RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559817.1

C15orf59-203, Transcript of UPF0583 protein C15orf59, humanhuman

TSL 3

Gene C15orf59, Length 779 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf59-203ENST00000559817 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.09■■■■■ 4.01
C15orf59-203ENST00000559817 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.01■■■■□ 3.35
C15orf59-203ENST00000559817 ABCC9O60706 1549 aa35.59■■■■□ 3.29
C15orf59-203ENST00000559817 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.1■■■■□ 3.05
C15orf59-203ENST00000559817 NACADO15069 1562 aa33.92■■■■□ 3.02
C15orf59-203ENST00000559817 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.58■■■□□ 2.97
C15orf59-203ENST00000559817 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.47■■■□□ 2.95
C15orf59-203ENST00000559817 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.33■■■□□ 2.93
C15orf59-203ENST00000559817 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.32■■■□□ 2.92
C15orf59-203ENST00000559817 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.22■■■□□ 2.91
C15orf59-203ENST00000559817 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.08■■■□□ 2.89
C15orf59-203ENST00000559817 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.07■■■□□ 2.88
C15orf59-203ENST00000559817 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.06■■■□□ 2.88
C15orf59-203ENST00000559817 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.79■■■□□ 2.84
C15orf59-203ENST00000559817 SCRIBQ14160 1630 aa32.7■■■□□ 2.83
C15orf59-203ENST00000559817 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
C15orf59-203ENST00000559817 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.23■■■□□ 2.75
C15orf59-203ENST00000559817 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.07■■■□□ 2.72
C15orf59-203ENST00000559817 SMARCA4P51532 1647 aa31.26■■■□□ 2.59
C15orf59-203ENST00000559817 NCAPD3P42695 1498 aa31.26■■■□□ 2.59
C15orf59-203ENST00000559817 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.19■■■□□ 2.58
C15orf59-203ENST00000559817 SMARCA2P51531 1590 aa31.17■■■□□ 2.58
C15orf59-203ENST00000559817 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
C15orf59-203ENST00000559817 HMGXB3Q12766 1538 aa31.14■■■□□ 2.57
C15orf59-203ENST00000559817 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.01■■■□□ 2.56
C15orf59-203ENST00000559817 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.91■■■□□ 2.54
C15orf59-203ENST00000559817 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.86■■■□□ 2.53
C15orf59-203ENST00000559817 ERCC6Q03468 1493 aa30.75■■■□□ 2.51
C15orf59-203ENST00000559817 CUX2O14529 1486 aa30.7■■■□□ 2.5
C15orf59-203ENST00000559817 NESP48681 1621 aa30.64■■■□□ 2.5
C15orf59-203ENST00000559817 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.58■■■□□ 2.49
C15orf59-203ENST00000559817 WIZO95785 1651 aa30.51■■■□□ 2.47
C15orf59-203ENST00000559817 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.42■■■□□ 2.46
C15orf59-203ENST00000559817 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.35■■■□□ 2.45
C15orf59-203ENST00000559817 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.32■■■□□ 2.44
C15orf59-203ENST00000559817 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
C15orf59-203ENST00000559817 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.28■■■□□ 2.44
C15orf59-203ENST00000559817 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.27■■■□□ 2.44
C15orf59-203ENST00000559817 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
C15orf59-203ENST00000559817 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.08■■■□□ 2.41
C15orf59-203ENST00000559817 WDR62O43379 1518 aa30.04■■■□□ 2.4
C15orf59-203ENST00000559817 CFTRP13569 1480 aa30.03■■■□□ 2.4
C15orf59-203ENST00000559817 CEP164Q9UPV0 1460 aa30■■■□□ 2.39
C15orf59-203ENST00000559817 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.97■■■□□ 2.39
C15orf59-203ENST00000559817 PRDM2Q13029 1718 aa29.87■■■□□ 2.37
C15orf59-203ENST00000559817 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.76■■■□□ 2.35
C15orf59-203ENST00000559817 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.71■■■□□ 2.35
C15orf59-203ENST00000559817 TOPBP1Q92547 1522 aa29.44■■■□□ 2.3
C15orf59-203ENST00000559817 ABCC8Q09428 1581 aa29.41■■■□□ 2.3
C15orf59-203ENST00000559817 IFT140Q96RY7 1462 aa29.4■■■□□ 2.3
C15orf59-203ENST00000559817 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.39■■■□□ 2.29
C15orf59-203ENST00000559817 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
C15orf59-203ENST00000559817 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
C15orf59-203ENST00000559817 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
C15orf59-203ENST00000559817 OSCARQ8IYS5 282 aa29.17■■■□□ 2.26
C15orf59-203ENST00000559817 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
C15orf59-203ENST00000559817 WDR97A6NE52 1622 aa29.01■■■□□ 2.23
C15orf59-203ENST00000559817 CUX1P39880 1505 aa29■■■□□ 2.23
C15orf59-203ENST00000559817 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.99■■■□□ 2.23
C15orf59-203ENST00000559817 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.99■■■□□ 2.23
C15orf59-203ENST00000559817 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.97■■■□□ 2.23
C15orf59-203ENST00000559817 TRIM41Q8WV44 630 aa28.96■■■□□ 2.23
C15orf59-203ENST00000559817 SOGA1O94964 1423 aa28.94■■■□□ 2.22
C15orf59-203ENST00000559817 CHD1O14646 1710 aa28.94■■■□□ 2.22
C15orf59-203ENST00000559817 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
C15orf59-203ENST00000559817 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
C15orf59-203ENST00000559817 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
C15orf59-203ENST00000559817 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.9■■■□□ 2.22
C15orf59-203ENST00000559817 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.83■■■□□ 2.21
C15orf59-203ENST00000559817 ARHGEF11O15085 1522 aa28.83■■■□□ 2.21
C15orf59-203ENST00000559817 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.78■■■□□ 2.2
C15orf59-203ENST00000559817 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.76■■■□□ 2.19
C15orf59-203ENST00000559817 GRIN2BQ13224 1484 aa28.74■■■□□ 2.19
C15orf59-203ENST00000559817 PBRM1Q86U86 1689 aa28.71■■■□□ 2.19
C15orf59-203ENST00000559817 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.71■■■□□ 2.19
C15orf59-203ENST00000559817 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.69■■■□□ 2.18
C15orf59-203ENST00000559817 FBLN2P98095 1184 aa28.67■■■□□ 2.18
C15orf59-203ENST00000559817 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.67■■■□□ 2.18
C15orf59-203ENST00000559817 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.65■■■□□ 2.18
C15orf59-203ENST00000559817 TOP2BQ02880 1626 aa28.65■■■□□ 2.18
C15orf59-203ENST00000559817 SYNJ2O15056 1496 aa28.64■■■□□ 2.17
C15orf59-203ENST00000559817 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.64■■■□□ 2.17
C15orf59-203ENST00000559817 SYNJ1O43426 1573 aa28.62■■■□□ 2.17
C15orf59-203ENST00000559817 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.59■■■□□ 2.17
C15orf59-203ENST00000559817 ARAP1Q96P48 1450 aa28.55■■■□□ 2.16
C15orf59-203ENST00000559817 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.55■■■□□ 2.16
C15orf59-203ENST00000559817 ADAMTS12P58397 1594 aa28.45■■■□□ 2.15
C15orf59-203ENST00000559817 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.42■■■□□ 2.14
C15orf59-203ENST00000559817 GRIN2AQ12879 1464 aa28.39■■■□□ 2.13
C15orf59-203ENST00000559817 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.38■■■□□ 2.13
C15orf59-203ENST00000559817 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.31■■■□□ 2.12
C15orf59-203ENST00000559817 NUP160Q12769 1436 aa28.29■■■□□ 2.12
C15orf59-203ENST00000559817 CEP170Q5SW79 1584 aa28.28■■■□□ 2.12
C15orf59-203ENST00000559817 SHROOM2Q13796 1616 aa28.2■■■□□ 2.1
C15orf59-203ENST00000559817 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.11■■■□□ 2.09
C15orf59-203ENST00000559817 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.06■■■□□ 2.08
C15orf59-203ENST00000559817 CUL7Q14999 1698 aa28.03■■■□□ 2.08
C15orf59-203ENST00000559817 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
C15orf59-203ENST00000559817 KIF27Q86VH2 1401 aa28.02■■■□□ 2.08
C15orf59-203ENST00000559817 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
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