RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558291.1

GDPGP1-203, Transcript of GDP-D-glucose phosphorylase 1, humanhuman

TSL 4

Gene GDPGP1, Length 550 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPGP1-203ENST00000558291 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.5■■■■■ 4.55
GDPGP1-203ENST00000558291 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa39.06■■■■□ 3.84
GDPGP1-203ENST00000558291 ABCC9O60706 1549 aa38.54■■■■□ 3.76
GDPGP1-203ENST00000558291 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa37.01■■■■□ 3.52
GDPGP1-203ENST00000558291 NACADO15069 1562 aa36.85■■■■□ 3.49
GDPGP1-203ENST00000558291 MYO15BQ96JP2 1530 aa36.54■■■■□ 3.44
GDPGP1-203ENST00000558291 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.33■■■■□ 3.41
GDPGP1-203ENST00000558291 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
GDPGP1-203ENST00000558291 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa36.11■■■■□ 3.37
GDPGP1-203ENST00000558291 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.05■■■■□ 3.36
GDPGP1-203ENST00000558291 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.83■■■■□ 3.33
GDPGP1-203ENST00000558291 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.82■■■■□ 3.32
GDPGP1-203ENST00000558291 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.81■■■■□ 3.32
GDPGP1-203ENST00000558291 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa35.67■■■■□ 3.3
GDPGP1-203ENST00000558291 SCRIBQ14160 1630 aa35.38■■■■□ 3.25
GDPGP1-203ENST00000558291 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.96■■■■□ 3.19
GDPGP1-203ENST00000558291 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.92■■■■□ 3.18
GDPGP1-203ENST00000558291 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.79■■■■□ 3.16
GDPGP1-203ENST00000558291 NCAPD3P42695 1498 aa33.97■■■■□ 3.03
GDPGP1-203ENST00000558291 SMARCA4P51532 1647 aa33.88■■■■□ 3.01
GDPGP1-203ENST00000558291 SMARCA2P51531 1590 aa33.85■■■■□ 3.01
GDPGP1-203ENST00000558291 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.83■■■■□ 3.01
GDPGP1-203ENST00000558291 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.81■■■■□ 3
GDPGP1-203ENST00000558291 HMGXB3Q12766 1538 aa33.79■■■■□ 3
GDPGP1-203ENST00000558291 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.66■■■□□ 2.98
GDPGP1-203ENST00000558291 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.54■■■□□ 2.96
GDPGP1-203ENST00000558291 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.43■■■□□ 2.94
GDPGP1-203ENST00000558291 ERCC6Q03468 1493 aa33.37■■■□□ 2.93
GDPGP1-203ENST00000558291 CUX2O14529 1486 aa33.35■■■□□ 2.93
GDPGP1-203ENST00000558291 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa33.2■■■□□ 2.91
GDPGP1-203ENST00000558291 NESP48681 1621 aa33.15■■■□□ 2.9
GDPGP1-203ENST00000558291 WIZO95785 1651 aa33.02■■■□□ 2.88
GDPGP1-203ENST00000558291 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.98■■■□□ 2.87
GDPGP1-203ENST00000558291 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
GDPGP1-203ENST00000558291 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.91■■■□□ 2.86
GDPGP1-203ENST00000558291 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.9■■■□□ 2.86
GDPGP1-203ENST00000558291 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.85■■■□□ 2.85
GDPGP1-203ENST00000558291 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.82■■■□□ 2.84
GDPGP1-203ENST00000558291 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.75■■■□□ 2.83
GDPGP1-203ENST00000558291 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.63■■■□□ 2.81
GDPGP1-203ENST00000558291 CFTRP13569 1480 aa32.61■■■□□ 2.81
GDPGP1-203ENST00000558291 WDR62O43379 1518 aa32.57■■■□□ 2.8
GDPGP1-203ENST00000558291 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.55■■■□□ 2.8
GDPGP1-203ENST00000558291 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.5■■■□□ 2.79
GDPGP1-203ENST00000558291 PRDM2Q13029 1718 aa32.37■■■□□ 2.77
GDPGP1-203ENST00000558291 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.28■■■□□ 2.76
GDPGP1-203ENST00000558291 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
GDPGP1-203ENST00000558291 ABCC8Q09428 1581 aa32.02■■■□□ 2.72
GDPGP1-203ENST00000558291 IFT140Q96RY7 1462 aa31.93■■■□□ 2.7
GDPGP1-203ENST00000558291 TOPBP1Q92547 1522 aa31.91■■■□□ 2.7
GDPGP1-203ENST00000558291 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.88■■■□□ 2.69
GDPGP1-203ENST00000558291 OSCARQ8IYS5 282 aa31.74■■■□□ 2.67
GDPGP1-203ENST00000558291 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.69■■■□□ 2.66
GDPGP1-203ENST00000558291 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
GDPGP1-203ENST00000558291 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.63■■■□□ 2.65
GDPGP1-203ENST00000558291 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.6■■■□□ 2.65
GDPGP1-203ENST00000558291 WDR97A6NE52 1622 aa31.54■■■□□ 2.64
GDPGP1-203ENST00000558291 SOGA1O94964 1423 aa31.44■■■□□ 2.62
GDPGP1-203ENST00000558291 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.43■■■□□ 2.62
GDPGP1-203ENST00000558291 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.41■■■□□ 2.62
GDPGP1-203ENST00000558291 CUX1P39880 1505 aa31.41■■■□□ 2.62
GDPGP1-203ENST00000558291 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.39■■■□□ 2.62
GDPGP1-203ENST00000558291 TRIM41Q8WV44 630 aa31.38■■■□□ 2.61
GDPGP1-203ENST00000558291 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.37■■■□□ 2.61
GDPGP1-203ENST00000558291 CHD1O14646 1710 aa31.31■■■□□ 2.6
GDPGP1-203ENST00000558291 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.28■■■□□ 2.6
GDPGP1-203ENST00000558291 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.28■■■□□ 2.6
GDPGP1-203ENST00000558291 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.28■■■□□ 2.6
GDPGP1-203ENST00000558291 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
GDPGP1-203ENST00000558291 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
GDPGP1-203ENST00000558291 ARHGEF11O15085 1522 aa31.24■■■□□ 2.59
GDPGP1-203ENST00000558291 GRIN2BQ13224 1484 aa31.21■■■□□ 2.59
GDPGP1-203ENST00000558291 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa31.19■■■□□ 2.58
GDPGP1-203ENST00000558291 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa31.16■■■□□ 2.58
GDPGP1-203ENST00000558291 FBLN2P98095 1184 aa31.12■■■□□ 2.57
GDPGP1-203ENST00000558291 GAPVD1Q14C86 1478 aa31.1■■■□□ 2.57
GDPGP1-203ENST00000558291 SYNJ2O15056 1496 aa31.09■■■□□ 2.57
GDPGP1-203ENST00000558291 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa31.08■■■□□ 2.57
GDPGP1-203ENST00000558291 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.57
GDPGP1-203ENST00000558291 PBRM1Q86U86 1689 aa31.07■■■□□ 2.56
GDPGP1-203ENST00000558291 TOP2BQ02880 1626 aa31.07■■■□□ 2.56
GDPGP1-203ENST00000558291 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa31.07■■■□□ 2.56
GDPGP1-203ENST00000558291 SYNJ1O43426 1573 aa31.07■■■□□ 2.56
GDPGP1-203ENST00000558291 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP31.05■■■□□ 2.56
GDPGP1-203ENST00000558291 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.03■■■□□ 2.56
GDPGP1-203ENST00000558291 ARAP1Q96P48 1450 aa30.92■■■□□ 2.54
GDPGP1-203ENST00000558291 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.87■■■□□ 2.53
GDPGP1-203ENST00000558291 ADAMTS12P58397 1594 aa30.81■■■□□ 2.52
GDPGP1-203ENST00000558291 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.81■■■□□ 2.52
GDPGP1-203ENST00000558291 GRIN2AQ12879 1464 aa30.79■■■□□ 2.52
GDPGP1-203ENST00000558291 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.76■■■□□ 2.51
GDPGP1-203ENST00000558291 NUP160Q12769 1436 aa30.71■■■□□ 2.51
GDPGP1-203ENST00000558291 CEP170Q5SW79 1584 aa30.62■■■□□ 2.49
GDPGP1-203ENST00000558291 SHROOM2Q13796 1616 aa30.56■■■□□ 2.48
GDPGP1-203ENST00000558291 KIF27Q86VH2 1401 aa30.47■■■□□ 2.47
GDPGP1-203ENST00000558291 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.44■■■□□ 2.46
GDPGP1-203ENST00000558291 CUL7Q14999 1698 aa30.42■■■□□ 2.46
GDPGP1-203ENST00000558291 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.39■■■□□ 2.46
GDPGP1-203ENST00000558291 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.37■■■□□ 2.45
GDPGP1-203ENST00000558291 IGF1RP08069 1367 aa30.35■■■□□ 2.45
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