RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558982.5

MIR9-3HG-206, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 569 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.51■■■■■ 5.04
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.54■■■■■ 4.24
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCC9O60706 1549 aa40.98■■■■■ 4.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.24■■■■□ 3.87
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NACADO15069 1562 aa39.11■■■■□ 3.85
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.93■■■■□ 3.82
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.74■■■■□ 3.79
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
MIR9-3HG-206ENST00000558982 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.49■■■■□ 3.75
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.45■■■■□ 3.75
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.22■■■■□ 3.71
MIR9-3HG-206ENST00000558982 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.16■■■■□ 3.7
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.01■■■■□ 3.68
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SCRIBQ14160 1630 aa37.87■■■■□ 3.65
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.6■■■■□ 3.61
MIR9-3HG-206ENST00000558982 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.13■■■■□ 3.53
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.09■■■■□ 3.53
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.85■■■■□ 3.49
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SMARCA4P51532 1647 aa36.19■■■■□ 3.38
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NCAPD3P42695 1498 aa36.09■■■■□ 3.37
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.06■■■■□ 3.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SMARCA2P51531 1590 aa35.98■■■■□ 3.35
MIR9-3HG-206ENST00000558982 HMGXB3Q12766 1538 aa35.89■■■■□ 3.34
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.86■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.84■■■■□ 3.33
MIR9-3HG-206ENST00000558982 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.72■■■■□ 3.31
MIR9-3HG-206ENST00000558982 WIZO95785 1651 aa35.48■■■■□ 3.27
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NESP48681 1621 aa35.39■■■■□ 3.26
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ERCC6Q03468 1493 aa35.3■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.28■■■■□ 3.24
MIR9-3HG-206ENST00000558982 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.21■■■■□ 3.23
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CUX2O14529 1486 aa35.09■■■■□ 3.21
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CADPSQ9ULU8 1353 aa35■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.99■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-206ENST00000558982 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.93■■■■□ 3.18
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CFTRP13569 1480 aa34.74■■■■□ 3.15
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.63■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.63■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.61■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.59■■■■□ 3.13
MIR9-3HG-206ENST00000558982 WDR62O43379 1518 aa34.56■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PRDM2Q13029 1718 aa34.52■■■■□ 3.12
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa34.46■■■■□ 3.11
MIR9-3HG-206ENST00000558982 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.33■■■■□ 3.09
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.04■■■■□ 3.04
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TOPBP1Q92547 1522 aa34.04■■■■□ 3.04
MIR9-3HG-206ENST00000558982 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.96■■■■□ 3.03
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCC8Q09428 1581 aa33.94■■■■□ 3.02
MIR9-3HG-206ENST00000558982 IFT140Q96RY7 1462 aa33.88■■■■□ 3.01
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.82■■■■□ 3
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-206ENST00000558982 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.72■■■□□ 2.99
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CUX1P39880 1505 aa33.67■■■□□ 2.98
MIR9-3HG-206ENST00000558982 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.67■■■□□ 2.98
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.59■■■□□ 2.97
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.58■■■□□ 2.97
MIR9-3HG-206ENST00000558982 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.56■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SOGA1O94964 1423 aa33.54■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-206ENST00000558982 OSCARQ8IYS5 282 aa33.53■■■□□ 2.96
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.41■■■□□ 2.94
MIR9-3HG-206ENST00000558982 WDR97A6NE52 1622 aa33.39■■■□□ 2.94
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CHD1O14646 1710 aa33.35■■■□□ 2.93
MIR9-3HG-206ENST00000558982 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.28■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SYNJ1O43426 1573 aa33.26■■■□□ 2.92
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TOP2BQ02880 1626 aa33.26■■■□□ 2.91
MIR9-3HG-206ENST00000558982 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.25■■■□□ 2.91
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.23■■■□□ 2.91
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.23■■■□□ 2.91
MIR9-3HG-206ENST00000558982 GRIN2BQ13224 1484 aa33.19■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 PBRM1Q86U86 1689 aa33.19■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.17■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.17■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FBLN2P98095 1184 aa33.15■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.15■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 TRIM41Q8WV44 630 aa33.14■■■□□ 2.9
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.13■■■□□ 2.89
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.13■■■□□ 2.89
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.13■■■□□ 2.89
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ARHGEF11O15085 1522 aa33.06■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SYNJ2O15056 1496 aa33.03■■■□□ 2.88
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.96■■■□□ 2.87
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ADAMTS12P58397 1594 aa32.87■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.82■■■□□ 2.85
MIR9-3HG-206ENST00000558982 GRIN2AQ12879 1464 aa32.8■■■□□ 2.84
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ARAP1Q96P48 1450 aa32.78■■■□□ 2.84
MIR9-3HG-206ENST00000558982 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.75■■■□□ 2.83
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.73■■■□□ 2.83
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CEP170Q5SW79 1584 aa32.69■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-206ENST00000558982 NUP160Q12769 1436 aa32.67■■■□□ 2.82
MIR9-3HG-206ENST00000558982 KIF27Q86VH2 1401 aa32.56■■■□□ 2.8
MIR9-3HG-206ENST00000558982 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.51■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-206ENST00000558982 IGF1RP08069 1367 aa32.51■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-206ENST00000558982 SHROOM2Q13796 1616 aa32.51■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-206ENST00000558982 CUL7Q14999 1698 aa32.46■■■□□ 2.79
MIR9-3HG-206ENST00000558982 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.41■■■□□ 2.78
MIR9-3HG-206ENST00000558982 JPH4Q96JJ6 628 aa32.29■■■□□ 2.76
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