532	1647 aa		33.9	■■■■□ 3.02
ISG20-208	ENST00000559876	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.88	■■■■□ 3.01
ISG20-208	ENST00000559876	HMGXB3	Q12766	1538 aa		33.84	■■■■□ 3.01
ISG20-208	ENST00000559876	SMARCA2	P51531	1590 aa		33.83	■■■■□ 3.01
ISG20-208	ENST00000559876	NES	P48681	1621 aa		33.74	■■■□□ 2.99
ISG20-208	ENST00000559876	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	33.64	■■■□□ 2.98
ISG20-208	ENST00000559876	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
ISG20-208	ENST00000559876	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		33.57	■■■□□ 2.96
ISG20-208	ENST00000559876	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		33.47	■■■□□ 2.95
ISG20-208	ENST00000559876	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.44	■■■□□ 2.94
ISG20-208	ENST00000559876	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.36	■■■□□ 2.93
ISG20-208	ENST00000559876	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.26	■■■□□ 2.91
ISG20-208	ENST00000559876	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.14	■■■□□ 2.9
ISG20-208	ENST00000559876	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.05	■■■□□ 2.88
ISG20-208	ENST00000559876	WIZ	O95785	1651 aa		33.04	■■■□□ 2.88
ISG20-208	ENST00000559876	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.93	■■■□□ 2.86
ISG20-208	ENST00000559876	WDR62	O43379	1518 aa		32.89	■■■□□ 2.86
ISG20-208	ENST00000559876	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.74	■■■□□ 2.83
ISG20-208	ENST00000559876	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.7	■■■□□ 2.83
ISG20-208	ENST00000559876	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
ISG20-208	ENST00000559876	CFTR	P13569	1480 aa		32.65	■■■□□ 2.82
ISG20-208	ENST00000559876	TRIM41	Q8WV44	630 aa		32.6	■■■□□ 2.81
ISG20-208	ENST00000559876	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	32.57	■■■□□ 2.8
ISG20-208	ENST00000559876	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
ISG20-208	ENST00000559876	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		32.28	■■■□□ 2.76
ISG20-208	ENST00000559876	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.26	■■■□□ 2.76
ISG20-208	ENST00000559876	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		32.22	■■■□□ 2.75
ISG20-208	ENST00000559876	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.16	■■■□□ 2.74
ISG20-208	ENST00000559876	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.08	■■■□□ 2.73
ISG20-208	ENST00000559876	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.06	■■■□□ 2.72
ISG20-208	ENST00000559876	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		32	■■■□□ 2.71
ISG20-208	ENST00000559876	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		32	■■■□□ 2.71
ISG20-208	ENST00000559876	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		32	■■■□□ 2.71
ISG20-208	ENST00000559876	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.93	■■■□□ 2.7
ISG20-208	ENST00000559876	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		31.91	■■■□□ 2.7
ISG20-208	ENST00000559876	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.87	■■■□□ 2.69
ISG20-208	ENST00000559876	ABCC8	Q09428	1581 aa		31.86	■■■□□ 2.69
ISG20-208	ENST00000559876	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
ISG20-208	ENST00000559876	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.79	■■■□□ 2.68
ISG20-208	ENST00000559876	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
ISG20-208	ENST00000559876	CHD1	O14646	1710 aa		31.72	■■■□□ 2.67
ISG20-208	ENST00000559876	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.64	■■■□□ 2.66
ISG20-208	ENST00000559876	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		31.59	■■■□□ 2.65
ISG20-208	ENST00000559876	ARAP1	Q96P48	1450 aa		31.58	■■■□□ 2.65
ISG20-208	ENST00000559876	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.55	■■■□□ 2.64
ISG20-208	ENST00000559876	FBLN2	P98095	1184 aa		31.54	■■■□□ 2.64
ISG20-208	ENST00000559876	SOGA1	O94964	1423 aa		31.53	■■■□□ 2.64
ISG20-208	ENST00000559876	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		31.49	■■■□□ 2.63
ISG20-208	ENST00000559876	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.46	■■■□□ 2.63
ISG20-208	ENST00000559876	CUX1	P39880	1505 aa		31.45	■■■□□ 2.63
ISG20-208	ENST00000559876	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.39	■■■□□ 2.61
ISG20-208	ENST00000559876	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.38	■■■□□ 2.61
ISG20-208	ENST00000559876	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.31	■■■□□ 2.6
ISG20-208	ENST00000559876	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.29	■■■□□ 2.6
ISG20-208	ENST00000559876	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	31.27	■■■□□ 2.6
ISG20-208	ENST00000559876	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.26	■■■□□ 2.59
ISG20-208	ENST00000559876	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.25	■■■□□ 2.59
ISG20-208	ENST00000559876	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.23	■■■□□ 2.59
ISG20-208	ENST00000559876	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.17	■■■□□ 2.58
ISG20-208	ENST00000559876	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.14	■■■□□ 2.58
ISG20-208	ENST00000559876	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.11	■■■□□ 2.57
ISG20-208	ENST00000559876	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.1	■■■□□ 2.57
ISG20-208	ENST00000559876	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	30.94	■■■□□ 2.54
ISG20-208	ENST00000559876	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		30.93	■■■□□ 2.54
ISG20-208	ENST00000559876	GRIN2A	Q12879	1464 aa		30.91	■■■□□ 2.54
ISG20-208	ENST00000559876	ADAMTS12	P58397	1594 aa		30.89	■■■□□ 2.54
ISG20-208	ENST00000559876	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	30.88	■■■□□ 2.53
ISG20-208	ENST00000559876	CEP170	Q5SW79	1584 aa		30.86	■■■□□ 2.53
ISG20-208	ENST00000559876	NUP160	Q12769	1436 aa		30.84	■■■□□ 2.53
ISG20-208	ENST00000559876	TOP2B	Q02880	1626 aa		30.84	■■■□□ 2.53
ISG20-208	ENST00000559876	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		30.84	■■■□□ 2.53
ISG20-208	ENST00000559876	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.74	■■■□□ 2.51
ISG20-208	ENST00000559876	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		30.73	■■■□□ 2.51
ISG20-208	ENST00000559876	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		30.68	■■■□□ 2.5
ISG20-208	ENST00000559876	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	30.53	■■■□□ 2.48
ISG20-208	ENST00000559876	AEBP2	Q6ZN18	517 aa	Predicted RBP	30.5	■■■□□ 2.47
ISG20-208	ENST00000559876	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.47	■■■□□ 2.47
ISG20-208	ENST00000559876	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		30.46	■■■□□ 2.47

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