RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558694.1

MNS1-202, Transcript of meiosis specific nuclear structural 1, humanhuman

TSL 4

Gene MNS1, Length 584 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MNS1-202ENST00000558694 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.57■■■■□ 3.61
MNS1-202ENST00000558694 ABCC9O60706 1549 aa34.77■■■■□ 3.16
MNS1-202ENST00000558694 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34■■■■□ 3.03
MNS1-202ENST00000558694 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.25■■■□□ 2.91
MNS1-202ENST00000558694 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.73■■■□□ 2.83
MNS1-202ENST00000558694 NACADO15069 1562 aa32.33■■■□□ 2.77
MNS1-202ENST00000558694 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.29■■■□□ 2.76
MNS1-202ENST00000558694 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.14■■■□□ 2.74
MNS1-202ENST00000558694 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32■■■□□ 2.71
MNS1-202ENST00000558694 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.81■■■□□ 2.68
MNS1-202ENST00000558694 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.6■■■□□ 2.65
MNS1-202ENST00000558694 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.38■■■□□ 2.61
MNS1-202ENST00000558694 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.35■■■□□ 2.61
MNS1-202ENST00000558694 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.26■■■□□ 2.59
MNS1-202ENST00000558694 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.09■■■□□ 2.57
MNS1-202ENST00000558694 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.04■■■□□ 2.56
MNS1-202ENST00000558694 SCRIBQ14160 1630 aa31■■■□□ 2.55
MNS1-202ENST00000558694 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
MNS1-202ENST00000558694 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.95■■■□□ 2.55
MNS1-202ENST00000558694 CUX2O14529 1486 aa30.21■■■□□ 2.43
MNS1-202ENST00000558694 ERCC6Q03468 1493 aa30.07■■■□□ 2.4
MNS1-202ENST00000558694 NCAPD3P42695 1498 aa29.86■■■□□ 2.37
MNS1-202ENST00000558694 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.68■■■□□ 2.34
MNS1-202ENST00000558694 NESP48681 1621 aa29.66■■■□□ 2.34
MNS1-202ENST00000558694 HMGXB3Q12766 1538 aa29.55■■■□□ 2.32
MNS1-202ENST00000558694 SMARCA2P51531 1590 aa29.55■■■□□ 2.32
MNS1-202ENST00000558694 SMARCA4P51532 1647 aa29.47■■■□□ 2.31
MNS1-202ENST00000558694 TRIM41Q8WV44 630 aa29.46■■■□□ 2.31
MNS1-202ENST00000558694 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
MNS1-202ENST00000558694 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
MNS1-202ENST00000558694 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.3■■■□□ 2.28
MNS1-202ENST00000558694 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.25■■■□□ 2.27
MNS1-202ENST00000558694 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
MNS1-202ENST00000558694 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.18■■■□□ 2.26
MNS1-202ENST00000558694 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.14■■■□□ 2.26
MNS1-202ENST00000558694 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.97■■■□□ 2.23
MNS1-202ENST00000558694 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.96■■■□□ 2.23
MNS1-202ENST00000558694 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.94■■■□□ 2.22
MNS1-202ENST00000558694 WDR62O43379 1518 aa28.89■■■□□ 2.22
MNS1-202ENST00000558694 OSCARQ8IYS5 282 aa28.77■■■□□ 2.2
MNS1-202ENST00000558694 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.72■■■□□ 2.19
MNS1-202ENST00000558694 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.62■■■□□ 2.17
MNS1-202ENST00000558694 WIZO95785 1651 aa28.6■■■□□ 2.17
MNS1-202ENST00000558694 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.44■■■□□ 2.14
MNS1-202ENST00000558694 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.44■■■□□ 2.14
MNS1-202ENST00000558694 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.44■■■□□ 2.14
MNS1-202ENST00000558694 CFTRP13569 1480 aa28.44■■■□□ 2.14
MNS1-202ENST00000558694 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
MNS1-202ENST00000558694 ARHGEF11O15085 1522 aa28.28■■■□□ 2.12
MNS1-202ENST00000558694 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.1
MNS1-202ENST00000558694 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.17■■■□□ 2.1
MNS1-202ENST00000558694 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
MNS1-202ENST00000558694 IFT140Q96RY7 1462 aa28.15■■■□□ 2.1
MNS1-202ENST00000558694 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
MNS1-202ENST00000558694 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
MNS1-202ENST00000558694 PRDM2Q13029 1718 aa28.09■■■□□ 2.09
MNS1-202ENST00000558694 TOPBP1Q92547 1522 aa27.99■■■□□ 2.07
MNS1-202ENST00000558694 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
MNS1-202ENST00000558694 ARAP1Q96P48 1450 aa27.95■■■□□ 2.07
MNS1-202ENST00000558694 CHD1O14646 1710 aa27.94■■■□□ 2.06
MNS1-202ENST00000558694 FBLN2P98095 1184 aa27.88■■■□□ 2.05
MNS1-202ENST00000558694 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.87■■■□□ 2.05
MNS1-202ENST00000558694 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.87■■■□□ 2.05
MNS1-202ENST00000558694 ABCC8Q09428 1581 aa27.86■■■□□ 2.05
MNS1-202ENST00000558694 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
MNS1-202ENST00000558694 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.82■■■□□ 2.04
MNS1-202ENST00000558694 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
MNS1-202ENST00000558694 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
MNS1-202ENST00000558694 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.6■■■□□ 2.01
MNS1-202ENST00000558694 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.6■■■□□ 2.01
MNS1-202ENST00000558694 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.57■■■□□ 2
MNS1-202ENST00000558694 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.56■■■□□ 2
MNS1-202ENST00000558694 SOGA1O94964 1423 aa27.54■■■□□ 2
MNS1-202ENST00000558694 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
MNS1-202ENST00000558694 SYNJ1O43426 1573 aa27.51■■□□□ 1.99
MNS1-202ENST00000558694 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.42■■□□□ 1.98
MNS1-202ENST00000558694 WDR97A6NE52 1622 aa27.41■■□□□ 1.98
MNS1-202ENST00000558694 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.39■■□□□ 1.98
MNS1-202ENST00000558694 GRIN2BQ13224 1484 aa27.37■■□□□ 1.97
MNS1-202ENST00000558694 SYNJ2O15056 1496 aa27.36■■□□□ 1.97
MNS1-202ENST00000558694 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.36■■□□□ 1.97
MNS1-202ENST00000558694 CUX1P39880 1505 aa27.26■■□□□ 1.95
MNS1-202ENST00000558694 PBRM1Q86U86 1689 aa27.21■■□□□ 1.95
MNS1-202ENST00000558694 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.12■■□□□ 1.93
MNS1-202ENST00000558694 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.04■■□□□ 1.92
MNS1-202ENST00000558694 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.02■■□□□ 1.92
MNS1-202ENST00000558694 GRIN2AQ12879 1464 aa27■■□□□ 1.91
MNS1-202ENST00000558694 CEP170Q5SW79 1584 aa27■■□□□ 1.91
MNS1-202ENST00000558694 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.95■■□□□ 1.91
MNS1-202ENST00000558694 NUP160Q12769 1436 aa26.94■■□□□ 1.9
MNS1-202ENST00000558694 ADAMTS12P58397 1594 aa26.89■■□□□ 1.9
MNS1-202ENST00000558694 SHROOM2Q13796 1616 aa26.88■■□□□ 1.89
MNS1-202ENST00000558694 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.81■■□□□ 1.88
MNS1-202ENST00000558694 FAM69CQ0P6D2 419 aa26.79■■□□□ 1.88
MNS1-202ENST00000558694 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.79■■□□□ 1.88
MNS1-202ENST00000558694 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
MNS1-202ENST00000558694 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.72■■□□□ 1.87
MNS1-202ENST00000558694 JPH4Q96JJ6 628 aa26.71■■□□□ 1.87
MNS1-202ENST00000558694 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.86
MNS1-202ENST00000558694 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.5 ms