RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559277.1

TMC3-AS1-202, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 479 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.46■■■□□ 2.47
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCC9O60706 1549 aa28.49■■■□□ 2.15
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.65■■■□□ 2.02
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.58■■■□□ 2.01
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.68■■□□□ 1.86
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.41■■□□□ 1.82
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NACADO15069 1562 aa26.31■■□□□ 1.8
TMC3-AS1-202ENST00000559277 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.25■■□□□ 1.79
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.1■■□□□ 1.77
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.98■■□□□ 1.75
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.79■■□□□ 1.72
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CECR2Q9BXF3 1484 aa25.72■■□□□ 1.71
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.71■■□□□ 1.71
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.68■■□□□ 1.7
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.46■■□□□ 1.67
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SCRIBQ14160 1630 aa25.19■■□□□ 1.62
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.07■■□□□ 1.6
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.07■■□□□ 1.6
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CUX2O14529 1486 aa24.82■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ERCC6Q03468 1493 aa24.55■■□□□ 1.52
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NCAPD3P42695 1498 aa24.34■■□□□ 1.49
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NESP48681 1621 aa24.31■■□□□ 1.48
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TRIM41Q8WV44 630 aa24.28■■□□□ 1.48
TMC3-AS1-202ENST00000559277 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.17■■□□□ 1.46
TMC3-AS1-202ENST00000559277 HMGXB3Q12766 1538 aa24.06■■□□□ 1.44
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SMARCA2P51531 1590 aa23.98■■□□□ 1.43
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.95■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SMARCA4P51532 1647 aa23.95■■□□□ 1.42
TMC3-AS1-202ENST00000559277 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.89■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.73■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.71■■□□□ 1.39
TMC3-AS1-202ENST00000559277 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WDR62O43379 1518 aa23.64■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.62■■□□□ 1.37
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.54■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-202ENST00000559277 OSCARQ8IYS5 282 aa23.53■■□□□ 1.36
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.51■■□□□ 1.35
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.42■■□□□ 1.34
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.35■■□□□ 1.33
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.28■■□□□ 1.32
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARHGEF11O15085 1522 aa23.23■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-202ENST00000559277 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WIZO95785 1651 aa23.2■■□□□ 1.3
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CFTRP13569 1480 aa23.12■■□□□ 1.29
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.08■■□□□ 1.29
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ARAP1Q96P48 1450 aa22.98■■□□□ 1.27
TMC3-AS1-202ENST00000559277 IFT140Q96RY7 1462 aa22.91■■□□□ 1.26
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CHD1O14646 1710 aa22.87■■□□□ 1.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PRDM2Q13029 1718 aa22.84■■□□□ 1.25
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TOPBP1Q92547 1522 aa22.77■■□□□ 1.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.74■■□□□ 1.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.73■■□□□ 1.23
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FBLN2P98095 1184 aa22.64■■□□□ 1.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.59■■□□□ 1.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.58■■□□□ 1.21
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.56■■□□□ 1.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCC8Q09428 1581 aa22.55■■□□□ 1.2
TMC3-AS1-202ENST00000559277 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.44■■□□□ 1.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SYNJ1O43426 1573 aa22.39■■□□□ 1.18
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.34■■□□□ 1.17
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SOGA1O94964 1423 aa22.33■■□□□ 1.17
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
TMC3-AS1-202ENST00000559277 WDR97A6NE52 1622 aa22.26■■□□□ 1.15
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SYNJ2O15056 1496 aa22.25■■□□□ 1.15
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.25■■□□□ 1.15
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.23■■□□□ 1.15
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GRIN2BQ13224 1484 aa22.22■■□□□ 1.15
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.17■■□□□ 1.14
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PBRM1Q86U86 1689 aa22.14■■□□□ 1.14
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CUX1P39880 1505 aa22.12■■□□□ 1.13
TMC3-AS1-202ENST00000559277 CEP170Q5SW79 1584 aa22.04■■□□□ 1.12
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.03■■□□□ 1.12
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22■■□□□ 1.11
TMC3-AS1-202ENST00000559277 SHROOM2Q13796 1616 aa21.97■■□□□ 1.11
TMC3-AS1-202ENST00000559277 GRIN2AQ12879 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
TMC3-AS1-202ENST00000559277 NUP160Q12769 1436 aa21.94■■□□□ 1.1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.91■■□□□ 1.1
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ADAMTS12P58397 1594 aa21.87■■□□□ 1.09
TMC3-AS1-202ENST00000559277 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.86■■□□□ 1.09
TMC3-AS1-202ENST00000559277 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.84■■□□□ 1.09
TMC3-AS1-202ENST00000559277 DIP2BQ9P265 1576 aa21.81■■□□□ 1.08
TMC3-AS1-202ENST00000559277 KDM6BO15054 1643 aa21.8■■□□□ 1.08
TMC3-AS1-202ENST00000559277 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
TMC3-AS1-202ENST00000559277 MAPKBP1O60336 1514 aa21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76 ms