RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558677.5

TM2D3-205, Transcript of TM2 domain containing 3, humanhuman

TSL 5

Gene TM2D3, Length 878 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3-205ENST00000558677 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.74■■■■■ 6.83
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TM2D3-205ENST00000558677 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.81■■■■■ 5.4
TM2D3-205ENST00000558677 NACADO15069 1562 aa48.61■■■■■ 5.37
TM2D3-205ENST00000558677 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.56■■■■■ 5.36
TM2D3-205ENST00000558677 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.13■■■■■ 5.3
TM2D3-205ENST00000558677 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.97■■■■■ 5.27
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TM2D3-205ENST00000558677 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.62■■■■■ 5.21
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TM2D3-205ENST00000558677 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.28■■■■■ 5.16
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TM2D3-205ENST00000558677 SCRIBQ14160 1630 aa47.03■■■■■ 5.12
TM2D3-205ENST00000558677 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.8■■■■■ 5.08
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TM2D3-205ENST00000558677 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.06■■■■■ 4.96
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TM2D3-205ENST00000558677 SMARCA4P51532 1647 aa44.91■■■■■ 4.78
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TM2D3-205ENST00000558677 SMARCA2P51531 1590 aa44.74■■■■■ 4.75
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TM2D3-205ENST00000558677 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.46■■■■■ 4.71
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TM2D3-205ENST00000558677 WIZO95785 1651 aa43.98■■■■■ 4.63
TM2D3-205ENST00000558677 NESP48681 1621 aa43.93■■■■■ 4.62
TM2D3-205ENST00000558677 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.8■■■■■ 4.6
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TM2D3-205ENST00000558677 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.54■■■■■ 4.56
TM2D3-205ENST00000558677 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.53■■■■■ 4.56
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TM2D3-205ENST00000558677 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.06■■■■■ 4.48
TM2D3-205ENST00000558677 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.05■■■■■ 4.48
TM2D3-205ENST00000558677 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.01■■■■■ 4.48
TM2D3-205ENST00000558677 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.98■■■■■ 4.47
TM2D3-205ENST00000558677 WDR62O43379 1518 aa42.93■■■■■ 4.46
TM2D3-205ENST00000558677 PRDM2Q13029 1718 aa42.77■■■■■ 4.44
TM2D3-205ENST00000558677 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.61■■■■■ 4.41
TM2D3-205ENST00000558677 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
TM2D3-205ENST00000558677 ABCC8Q09428 1581 aa42.29■■■■■ 4.36
TM2D3-205ENST00000558677 TOPBP1Q92547 1522 aa42.28■■■■■ 4.36
TM2D3-205ENST00000558677 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.2■■■■■ 4.35
TM2D3-205ENST00000558677 IFT140Q96RY7 1462 aa42.17■■■■■ 4.34
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TM2D3-205ENST00000558677 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.89■■■■■ 4.3
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TM2D3-205ENST00000558677 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
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TM2D3-205ENST00000558677 CUX1P39880 1505 aa41.75■■■■■ 4.27
TM2D3-205ENST00000558677 SOGA1O94964 1423 aa41.74■■■■■ 4.27
TM2D3-205ENST00000558677 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.72■■■■■ 4.27
TM2D3-205ENST00000558677 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.72■■■■■ 4.27
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TM2D3-205ENST00000558677 WDR97A6NE52 1622 aa41.51■■■■■ 4.24
TM2D3-205ENST00000558677 FBLN2P98095 1184 aa41.39■■■■■ 4.22
TM2D3-205ENST00000558677 CHD1O14646 1710 aa41.38■■■■■ 4.21
TM2D3-205ENST00000558677 TRIM41Q8WV44 630 aa41.37■■■■■ 4.21
TM2D3-205ENST00000558677 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.35■■■■■ 4.21
TM2D3-205ENST00000558677 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.32■■■■■ 4.2
TM2D3-205ENST00000558677 GRIN2BQ13224 1484 aa41.31■■■■■ 4.2
TM2D3-205ENST00000558677 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.28■■■■■ 4.2
TM2D3-205ENST00000558677 TOP2BQ02880 1626 aa41.28■■■■■ 4.2
TM2D3-205ENST00000558677 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.27■■■■■ 4.2
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TM2D3-205ENST00000558677 SYNJ1O43426 1573 aa41.23■■■■■ 4.19
TM2D3-205ENST00000558677 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.18■■■■■ 4.18
TM2D3-205ENST00000558677 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.17■■■■■ 4.18
TM2D3-205ENST00000558677 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.17■■■■■ 4.18
TM2D3-205ENST00000558677 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.17■■■■■ 4.18
TM2D3-205ENST00000558677 PBRM1Q86U86 1689 aa41.17■■■■■ 4.18
TM2D3-205ENST00000558677 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.15■■■■■ 4.18
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TM2D3-205ENST00000558677 SYNJ2O15056 1496 aa41.1■■■■■ 4.17
TM2D3-205ENST00000558677 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.91■■■■■ 4.14
TM2D3-205ENST00000558677 ADAMTS12P58397 1594 aa40.81■■■■■ 4.12
TM2D3-205ENST00000558677 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.8■■■■■ 4.12
TM2D3-205ENST00000558677 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.8■■■■■ 4.12
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TM2D3-205ENST00000558677 NUP160Q12769 1436 aa40.59■■■■■ 4.09
TM2D3-205ENST00000558677 CEP170Q5SW79 1584 aa40.57■■■■■ 4.08
TM2D3-205ENST00000558677 KIF27Q86VH2 1401 aa40.53■■■■■ 4.08
TM2D3-205ENST00000558677 IGF1RP08069 1367 aa40.39■■■■■ 4.06
TM2D3-205ENST00000558677 CUL7Q14999 1698 aa40.34■■■■■ 4.05
TM2D3-205ENST00000558677 SHROOM2Q13796 1616 aa40.32■■■■■ 4.05
TM2D3-205ENST00000558677 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.29■■■■■ 4.04
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TM2D3-205ENST00000558677 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.21■■■■■ 4.03
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