RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558754.5

MIR9-3HG-205, Transcript of MIR9-3 host gene, humanhuman

TSL 4

Gene MIR9-3HG, Length 786 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NISCHQ9Y2I1 1504 aa59.39■■■■■ 7.1
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.22■■■■■ 6.11
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCC9O60706 1549 aa52.76■■■■■ 6.04
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.4■■■■■ 5.66
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NACADO15069 1562 aa50.11■■■■■ 5.61
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DCAF8L2P0C7V8 631 aa49.95■■■■■ 5.59
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MYO15BQ96JP2 1530 aa49.48■■■■■ 5.51
MIR9-3HG-205ENST00000558754 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.39■■■■■ 5.5
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.12■■■■■ 5.45
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.04■■■■■ 5.44
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.95■■■■■ 5.43
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.9■■■■■ 5.42
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SCRIBQ14160 1630 aa48.58■■■■■ 5.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa48.23■■■■■ 5.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa47.7■■■■■ 5.23
MIR9-3HG-205ENST00000558754 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.69■■■■■ 5.22
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.44■■■■■ 5.18
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SMARCA4P51532 1647 aa46.32■■■■■ 5.01
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NCAPD3P42695 1498 aa46.18■■■■■ 4.98
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.16■■■■■ 4.98
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SMARCA2P51531 1590 aa46.1■■■■■ 4.97
MIR9-3HG-205ENST00000558754 HMGXB3Q12766 1538 aa45.99■■■■■ 4.95
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MROH2BQ7Z745 1585 aa45.81■■■■■ 4.92
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PEG3Q9GZU2 1588 aa45.79■■■■■ 4.92
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ERCC6Q03468 1493 aa45.54■■■■■ 4.88
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NESP48681 1621 aa45.44■■■■■ 4.87
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WIZO95785 1651 aa45.35■■■■■ 4.85
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CUX2O14529 1486 aa45.23■■■■■ 4.83
MIR9-3HG-205ENST00000558754 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.18■■■■■ 4.82
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.99■■■■■ 4.79
MIR9-3HG-205ENST00000558754 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.95■■■■■ 4.79
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP44.95■■■■■ 4.79
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.84■■■■■ 4.77
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CADPSQ9ULU8 1353 aa44.81■■■■■ 4.76
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP44.77■■■■■ 4.76
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa44.58■■■■■ 4.73
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.5■■■■■ 4.71
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.43■■■■■ 4.7
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CFTRP13569 1480 aa44.41■■■■■ 4.7
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.39■■■■■ 4.7
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WDR62O43379 1518 aa44.38■■■■■ 4.69
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PRDM2Q13029 1718 aa44.24■■■■■ 4.67
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.19■■■■■ 4.66
MIR9-3HG-205ENST00000558754 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.01■■■■■ 4.64
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TOPBP1Q92547 1522 aa43.61■■■■■ 4.57
MIR9-3HG-205ENST00000558754 DNMBPQ6XZF7 1577 aa43.52■■■■■ 4.56
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCC8Q09428 1581 aa43.46■■■■■ 4.55
MIR9-3HG-205ENST00000558754 IFT140Q96RY7 1462 aa43.46■■■■■ 4.55
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.39■■■■■ 4.54
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP43.34■■■■■ 4.53
MIR9-3HG-205ENST00000558754 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.28■■■■■ 4.52
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.2■■■■■ 4.51
MIR9-3HG-205ENST00000558754 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
MIR9-3HG-205ENST00000558754 OSCARQ8IYS5 282 aa43.14■■■■■ 4.5
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CUX1P39880 1505 aa43.03■■■■■ 4.48
MIR9-3HG-205ENST00000558754 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.02■■■■■ 4.48
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.02■■■■■ 4.48
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FGD5Q6ZNL6 1462 aa43.01■■■■■ 4.48
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRIM41Q8WV44 630 aa42.98■■■■■ 4.47
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SOGA1O94964 1423 aa42.94■■■■■ 4.46
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CHD1O14646 1710 aa42.91■■■■■ 4.46
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WDR97A6NE52 1622 aa42.77■■■■■ 4.44
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa42.73■■■■■ 4.43
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FBLN2P98095 1184 aa42.67■■■■■ 4.42
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa42.67■■■■■ 4.42
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ARHGEF11O15085 1522 aa42.6■■■■■ 4.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 PBRM1Q86U86 1689 aa42.58■■■■■ 4.41
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GRIN2BQ13224 1484 aa42.55■■■■■ 4.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.52■■■■■ 4.4
MIR9-3HG-205ENST00000558754 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa42.5■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa42.49■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.48■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SYNJ1O43426 1573 aa42.48■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GAPVD1Q14C86 1478 aa42.47■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TOP2BQ02880 1626 aa42.46■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP42.45■■■■■ 4.39
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.37■■■■■ 4.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SYNJ2O15056 1496 aa42.36■■■■■ 4.37
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CLASP1Q7Z460 1538 aa42.3■■■■■ 4.36
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ARAP1Q96P48 1450 aa42.2■■■■■ 4.35
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.16■■■■■ 4.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ADAMTS12P58397 1594 aa42.14■■■■■ 4.34
MIR9-3HG-205ENST00000558754 GRIN2AQ12879 1464 aa42.03■■■■■ 4.32
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ERICH3Q5RHP9 1530 aa41.98■■■■■ 4.31
MIR9-3HG-205ENST00000558754 FHAD1B1AJZ9 1412 aa41.92■■■■■ 4.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CEP170Q5SW79 1584 aa41.91■■■■■ 4.3
MIR9-3HG-205ENST00000558754 NUP160Q12769 1436 aa41.83■■■■■ 4.29
MIR9-3HG-205ENST00000558754 ERCC6L2Q5T890 1561 aa41.72■■■■■ 4.27
MIR9-3HG-205ENST00000558754 SHROOM2Q13796 1616 aa41.66■■■■■ 4.26
MIR9-3HG-205ENST00000558754 TRHP20396 242 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 KIF27Q86VH2 1401 aa41.59■■■■■ 4.25
MIR9-3HG-205ENST00000558754 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa41.55■■■■■ 4.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 CUL7Q14999 1698 aa41.54■■■■■ 4.24
MIR9-3HG-205ENST00000558754 IGF1RP08069 1367 aa41.44■■■■■ 4.22
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