RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559381.5

PLCB2-208, Transcript of phospholipase C beta 2, humanhuman

TSL 2

Gene PLCB2, Length 1,641 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB2-208ENST00000559381 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60■■■■■ 7.2
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PLCB2-208ENST00000559381 NACADO15069 1562 aa49.46■■■■■ 5.51
PLCB2-208ENST00000559381 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa49.26■■■■■ 5.48
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PLCB2-208ENST00000559381 SMARCA2P51531 1590 aa45.83■■■■■ 4.93
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PLCB2-208ENST00000559381 WIZO95785 1651 aa45.81■■■■■ 4.92
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PLCB2-208ENST00000559381 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa44.25■■■■■ 4.67
PLCB2-208ENST00000559381 NESP48681 1621 aa44.2■■■■■ 4.67
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PLCB2-208ENST00000559381 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.97■■■■■ 4.63
PLCB2-208ENST00000559381 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.87■■■■■ 4.61
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PLCB2-208ENST00000559381 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.69■■■■■ 4.58
PLCB2-208ENST00000559381 ABCC8Q09428 1581 aa43.55■■■■■ 4.56
PLCB2-208ENST00000559381 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
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PLCB2-208ENST00000559381 CHIC1Q5VXU3 224 aa43.4■■■■■ 4.54
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PLCB2-208ENST00000559381 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
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PLCB2-208ENST00000559381 TRIM41Q8WV44 630 aa43.3■■■■■ 4.52
PLCB2-208ENST00000559381 SYNJ1O43426 1573 aa43.27■■■■■ 4.52
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PLCB2-208ENST00000559381 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
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PLCB2-208ENST00000559381 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.2■■■■■ 4.51
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PLCB2-208ENST00000559381 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa42.79■■■■■ 4.44
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PLCB2-208ENST00000559381 WDR97A6NE52 1622 aa42.56■■■■■ 4.4
PLCB2-208ENST00000559381 KIF27Q86VH2 1401 aa42.53■■■■■ 4.4
PLCB2-208ENST00000559381 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.49■■■■■ 4.39
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PLCB2-208ENST00000559381 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.36■■■■■ 4.37
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PLCB2-208ENST00000559381 FBLN2P98095 1184 aa41.76■■■■■ 4.28
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PLCB2-208ENST00000559381 GOLGA3Q08378 1498 aa41.73■■■■■ 4.27
PLCB2-208ENST00000559381 GRIN2AQ12879 1464 aa41.66■■■■■ 4.26
PLCB2-208ENST00000559381 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.66■■■■■ 4.26
PLCB2-208ENST00000559381 UBTFP17480 764 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
PLCB2-208ENST00000559381 CHD1O14646 1710 aa41.57■■■■■ 4.25
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PLCB2-208ENST00000559381 TNIKQ9UKE5 1360 aa41.41■■■■■ 4.22
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