RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558139.1

LHX4-202, Transcript of LIM homeobox 4, humanhuman

TSL 3

Gene LHX4, Length 721 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX4-202ENST00000558139 NISCHQ9Y2I1 1504 aa45.2■■■■■ 4.83
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LHX4-202ENST00000558139 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa40.93■■■■■ 4.14
LHX4-202ENST00000558139 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.71■■■■■ 4.11
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LHX4-202ENST00000558139 NACADO15069 1562 aa39.1■■■■□ 3.85
LHX4-202ENST00000558139 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.88■■■■□ 3.81
LHX4-202ENST00000558139 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.49■■■■□ 3.75
LHX4-202ENST00000558139 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.45■■■■□ 3.75
LHX4-202ENST00000558139 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.3■■■■□ 3.72
LHX4-202ENST00000558139 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.19■■■■□ 3.7
LHX4-202ENST00000558139 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.19■■■■□ 3.7
LHX4-202ENST00000558139 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.01■■■■□ 3.67
LHX4-202ENST00000558139 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.91■■■■□ 3.66
LHX4-202ENST00000558139 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.66■■■■□ 3.62
LHX4-202ENST00000558139 SCRIBQ14160 1630 aa37.28■■■■□ 3.56
LHX4-202ENST00000558139 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa37.26■■■■□ 3.55
LHX4-202ENST00000558139 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
LHX4-202ENST00000558139 CUX2O14529 1486 aa36.88■■■■□ 3.5
LHX4-202ENST00000558139 ERCC6Q03468 1493 aa36.59■■■■□ 3.45
LHX4-202ENST00000558139 NCAPD3P42695 1498 aa36.17■■■■□ 3.38
LHX4-202ENST00000558139 TRIM41Q8WV44 630 aa36.15■■■■□ 3.38
LHX4-202ENST00000558139 NESP48681 1621 aa35.9■■■■□ 3.34
LHX4-202ENST00000558139 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa35.87■■■■□ 3.33
LHX4-202ENST00000558139 HMGXB3Q12766 1538 aa35.7■■■■□ 3.31
LHX4-202ENST00000558139 SMARCA2P51531 1590 aa35.68■■■■□ 3.3
LHX4-202ENST00000558139 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
LHX4-202ENST00000558139 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
LHX4-202ENST00000558139 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.46■■■■□ 3.27
LHX4-202ENST00000558139 SMARCA4P51532 1647 aa35.43■■■■□ 3.26
LHX4-202ENST00000558139 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.42■■■■□ 3.26
LHX4-202ENST00000558139 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.26■■■■□ 3.23
LHX4-202ENST00000558139 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP35.17■■■■□ 3.22
LHX4-202ENST00000558139 OSCARQ8IYS5 282 aa35.16■■■■□ 3.22
LHX4-202ENST00000558139 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.12■■■■□ 3.21
LHX4-202ENST00000558139 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.1■■■■□ 3.21
LHX4-202ENST00000558139 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.06■■■■□ 3.2
LHX4-202ENST00000558139 WDR62O43379 1518 aa35■■■■□ 3.19
LHX4-202ENST00000558139 MROH2BQ7Z745 1585 aa34.79■■■■□ 3.16
LHX4-202ENST00000558139 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.73■■■■□ 3.15
LHX4-202ENST00000558139 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.61■■■■□ 3.13
LHX4-202ENST00000558139 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.58■■■■□ 3.13
LHX4-202ENST00000558139 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.58■■■■□ 3.13
LHX4-202ENST00000558139 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.58■■■■□ 3.13
LHX4-202ENST00000558139 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.42■■■■□ 3.1
LHX4-202ENST00000558139 ARHGEF11O15085 1522 aa34.41■■■■□ 3.1
LHX4-202ENST00000558139 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.4■■■■□ 3.1
LHX4-202ENST00000558139 CFTRP13569 1480 aa34.36■■■■□ 3.09
LHX4-202ENST00000558139 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
LHX4-202ENST00000558139 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
LHX4-202ENST00000558139 WIZO95785 1651 aa34.25■■■■□ 3.07
LHX4-202ENST00000558139 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.13■■■■□ 3.05
LHX4-202ENST00000558139 IFT140Q96RY7 1462 aa34.12■■■■□ 3.05
LHX4-202ENST00000558139 ARAP1Q96P48 1450 aa33.99■■■■□ 3.03
LHX4-202ENST00000558139 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP33.87■■■■□ 3.01
LHX4-202ENST00000558139 FBLN2P98095 1184 aa33.86■■■■□ 3.01
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LHX4-202ENST00000558139 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP33.79■■■■□ 3
LHX4-202ENST00000558139 TOPBP1Q92547 1522 aa33.79■■■■□ 3
LHX4-202ENST00000558139 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.73■■■□□ 2.99
LHX4-202ENST00000558139 ABCC8Q09428 1581 aa33.71■■■□□ 2.99
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LHX4-202ENST00000558139 PRDM2Q13029 1718 aa33.64■■■□□ 2.98
LHX4-202ENST00000558139 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.52■■■□□ 2.96
LHX4-202ENST00000558139 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
LHX4-202ENST00000558139 CCDC88BA6NC98 1476 aa33.48■■■□□ 2.95
LHX4-202ENST00000558139 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.42■■■□□ 2.94
LHX4-202ENST00000558139 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.38■■■□□ 2.93
LHX4-202ENST00000558139 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.37■■■□□ 2.93
LHX4-202ENST00000558139 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.37■■■□□ 2.93
LHX4-202ENST00000558139 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.31■■■□□ 2.92
LHX4-202ENST00000558139 SYNJ1O43426 1573 aa33.3■■■□□ 2.92
LHX4-202ENST00000558139 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.29■■■□□ 2.92
LHX4-202ENST00000558139 SOGA1O94964 1423 aa33.28■■■□□ 2.92
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LHX4-202ENST00000558139 WDR97A6NE52 1622 aa33.1■■■□□ 2.89
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LHX4-202ENST00000558139 FGD5Q6ZNL6 1462 aa32.99■■■□□ 2.87
LHX4-202ENST00000558139 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.89■■■□□ 2.86
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LHX4-202ENST00000558139 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.65■■■□□ 2.82
LHX4-202ENST00000558139 CEP170Q5SW79 1584 aa32.64■■■□□ 2.82
LHX4-202ENST00000558139 GRIN2AQ12879 1464 aa32.62■■■□□ 2.81
LHX4-202ENST00000558139 FAM69CQ0P6D2 419 aa32.62■■■□□ 2.81
LHX4-202ENST00000558139 KIF13AQ9H1H9 1805 aa32.59■■■□□ 2.81
LHX4-202ENST00000558139 NUP160Q12769 1436 aa32.58■■■□□ 2.81
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LHX4-202ENST00000558139 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa32.51■■■□□ 2.8
LHX4-202ENST00000558139 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP32.5■■■□□ 2.79
LHX4-202ENST00000558139 ABCC10Q5T3U5 1492 aa32.48■■■□□ 2.79
LHX4-202ENST00000558139 SHROOM2Q13796 1616 aa32.45■■■□□ 2.79
LHX4-202ENST00000558139 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
LHX4-202ENST00000558139 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.38■■■□□ 2.77
LHX4-202ENST00000558139 ADAMTS12P58397 1594 aa32.37■■■□□ 2.77
LHX4-202ENST00000558139 JPH4Q96JJ6 628 aa32.37■■■□□ 2.77
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