RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558278.1

HOMEZ-202, Transcript of homeobox and leucine zipper encoding, humanhuman

TSL 4

Gene HOMEZ, Length 563 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMEZ-202ENST00000558278 NISCHQ9Y2I1 1504 aa51.59■■■■■ 5.85
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HOMEZ-202ENST00000558278 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa46.24■■■■■ 4.99
HOMEZ-202ENST00000558278 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa44.11■■■■■ 4.65
HOMEZ-202ENST00000558278 DNAJC5BQ9UF47 199 aa43.89■■■■■ 4.62
HOMEZ-202ENST00000558278 NACADO15069 1562 aa43.78■■■■■ 4.6
HOMEZ-202ENST00000558278 DCAF8L2P0C7V8 631 aa43.73■■■■■ 4.59
HOMEZ-202ENST00000558278 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP43.37■■■■■ 4.53
HOMEZ-202ENST00000558278 UNC13AQ9UPW8 1703 aa43.18■■■■■ 4.5
HOMEZ-202ENST00000558278 MYO15BQ96JP2 1530 aa43.11■■■■■ 4.49
HOMEZ-202ENST00000558278 BICRAQ9NZM4 1560 aa42.92■■■■■ 4.46
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HOMEZ-202ENST00000558278 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa42.53■■■■■ 4.4
HOMEZ-202ENST00000558278 SCRIBQ14160 1630 aa42.23■■■■■ 4.35
HOMEZ-202ENST00000558278 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa42.15■■■■■ 4.34
HOMEZ-202ENST00000558278 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa41.98■■■■■ 4.31
HOMEZ-202ENST00000558278 CECR2Q9BXF3 1484 aa41.87■■■■■ 4.29
HOMEZ-202ENST00000558278 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP41.84■■■■■ 4.29
HOMEZ-202ENST00000558278 NCAPD3P42695 1498 aa40.47■■■■■ 4.07
HOMEZ-202ENST00000558278 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa40.35■■■■■ 4.05
HOMEZ-202ENST00000558278 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.29■■■■■ 4.04
HOMEZ-202ENST00000558278 SMARCA4P51532 1647 aa40.24■■■■■ 4.03
HOMEZ-202ENST00000558278 SMARCA2P51531 1590 aa40.15■■■■■ 4.02
HOMEZ-202ENST00000558278 ERCC6Q03468 1493 aa40.1■■■■■ 4.01
HOMEZ-202ENST00000558278 HMGXB3Q12766 1538 aa40.09■■■■■ 4.01
HOMEZ-202ENST00000558278 CUX2O14529 1486 aa40.03■■■■■ 4
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HOMEZ-202ENST00000558278 NESP48681 1621 aa39.96■■■■□ 3.99
HOMEZ-202ENST00000558278 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.91■■■■□ 3.98
HOMEZ-202ENST00000558278 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.83■■■■□ 3.97
HOMEZ-202ENST00000558278 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.8■■■■□ 3.96
HOMEZ-202ENST00000558278 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa39.53■■■■□ 3.92
HOMEZ-202ENST00000558278 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP39.47■■■■□ 3.91
HOMEZ-202ENST00000558278 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa39.36■■■■□ 3.89
HOMEZ-202ENST00000558278 PDS5BQ9NTI5 1447 aa39.33■■■■□ 3.89
HOMEZ-202ENST00000558278 WIZO95785 1651 aa39.32■■■■□ 3.88
HOMEZ-202ENST00000558278 CADPSQ9ULU8 1353 aa39.26■■■■□ 3.88
HOMEZ-202ENST00000558278 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.99■■■■□ 3.83
HOMEZ-202ENST00000558278 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.93■■■■□ 3.82
HOMEZ-202ENST00000558278 WDR62O43379 1518 aa38.9■■■■□ 3.82
HOMEZ-202ENST00000558278 CEP164Q9UPV0 1460 aa38.81■■■■□ 3.8
HOMEZ-202ENST00000558278 FANCD2Q9BXW9 1451 aa38.8■■■■□ 3.8
HOMEZ-202ENST00000558278 CFTRP13569 1480 aa38.77■■■■□ 3.8
HOMEZ-202ENST00000558278 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
HOMEZ-202ENST00000558278 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
HOMEZ-202ENST00000558278 TRIM41Q8WV44 630 aa38.49■■■■□ 3.75
HOMEZ-202ENST00000558278 CCDC88BA6NC98 1476 aa38.38■■■■□ 3.73
HOMEZ-202ENST00000558278 OSCARQ8IYS5 282 aa38.3■■■■□ 3.72
HOMEZ-202ENST00000558278 PRDM2Q13029 1718 aa38.27■■■■□ 3.72
HOMEZ-202ENST00000558278 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
HOMEZ-202ENST00000558278 TOPBP1Q92547 1522 aa38.06■■■■□ 3.68
HOMEZ-202ENST00000558278 IFT140Q96RY7 1462 aa38.04■■■■□ 3.68
HOMEZ-202ENST00000558278 ABCC8Q09428 1581 aa37.89■■■■□ 3.66
HOMEZ-202ENST00000558278 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.86■■■■□ 3.65
HOMEZ-202ENST00000558278 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
HOMEZ-202ENST00000558278 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.77■■■■□ 3.64
HOMEZ-202ENST00000558278 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.77■■■■□ 3.64
HOMEZ-202ENST00000558278 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.77■■■■□ 3.64
HOMEZ-202ENST00000558278 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP37.74■■■■□ 3.635e-9■■■■■ 28.3
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HOMEZ-202ENST00000558278 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP37.66■■■■□ 3.62
HOMEZ-202ENST00000558278 ARHGEF11O15085 1522 aa37.62■■■■□ 3.61
HOMEZ-202ENST00000558278 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa37.58■■■■□ 3.61
HOMEZ-202ENST00000558278 CHD1O14646 1710 aa37.55■■■■□ 3.6
HOMEZ-202ENST00000558278 FBLN2P98095 1184 aa37.53■■■■□ 3.6
HOMEZ-202ENST00000558278 SOGA1O94964 1423 aa37.52■■■■□ 3.6
HOMEZ-202ENST00000558278 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
HOMEZ-202ENST00000558278 CYB5RLQ6IPT4 315 aa37.46■■■■□ 3.59
HOMEZ-202ENST00000558278 FGD5Q6ZNL6 1462 aa37.41■■■■□ 3.58
HOMEZ-202ENST00000558278 CUX1P39880 1505 aa37.38■■■■□ 3.57
HOMEZ-202ENST00000558278 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa37.29■■■■□ 3.56
HOMEZ-202ENST00000558278 ARAP1Q96P48 1450 aa37.27■■■■□ 3.56
HOMEZ-202ENST00000558278 WDR97A6NE52 1622 aa37.21■■■■□ 3.55
HOMEZ-202ENST00000558278 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.2■■■■□ 3.55
HOMEZ-202ENST00000558278 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
HOMEZ-202ENST00000558278 GRIN2BQ13224 1484 aa37.15■■■■□ 3.54
HOMEZ-202ENST00000558278 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.54
HOMEZ-202ENST00000558278 CLASP1Q7Z460 1538 aa37.1■■■■□ 3.53
HOMEZ-202ENST00000558278 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.06■■■■□ 3.52
HOMEZ-202ENST00000558278 SYNJ2O15056 1496 aa37.04■■■■□ 3.52
HOMEZ-202ENST00000558278 SYNJ1O43426 1573 aa37.04■■■■□ 3.52
HOMEZ-202ENST00000558278 GAPVD1Q14C86 1478 aa37.02■■■■□ 3.52
HOMEZ-202ENST00000558278 PBRM1Q86U86 1689 aa36.98■■■■□ 3.51
HOMEZ-202ENST00000558278 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.95■■■■□ 3.51
HOMEZ-202ENST00000558278 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.89■■■■□ 3.5
HOMEZ-202ENST00000558278 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.78■■■■□ 3.48
HOMEZ-202ENST00000558278 TOP2BQ02880 1626 aa36.7■■■■□ 3.47
HOMEZ-202ENST00000558278 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.69■■■■□ 3.46
HOMEZ-202ENST00000558278 GRIN2AQ12879 1464 aa36.68■■■■□ 3.46
HOMEZ-202ENST00000558278 ADAMTS12P58397 1594 aa36.61■■■■□ 3.45
HOMEZ-202ENST00000558278 ERCC6L2Q5T890 1561 aa36.61■■■■□ 3.45
HOMEZ-202ENST00000558278 CEP170Q5SW79 1584 aa36.58■■■■□ 3.45
HOMEZ-202ENST00000558278 NUP160Q12769 1436 aa36.56■■■■□ 3.44
HOMEZ-202ENST00000558278 FHAD1B1AJZ9 1412 aa36.53■■■■□ 3.44
HOMEZ-202ENST00000558278 ERICH3Q5RHP9 1530 aa36.46■■■■□ 3.43
HOMEZ-202ENST00000558278 SHROOM2Q13796 1616 aa36.4■■■■□ 3.42
HOMEZ-202ENST00000558278 JPH4Q96JJ6 628 aa36.28■■■■□ 3.4
HOMEZ-202ENST00000558278 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP36.26■■■■□ 3.4
HOMEZ-202ENST00000558278 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa36.1■■■■□ 3.37
HOMEZ-202ENST00000558278 IGF1RP08069 1367 aa36.08■■■■□ 3.37
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