RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559578.1

PBX1-217, Transcript of PBX homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PBX1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX1-217ENST00000559578 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.98■■■■■ 7.19
PBX1-217ENST00000559578 ABCC9O60706 1549 aa53.91■■■■■ 6.22
PBX1-217ENST00000559578 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.87■■■■■ 6.21
PBX1-217ENST00000559578 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51.32■■■■■ 5.81
PBX1-217ENST00000559578 NACADO15069 1562 aa50.95■■■■■ 5.75
PBX1-217ENST00000559578 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.71■■■■■ 5.71
PBX1-217ENST00000559578 DNAJC5BQ9UF47 199 aa50.59■■■■■ 5.69
PBX1-217ENST00000559578 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.23■■■■■ 5.63
PBX1-217ENST00000559578 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP50.18■■■■■ 5.62
PBX1-217ENST00000559578 UNC13AQ9UPW8 1703 aa50.12■■■■■ 5.61
PBX1-217ENST00000559578 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.77■■■■■ 5.56
PBX1-217ENST00000559578 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.69■■■■■ 5.54
PBX1-217ENST00000559578 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.55■■■■■ 5.52
PBX1-217ENST00000559578 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.16■■■■■ 5.46
PBX1-217ENST00000559578 SCRIBQ14160 1630 aa49.06■■■■■ 5.44
PBX1-217ENST00000559578 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.7■■■■■ 5.39
PBX1-217ENST00000559578 CECR2Q9BXF3 1484 aa48.59■■■■■ 5.37
PBX1-217ENST00000559578 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.59■■■■■ 5.37
PBX1-217ENST00000559578 NCAPD3P42695 1498 aa47.02■■■■■ 5.12
PBX1-217ENST00000559578 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.86■■■■■ 5.09
PBX1-217ENST00000559578 SMARCA4P51532 1647 aa46.8■■■■■ 5.08
PBX1-217ENST00000559578 SMARCA2P51531 1590 aa46.77■■■■■ 5.08
PBX1-217ENST00000559578 HMGXB3Q12766 1538 aa46.67■■■■■ 5.06
PBX1-217ENST00000559578 ERCC6Q03468 1493 aa46.6■■■■■ 5.05
PBX1-217ENST00000559578 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.59■■■■■ 5.05
PBX1-217ENST00000559578 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa46.56■■■■■ 5.04
PBX1-217ENST00000559578 CUX2O14529 1486 aa46.51■■■■■ 5.04
PBX1-217ENST00000559578 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.44■■■■■ 5.02
PBX1-217ENST00000559578 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.35■■■■■ 5.01
PBX1-217ENST00000559578 NESP48681 1621 aa46.28■■■■■ 5
PBX1-217ENST00000559578 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.19■■■■■ 4.99
PBX1-217ENST00000559578 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.99■■■■■ 4.95
PBX1-217ENST00000559578 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.83■■■■■ 4.93
PBX1-217ENST00000559578 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.75■■■■■ 4.91
PBX1-217ENST00000559578 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.7■■■■■ 4.91
PBX1-217ENST00000559578 WIZO95785 1651 aa45.65■■■■■ 4.9
PBX1-217ENST00000559578 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.6■■■■■ 4.89
PBX1-217ENST00000559578 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.33■■■■■ 4.85
PBX1-217ENST00000559578 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.23■■■■■ 4.83
PBX1-217ENST00000559578 WDR62O43379 1518 aa45.21■■■■■ 4.83
PBX1-217ENST00000559578 CEP164Q9UPV0 1460 aa45.14■■■■■ 4.82
PBX1-217ENST00000559578 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP45.08■■■■■ 4.81
PBX1-217ENST00000559578 FANCD2Q9BXW9 1451 aa45.08■■■■■ 4.81
PBX1-217ENST00000559578 CFTRP13569 1480 aa45.06■■■■■ 4.8
PBX1-217ENST00000559578 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.69■■■■■ 4.74
PBX1-217ENST00000559578 PRDM2Q13029 1718 aa44.63■■■■■ 4.73
PBX1-217ENST00000559578 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.57■■■■■ 4.73
PBX1-217ENST00000559578 TRIM41Q8WV44 630 aa44.5■■■■■ 4.71
PBX1-217ENST00000559578 OSCARQ8IYS5 282 aa44.42■■■■■ 4.7
PBX1-217ENST00000559578 IFT140Q96RY7 1462 aa44.25■■■■■ 4.67
PBX1-217ENST00000559578 TOPBP1Q92547 1522 aa44.21■■■■■ 4.67
PBX1-217ENST00000559578 ABCC8Q09428 1581 aa44.16■■■■■ 4.66
PBX1-217ENST00000559578 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP44.14■■■■■ 4.66
PBX1-217ENST00000559578 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.05■■■■■ 4.64
PBX1-217ENST00000559578 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.92■■■■■ 4.62
PBX1-217ENST00000559578 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.81■■■■■ 4.6
PBX1-217ENST00000559578 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.8■■■■■ 4.6
PBX1-217ENST00000559578 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.8■■■■■ 4.6
PBX1-217ENST00000559578 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.8■■■■■ 4.6
PBX1-217ENST00000559578 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.76■■■■■ 4.6
PBX1-217ENST00000559578 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.75■■■■■ 4.59
PBX1-217ENST00000559578 ARHGEF11O15085 1522 aa43.65■■■■■ 4.58
PBX1-217ENST00000559578 CHD1O14646 1710 aa43.61■■■■■ 4.57
PBX1-217ENST00000559578 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.58■■■■■ 4.57
PBX1-217ENST00000559578 SOGA1O94964 1423 aa43.57■■■■■ 4.57
PBX1-217ENST00000559578 FBLN2P98095 1184 aa43.53■■■■■ 4.56
PBX1-217ENST00000559578 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.49■■■■■ 4.55
PBX1-217ENST00000559578 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.48■■■■■ 4.55
PBX1-217ENST00000559578 CUX1P39880 1505 aa43.41■■■■■ 4.54
PBX1-217ENST00000559578 WDR97A6NE52 1622 aa43.4■■■■■ 4.54
PBX1-217ENST00000559578 CYB5RLQ6IPT4 315 aa43.36■■■■■ 4.53
PBX1-217ENST00000559578 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.31■■■■■ 4.52
PBX1-217ENST00000559578 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
PBX1-217ENST00000559578 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.22■■■■■ 4.51
PBX1-217ENST00000559578 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
PBX1-217ENST00000559578 GRIN2BQ13224 1484 aa43.2■■■■■ 4.51
PBX1-217ENST00000559578 ARAP1Q96P48 1450 aa43.2■■■■■ 4.51
PBX1-217ENST00000559578 SYNJ1O43426 1573 aa43.11■■■■■ 4.49
PBX1-217ENST00000559578 CLASP1Q7Z460 1538 aa43.09■■■■■ 4.49
PBX1-217ENST00000559578 SYNJ2O15056 1496 aa43.07■■■■■ 4.49
PBX1-217ENST00000559578 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.05■■■■■ 4.48
PBX1-217ENST00000559578 PBRM1Q86U86 1689 aa43.02■■■■■ 4.48
PBX1-217ENST00000559578 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.98■■■■■ 4.47
PBX1-217ENST00000559578 TRHP20396 242 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
PBX1-217ENST00000559578 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.91■■■■■ 4.46
PBX1-217ENST00000559578 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.82■■■■■ 4.459e-6■■■■■ 50.1
PBX1-217ENST00000559578 TOP2BQ02880 1626 aa42.72■■■■■ 4.43
PBX1-217ENST00000559578 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.71■■■■■ 4.43
PBX1-217ENST00000559578 GRIN2AQ12879 1464 aa42.64■■■■■ 4.42
PBX1-217ENST00000559578 ADAMTS12P58397 1594 aa42.6■■■■■ 4.41
PBX1-217ENST00000559578 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.5■■■■■ 4.39
PBX1-217ENST00000559578 NUP160Q12769 1436 aa42.49■■■■■ 4.39
PBX1-217ENST00000559578 CEP170Q5SW79 1584 aa42.47■■■■■ 4.39
PBX1-217ENST00000559578 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.46■■■■■ 4.39
PBX1-217ENST00000559578 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.39■■■■■ 4.38
PBX1-217ENST00000559578 SHROOM2Q13796 1616 aa42.31■■■■■ 4.36
PBX1-217ENST00000559578 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP42.11■■■■■ 4.33
PBX1-217ENST00000559578 JPH4Q96JJ6 628 aa42.08■■■■■ 4.33
PBX1-217ENST00000559578 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42■■■■■ 4.31
PBX1-217ENST00000559578 KIF27Q86VH2 1401 aa41.92■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms