RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558193.5

IPO4-204, Transcript of importin 4, humanhuman

TSL 4

Gene IPO4, Length 555 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IPO4-204ENST00000558193 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.97■■■■■ 5.59
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IPO4-204ENST00000558193 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.99■■■■■ 4.47
IPO4-204ENST00000558193 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.91■■■■■ 4.46
IPO4-204ENST00000558193 NACADO15069 1562 aa42.57■■■■■ 4.41
IPO4-204ENST00000558193 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.48■■■■■ 4.39
IPO4-204ENST00000558193 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.28■■■■■ 4.362e-6■□□□□ 9.6
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IPO4-204ENST00000558193 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.78■■■■■ 4.28
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IPO4-204ENST00000558193 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.16■■■■■ 4.18
IPO4-204ENST00000558193 SCRIBQ14160 1630 aa41.09■■■■■ 4.17
IPO4-204ENST00000558193 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.03■■■■■ 4.16
IPO4-204ENST00000558193 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.98■■■■■ 4.15
IPO4-204ENST00000558193 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.91■■■■■ 4.14
IPO4-204ENST00000558193 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.79■■■■■ 4.12
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IPO4-204ENST00000558193 SMARCA4P51532 1647 aa39.09■■■■□ 3.85
IPO4-204ENST00000558193 SMARCA2P51531 1590 aa39.04■■■■□ 3.84
IPO4-204ENST00000558193 HMGXB3Q12766 1538 aa38.99■■■■□ 3.83
IPO4-204ENST00000558193 NESP48681 1621 aa38.94■■■■□ 3.82
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IPO4-204ENST00000558193 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.56■■■■□ 3.76
IPO4-204ENST00000558193 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.56■■■■□ 3.76
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IPO4-204ENST00000558193 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.41■■■■□ 3.74
IPO4-204ENST00000558193 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.29■■■■□ 3.72
IPO4-204ENST00000558193 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.12■■■■□ 3.69
IPO4-204ENST00000558193 WIZO95785 1651 aa38.11■■■■□ 3.69
IPO4-204ENST00000558193 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.02■■■■□ 3.68
IPO4-204ENST00000558193 WDR62O43379 1518 aa37.92■■■■□ 3.66
IPO4-204ENST00000558193 TRIM41Q8WV44 630 aa37.85■■■■□ 3.65
IPO4-204ENST00000558193 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.81■■■■□ 3.64
IPO4-204ENST00000558193 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.74■■■■□ 3.63
IPO4-204ENST00000558193 CFTRP13569 1480 aa37.61■■■■□ 3.61
IPO4-204ENST00000558193 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.6■■■■□ 3.61
IPO4-204ENST00000558193 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.53■■■■□ 3.6
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IPO4-204ENST00000558193 OSCARQ8IYS5 282 aa37.36■■■■□ 3.57
IPO4-204ENST00000558193 PRDM2Q13029 1718 aa37.23■■■■□ 3.55
IPO4-204ENST00000558193 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.13■■■■□ 3.54
IPO4-204ENST00000558193 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
IPO4-204ENST00000558193 IFT140Q96RY7 1462 aa37.03■■■■□ 3.52
IPO4-204ENST00000558193 TOPBP1Q92547 1522 aa36.99■■■■□ 3.51
IPO4-204ENST00000558193 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.97■■■■□ 3.51
IPO4-204ENST00000558193 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.97■■■■□ 3.51
IPO4-204ENST00000558193 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.97■■■■□ 3.51
IPO4-204ENST00000558193 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
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IPO4-204ENST00000558193 ABCC8Q09428 1581 aa36.78■■■■□ 3.48
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IPO4-204ENST00000558193 FBLN2P98095 1184 aa36.58■■■■□ 3.45
IPO4-204ENST00000558193 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.51■■■■□ 3.44
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IPO4-204ENST00000558193 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.43■■■■□ 3.42
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IPO4-204ENST00000558193 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.33■■■■□ 3.41
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IPO4-204ENST00000558193 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.31■■■■□ 3.4
IPO4-204ENST00000558193 CUX1P39880 1505 aa36.24■■■■□ 3.39
IPO4-204ENST00000558193 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.18■■■■□ 3.38
IPO4-204ENST00000558193 WDR97A6NE52 1622 aa36.17■■■■□ 3.38
IPO4-204ENST00000558193 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.17■■■■□ 3.38
IPO4-204ENST00000558193 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
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IPO4-204ENST00000558193 SYNJ1O43426 1573 aa36.11■■■■□ 3.37
IPO4-204ENST00000558193 SYNJ2O15056 1496 aa36.04■■■■□ 3.36
IPO4-204ENST00000558193 PBRM1Q86U86 1689 aa36■■■■□ 3.35
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IPO4-204ENST00000558193 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.85■■■■□ 3.33
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IPO4-204ENST00000558193 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.81■■■■□ 3.32
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IPO4-204ENST00000558193 GRIN2AQ12879 1464 aa35.67■■■■□ 3.3
IPO4-204ENST00000558193 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.64■■■■□ 3.3
IPO4-204ENST00000558193 ADAMTS12P58397 1594 aa35.63■■■■□ 3.29
IPO4-204ENST00000558193 CEP170Q5SW79 1584 aa35.59■■■■□ 3.29
IPO4-204ENST00000558193 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.54■■■■□ 3.28
IPO4-204ENST00000558193 NUP160Q12769 1436 aa35.53■■■■□ 3.28
IPO4-204ENST00000558193 TOP2BQ02880 1626 aa35.53■■■■□ 3.28
IPO4-204ENST00000558193 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.5■■■■□ 3.27
IPO4-204ENST00000558193 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.46■■■■□ 3.27
IPO4-204ENST00000558193 SHROOM2Q13796 1616 aa35.41■■■■□ 3.26
IPO4-204ENST00000558193 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.37■■■■□ 3.25
IPO4-204ENST00000558193 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.27■■■■□ 3.24
IPO4-204ENST00000558193 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.18■■■■□ 3.22
IPO4-204ENST00000558193 JPH4Q96JJ6 628 aa35.18■■■■□ 3.22
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