RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559197.5

CPNE6-211, Transcript of copine 6, humanhuman

TSL 4

Gene CPNE6, Length 573 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6-211ENST00000559197 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.83■■■■■ 4.29
CPNE6-211ENST00000559197 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.39■■■■□ 3.58
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CPNE6-211ENST00000559197 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.47■■■■□ 3.27
CPNE6-211ENST00000559197 NACADO15069 1562 aa35.31■■■■□ 3.24
CPNE6-211ENST00000559197 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.1■■■■□ 3.21
CPNE6-211ENST00000559197 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.98■■■■□ 3.19
CPNE6-211ENST00000559197 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
CPNE6-211ENST00000559197 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.62■■■■□ 3.13
CPNE6-211ENST00000559197 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.56■■■■□ 3.12
CPNE6-211ENST00000559197 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.52■■■■□ 3.12
CPNE6-211ENST00000559197 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.5■■■■□ 3.11
CPNE6-211ENST00000559197 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.39■■■■□ 3.1
CPNE6-211ENST00000559197 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.08■■■■□ 3.05
CPNE6-211ENST00000559197 SCRIBQ14160 1630 aa34.05■■■■□ 3.04
CPNE6-211ENST00000559197 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
CPNE6-211ENST00000559197 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.5■■■□□ 2.95
CPNE6-211ENST00000559197 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.41■■■□□ 2.94
CPNE6-211ENST00000559197 NCAPD3P42695 1498 aa32.61■■■□□ 2.81
CPNE6-211ENST00000559197 SMARCA4P51532 1647 aa32.54■■■□□ 2.8
CPNE6-211ENST00000559197 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.53■■■□□ 2.8
CPNE6-211ENST00000559197 SMARCA2P51531 1590 aa32.47■■■□□ 2.79
CPNE6-211ENST00000559197 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
CPNE6-211ENST00000559197 HMGXB3Q12766 1538 aa32.39■■■□□ 2.78
CPNE6-211ENST00000559197 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.28■■■□□ 2.76
CPNE6-211ENST00000559197 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CPNE6-211ENST00000559197 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.2■■■□□ 2.75
CPNE6-211ENST00000559197 ERCC6Q03468 1493 aa32.03■■■□□ 2.72
CPNE6-211ENST00000559197 NESP48681 1621 aa31.93■■■□□ 2.7
CPNE6-211ENST00000559197 CUX2O14529 1486 aa31.91■■■□□ 2.7
CPNE6-211ENST00000559197 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.81■■■□□ 2.68
CPNE6-211ENST00000559197 WIZO95785 1651 aa31.79■■■□□ 2.68
CPNE6-211ENST00000559197 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.67■■■□□ 2.66
CPNE6-211ENST00000559197 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.64■■■□□ 2.66
CPNE6-211ENST00000559197 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.62■■■□□ 2.65
CPNE6-211ENST00000559197 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.56■■■□□ 2.64
CPNE6-211ENST00000559197 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.52■■■□□ 2.64
CPNE6-211ENST00000559197 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
CPNE6-211ENST00000559197 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.48■■■□□ 2.63
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CPNE6-211ENST00000559197 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.33■■■□□ 2.61
CPNE6-211ENST00000559197 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.26■■■□□ 2.59
CPNE6-211ENST00000559197 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.25■■■□□ 2.59
CPNE6-211ENST00000559197 WDR62O43379 1518 aa31.24■■■□□ 2.59
CPNE6-211ENST00000559197 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.1■■■□□ 2.57
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CPNE6-211ENST00000559197 PRDM2Q13029 1718 aa30.93■■■□□ 2.54
CPNE6-211ENST00000559197 TOPBP1Q92547 1522 aa30.68■■■□□ 2.5
CPNE6-211ENST00000559197 ABCC8Q09428 1581 aa30.67■■■□□ 2.5
CPNE6-211ENST00000559197 IFT140Q96RY7 1462 aa30.64■■■□□ 2.5
CPNE6-211ENST00000559197 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.6■■■□□ 2.49
CPNE6-211ENST00000559197 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.52■■■□□ 2.48
CPNE6-211ENST00000559197 OSCARQ8IYS5 282 aa30.47■■■□□ 2.47
CPNE6-211ENST00000559197 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
CPNE6-211ENST00000559197 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.39■■■□□ 2.46
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CPNE6-211ENST00000559197 TRIM41Q8WV44 630 aa30.2■■■□□ 2.43
CPNE6-211ENST00000559197 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.15■■■□□ 2.42
CPNE6-211ENST00000559197 WDR97A6NE52 1622 aa30.14■■■□□ 2.42
CPNE6-211ENST00000559197 FBLN2P98095 1184 aa30.01■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 CHD1O14646 1710 aa30.01■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.99■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.99■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.99■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.99■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 GRIN2BQ13224 1484 aa29.98■■■□□ 2.39
CPNE6-211ENST00000559197 ARHGEF11O15085 1522 aa29.97■■■□□ 2.39
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CPNE6-211ENST00000559197 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.87■■■□□ 2.37
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CPNE6-211ENST00000559197 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.84■■■□□ 2.37
CPNE6-211ENST00000559197 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.83■■■□□ 2.37
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CPNE6-211ENST00000559197 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.77■■■□□ 2.36
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CPNE6-211ENST00000559197 NUP160Q12769 1436 aa29.49■■■□□ 2.31
CPNE6-211ENST00000559197 CEP170Q5SW79 1584 aa29.44■■■□□ 2.3
CPNE6-211ENST00000559197 KIF27Q86VH2 1401 aa29.31■■■□□ 2.28
CPNE6-211ENST00000559197 SHROOM2Q13796 1616 aa29.3■■■□□ 2.28
CPNE6-211ENST00000559197 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.27■■■□□ 2.28
CPNE6-211ENST00000559197 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
CPNE6-211ENST00000559197 IGF1RP08069 1367 aa29.25■■■□□ 2.27
CPNE6-211ENST00000559197 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.18■■■□□ 2.26
CPNE6-211ENST00000559197 CUL7Q14999 1698 aa29.17■■■□□ 2.26
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