RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558516.1

CSH2-204, Transcript of chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

TSL 2

Gene CSH2, Length 1,172 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2-204ENST00000558516 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.89■■■■□ 3.18
CSH2-204ENST00000558516 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.27■■■□□ 2.6
CSH2-204ENST00000558516 ABCC9O60706 1549 aa30.68■■■□□ 2.5
CSH2-204ENST00000558516 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.52■■■□□ 2.32
CSH2-204ENST00000558516 NACADO15069 1562 aa29.42■■■□□ 2.3
CSH2-204ENST00000558516 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.2■■■□□ 2.26
CSH2-204ENST00000558516 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
CSH2-204ENST00000558516 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.02■■■□□ 2.24
CSH2-204ENST00000558516 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.94■■■□□ 2.22
CSH2-204ENST00000558516 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.89■■■□□ 2.21
CSH2-204ENST00000558516 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.61■■■□□ 2.17
CSH2-204ENST00000558516 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.53■■■□□ 2.16
CSH2-204ENST00000558516 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.4■■■□□ 2.14
CSH2-204ENST00000558516 SCRIBQ14160 1630 aa28.36■■■□□ 2.13
CSH2-204ENST00000558516 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.36■■■□□ 2.13
CSH2-204ENST00000558516 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
CSH2-204ENST00000558516 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.82■■■□□ 2.04
CSH2-204ENST00000558516 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.64■■■□□ 2.02
CSH2-204ENST00000558516 SMARCA4P51532 1647 aa27.16■■□□□ 1.94
CSH2-204ENST00000558516 NCAPD3P42695 1498 aa27.1■■□□□ 1.93
CSH2-204ENST00000558516 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
CSH2-204ENST00000558516 SMARCA2P51531 1590 aa27.06■■□□□ 1.92
CSH2-204ENST00000558516 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.05■■□□□ 1.92
CSH2-204ENST00000558516 HMGXB3Q12766 1538 aa27■■□□□ 1.91
CSH2-204ENST00000558516 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.96■■□□□ 1.91
CSH2-204ENST00000558516 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.84■■□□□ 1.89
CSH2-204ENST00000558516 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
CSH2-204ENST00000558516 WIZO95785 1651 aa26.56■■□□□ 1.84
CSH2-204ENST00000558516 ERCC6Q03468 1493 aa26.49■■□□□ 1.83
CSH2-204ENST00000558516 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.49■■□□□ 1.83
CSH2-204ENST00000558516 NESP48681 1621 aa26.47■■□□□ 1.83
CSH2-204ENST00000558516 CUX2O14529 1486 aa26.42■■□□□ 1.82
CSH2-204ENST00000558516 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
CSH2-204ENST00000558516 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CSH2-204ENST00000558516 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.25■■□□□ 1.79
CSH2-204ENST00000558516 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
CSH2-204ENST00000558516 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.25■■□□□ 1.79
CSH2-204ENST00000558516 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.25■■□□□ 1.79
CSH2-204ENST00000558516 CFTRP13569 1480 aa26.07■■□□□ 1.76
CSH2-204ENST00000558516 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.02■■□□□ 1.76
CSH2-204ENST00000558516 PRDM2Q13029 1718 aa26■■□□□ 1.75
CSH2-204ENST00000558516 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.98■■□□□ 1.75
CSH2-204ENST00000558516 WDR62O43379 1518 aa25.97■■□□□ 1.75
CSH2-204ENST00000558516 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.97■■□□□ 1.75
CSH2-204ENST00000558516 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.91■■□□□ 1.74
CSH2-204ENST00000558516 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.85■■□□□ 1.73
CSH2-204ENST00000558516 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CSH2-204ENST00000558516 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CSH2-204ENST00000558516 ABCC8Q09428 1581 aa25.56■■□□□ 1.68
CSH2-204ENST00000558516 TOPBP1Q92547 1522 aa25.53■■□□□ 1.68
CSH2-204ENST00000558516 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.52■■□□□ 1.68
CSH2-204ENST00000558516 IFT140Q96RY7 1462 aa25.46■■□□□ 1.67
CSH2-204ENST00000558516 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
CSH2-204ENST00000558516 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
CSH2-204ENST00000558516 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
CSH2-204ENST00000558516 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
CSH2-204ENST00000558516 CUX1P39880 1505 aa25.22■■□□□ 1.63
CSH2-204ENST00000558516 WDR97A6NE52 1622 aa25.19■■□□□ 1.62
CSH2-204ENST00000558516 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.17■■□□□ 1.62
CSH2-204ENST00000558516 OSCARQ8IYS5 282 aa25.14■■□□□ 1.62
CSH2-204ENST00000558516 SOGA1O94964 1423 aa25.13■■□□□ 1.61
CSH2-204ENST00000558516 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.12■■□□□ 1.61
CSH2-204ENST00000558516 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.1■■□□□ 1.61
CSH2-204ENST00000558516 CHD1O14646 1710 aa25.03■■□□□ 1.6
CSH2-204ENST00000558516 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.01■■□□□ 1.59
CSH2-204ENST00000558516 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CSH2-204ENST00000558516 TOP2BQ02880 1626 aa24.97■■□□□ 1.59
CSH2-204ENST00000558516 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.96■■□□□ 1.59
CSH2-204ENST00000558516 GRIN2BQ13224 1484 aa24.93■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 PBRM1Q86U86 1689 aa24.92■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.92■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.91■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.91■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 SYNJ1O43426 1573 aa24.9■■□□□ 1.58
CSH2-204ENST00000558516 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.87■■□□□ 1.57
CSH2-204ENST00000558516 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.87■■□□□ 1.57
CSH2-204ENST00000558516 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.87■■□□□ 1.57
CSH2-204ENST00000558516 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.87■■□□□ 1.57
CSH2-204ENST00000558516 ARHGEF11O15085 1522 aa24.81■■□□□ 1.56
CSH2-204ENST00000558516 SYNJ2O15056 1496 aa24.81■■□□□ 1.56
CSH2-204ENST00000558516 FBLN2P98095 1184 aa24.77■■□□□ 1.56
CSH2-204ENST00000558516 TRIM41Q8WV44 630 aa24.76■■□□□ 1.55
CSH2-204ENST00000558516 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.76■■□□□ 1.55
CSH2-204ENST00000558516 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
CSH2-204ENST00000558516 ADAMTS12P58397 1594 aa24.68■■□□□ 1.54
CSH2-204ENST00000558516 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.67■■□□□ 1.54
CSH2-204ENST00000558516 GRIN2AQ12879 1464 aa24.61■■□□□ 1.53
CSH2-204ENST00000558516 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.59■■□□□ 1.53
CSH2-204ENST00000558516 ARAP1Q96P48 1450 aa24.58■■□□□ 1.53
CSH2-204ENST00000558516 NUP160Q12769 1436 aa24.52■■□□□ 1.52
CSH2-204ENST00000558516 CEP170Q5SW79 1584 aa24.5■■□□□ 1.51
CSH2-204ENST00000558516 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.46■■□□□ 1.51
CSH2-204ENST00000558516 SHROOM2Q13796 1616 aa24.43■■□□□ 1.5
CSH2-204ENST00000558516 KIF27Q86VH2 1401 aa24.43■■□□□ 1.5
CSH2-204ENST00000558516 CUL7Q14999 1698 aa24.42■■□□□ 1.5
CSH2-204ENST00000558516 IGF1RP08069 1367 aa24.33■■□□□ 1.49
CSH2-204ENST00000558516 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.33■■□□□ 1.49
CSH2-204ENST00000558516 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.3■■□□□ 1.48
CSH2-204ENST00000558516 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.2■■□□□ 1.47
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