RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559129.1

MEIS2-212, Transcript of Meis homeobox 2, humanhuman

TSL 4

Gene MEIS2, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS2-212ENST00000559129 NISCHQ9Y2I1 1504 aa36.05■■■■□ 3.36
MEIS2-212ENST00000559129 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.3■■■□□ 2.76
MEIS2-212ENST00000559129 ABCC9O60706 1549 aa31.9■■■□□ 2.7
MEIS2-212ENST00000559129 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.56■■■□□ 2.48
MEIS2-212ENST00000559129 NACADO15069 1562 aa30.43■■■□□ 2.46
MEIS2-212ENST00000559129 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.14■■■□□ 2.42
MEIS2-212ENST00000559129 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.11■■■□□ 2.41
MEIS2-212ENST00000559129 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
MEIS2-212ENST00000559129 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS2-212ENST00000559129 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.86■■■□□ 2.37
MEIS2-212ENST00000559129 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.68■■■□□ 2.34
MEIS2-212ENST00000559129 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.67■■■□□ 2.34
MEIS2-212ENST00000559129 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.63■■■□□ 2.33
MEIS2-212ENST00000559129 SCRIBQ14160 1630 aa29.37■■■□□ 2.29
MEIS2-212ENST00000559129 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.35■■■□□ 2.29
MEIS2-212ENST00000559129 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
MEIS2-212ENST00000559129 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.89■■■□□ 2.22
MEIS2-212ENST00000559129 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.72■■■□□ 2.19
MEIS2-212ENST00000559129 SMARCA4P51532 1647 aa28.08■■■□□ 2.09
MEIS2-212ENST00000559129 NCAPD3P42695 1498 aa28.06■■■□□ 2.08
MEIS2-212ENST00000559129 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.02■■■□□ 2.08
MEIS2-212ENST00000559129 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
MEIS2-212ENST00000559129 SMARCA2P51531 1590 aa27.97■■■□□ 2.07
MEIS2-212ENST00000559129 HMGXB3Q12766 1538 aa27.92■■■□□ 2.06
MEIS2-212ENST00000559129 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.85■■■□□ 2.05
MEIS2-212ENST00000559129 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.77■■■□□ 2.04
MEIS2-212ENST00000559129 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.75■■■□□ 2.03
MEIS2-212ENST00000559129 ERCC6Q03468 1493 aa27.51■■■□□ 2
MEIS2-212ENST00000559129 NESP48681 1621 aa27.49■■□□□ 1.99
MEIS2-212ENST00000559129 WIZO95785 1651 aa27.46■■□□□ 1.99
MEIS2-212ENST00000559129 CUX2O14529 1486 aa27.44■■□□□ 1.98
MEIS2-212ENST00000559129 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.41■■□□□ 1.98
MEIS2-212ENST00000559129 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
MEIS2-212ENST00000559129 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
MEIS2-212ENST00000559129 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.21■■□□□ 1.95
MEIS2-212ENST00000559129 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.19■■□□□ 1.94
MEIS2-212ENST00000559129 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.18■■□□□ 1.94
MEIS2-212ENST00000559129 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
MEIS2-212ENST00000559129 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.02■■□□□ 1.92
MEIS2-212ENST00000559129 CFTRP13569 1480 aa26.98■■□□□ 1.91
MEIS2-212ENST00000559129 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.96■■□□□ 1.91
MEIS2-212ENST00000559129 WDR62O43379 1518 aa26.92■■□□□ 1.9
MEIS2-212ENST00000559129 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.91■■□□□ 1.9
MEIS2-212ENST00000559129 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.89■■□□□ 1.9
MEIS2-212ENST00000559129 PRDM2Q13029 1718 aa26.82■■□□□ 1.88
MEIS2-212ENST00000559129 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.8■■□□□ 1.88
MEIS2-212ENST00000559129 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.67■■□□□ 1.86
MEIS2-212ENST00000559129 TOPBP1Q92547 1522 aa26.44■■□□□ 1.82
MEIS2-212ENST00000559129 ABCC8Q09428 1581 aa26.4■■□□□ 1.82
MEIS2-212ENST00000559129 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.38■■□□□ 1.81
MEIS2-212ENST00000559129 IFT140Q96RY7 1462 aa26.36■■□□□ 1.81
MEIS2-212ENST00000559129 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
MEIS2-212ENST00000559129 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
MEIS2-212ENST00000559129 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
MEIS2-212ENST00000559129 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
MEIS2-212ENST00000559129 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
MEIS2-212ENST00000559129 OSCARQ8IYS5 282 aa26.13■■□□□ 1.77
MEIS2-212ENST00000559129 CUX1P39880 1505 aa26.09■■□□□ 1.77
MEIS2-212ENST00000559129 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.05■■□□□ 1.76
MEIS2-212ENST00000559129 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.04■■□□□ 1.76
MEIS2-212ENST00000559129 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP26.04■■□□□ 1.76
MEIS2-212ENST00000559129 SOGA1O94964 1423 aa26.02■■□□□ 1.76
MEIS2-212ENST00000559129 WDR97A6NE52 1622 aa26■■□□□ 1.75
MEIS2-212ENST00000559129 CHD1O14646 1710 aa25.95■■□□□ 1.74
MEIS2-212ENST00000559129 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MEIS2-212ENST00000559129 TRIM41Q8WV44 630 aa25.88■■□□□ 1.73
MEIS2-212ENST00000559129 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.85■■□□□ 1.73
MEIS2-212ENST00000559129 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.85■■□□□ 1.73
MEIS2-212ENST00000559129 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.85■■□□□ 1.73
MEIS2-212ENST00000559129 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.82■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 GRIN2BQ13224 1484 aa25.79■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 ARHGEF11O15085 1522 aa25.79■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.79■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.79■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 PBRM1Q86U86 1689 aa25.77■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.77■■□□□ 1.72
MEIS2-212ENST00000559129 TOP2BQ02880 1626 aa25.76■■□□□ 1.71
MEIS2-212ENST00000559129 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.73■■□□□ 1.71
MEIS2-212ENST00000559129 FBLN2P98095 1184 aa25.73■■□□□ 1.71
MEIS2-212ENST00000559129 SYNJ1O43426 1573 aa25.73■■□□□ 1.71
MEIS2-212ENST00000559129 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
MEIS2-212ENST00000559129 SYNJ2O15056 1496 aa25.68■■□□□ 1.7
MEIS2-212ENST00000559129 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.67■■□□□ 1.7
MEIS2-212ENST00000559129 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
MEIS2-212ENST00000559129 ARAP1Q96P48 1450 aa25.55■■□□□ 1.68
MEIS2-212ENST00000559129 ADAMTS12P58397 1594 aa25.54■■□□□ 1.68
MEIS2-212ENST00000559129 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.48■■□□□ 1.67
MEIS2-212ENST00000559129 GRIN2AQ12879 1464 aa25.47■■□□□ 1.67
MEIS2-212ENST00000559129 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.47■■□□□ 1.67
MEIS2-212ENST00000559129 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.43■■□□□ 1.66
MEIS2-212ENST00000559129 NUP160Q12769 1436 aa25.39■■□□□ 1.66
MEIS2-212ENST00000559129 CEP170Q5SW79 1584 aa25.39■■□□□ 1.65
MEIS2-212ENST00000559129 SHROOM2Q13796 1616 aa25.29■■□□□ 1.64
MEIS2-212ENST00000559129 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.24■■□□□ 1.63
MEIS2-212ENST00000559129 KIF27Q86VH2 1401 aa25.21■■□□□ 1.63
MEIS2-212ENST00000559129 CUL7Q14999 1698 aa25.18■■□□□ 1.62
MEIS2-212ENST00000559129 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.17■■□□□ 1.62
MEIS2-212ENST00000559129 IGF1RP08069 1367 aa25.16■■□□□ 1.62
MEIS2-212ENST00000559129 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms