RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558118.1

GATM-204, Transcript of glycine amidinotransferase, humanhuman

TSL 4

Gene GATM, Length 554 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATM-204ENST00000558118 NISCHQ9Y2I1 1504 aa56.6■■■■■ 6.65
GATM-204ENST00000558118 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa50.36■■■■■ 5.65
GATM-204ENST00000558118 ABCC9O60706 1549 aa49.36■■■■■ 5.49
GATM-204ENST00000558118 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.45■■■■■ 5.19
GATM-204ENST00000558118 NACADO15069 1562 aa47.4■■■■■ 5.18
GATM-204ENST00000558118 DCAF8L2P0C7V8 631 aa47.28■■■■■ 5.16
GATM-204ENST00000558118 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.12■■■■■ 5.13
GATM-204ENST00000558118 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
GATM-204ENST00000558118 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.86■■■■■ 5.09
GATM-204ENST00000558118 UNC13AQ9UPW8 1703 aa46.4■■■■■ 5.02
GATM-204ENST00000558118 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP46.13■■■■■ 4.98
GATM-204ENST00000558118 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.06■■■■■ 4.96
GATM-204ENST00000558118 SCRIBQ14160 1630 aa45.88■■■■■ 4.94
GATM-204ENST00000558118 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.56■■■■■ 4.88
GATM-204ENST00000558118 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.51■■■■■ 4.88
GATM-204ENST00000558118 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.82■■■■■ 4.77
GATM-204ENST00000558118 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.67■■■■■ 4.74
GATM-204ENST00000558118 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.39■■■■■ 4.7
GATM-204ENST00000558118 SMARCA4P51532 1647 aa43.92■■■■■ 4.62
GATM-204ENST00000558118 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
GATM-204ENST00000558118 NCAPD3P42695 1498 aa43.76■■■■■ 4.6
GATM-204ENST00000558118 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.74■■■■■ 4.59
GATM-204ENST00000558118 SMARCA2P51531 1590 aa43.67■■■■■ 4.58
GATM-204ENST00000558118 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.61■■■■■ 4.57
GATM-204ENST00000558118 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.54■■■■■ 4.56
GATM-204ENST00000558118 HMGXB3Q12766 1538 aa43.5■■■■■ 4.55
GATM-204ENST00000558118 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
GATM-204ENST00000558118 WIZO95785 1651 aa43.11■■■■■ 4.49
GATM-204ENST00000558118 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.08■■■■■ 4.49
GATM-204ENST00000558118 NESP48681 1621 aa42.7■■■■■ 4.43
GATM-204ENST00000558118 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.65■■■■■ 4.42
GATM-204ENST00000558118 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.59■■■■■ 4.41
GATM-204ENST00000558118 ERCC6Q03468 1493 aa42.54■■■■■ 4.4
GATM-204ENST00000558118 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.47■■■■■ 4.39
GATM-204ENST00000558118 PDS5BQ9NTI5 1447 aa42.31■■■■■ 4.36
GATM-204ENST00000558118 CUX2O14529 1486 aa42.19■■■■■ 4.34
GATM-204ENST00000558118 CFTRP13569 1480 aa42.19■■■■■ 4.34
GATM-204ENST00000558118 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa42.18■■■■■ 4.34
GATM-204ENST00000558118 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.17■■■■■ 4.34
GATM-204ENST00000558118 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
GATM-204ENST00000558118 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.94■■■■■ 4.3
GATM-204ENST00000558118 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.89■■■■■ 4.3
GATM-204ENST00000558118 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.86■■■■■ 4.29
GATM-204ENST00000558118 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.83■■■■■ 4.29
GATM-204ENST00000558118 PRDM2Q13029 1718 aa41.82■■■■■ 4.29
GATM-204ENST00000558118 WDR62O43379 1518 aa41.74■■■■■ 4.27
GATM-204ENST00000558118 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.54■■■■■ 4.24
GATM-204ENST00000558118 ABCC8Q09428 1581 aa41.29■■■■■ 4.2
GATM-204ENST00000558118 TOPBP1Q92547 1522 aa41.27■■■■■ 4.2
GATM-204ENST00000558118 DNMBPQ6XZF7 1577 aa41.2■■■■■ 4.19
GATM-204ENST00000558118 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.09■■■■■ 4.17
GATM-204ENST00000558118 IFT140Q96RY7 1462 aa41.04■■■■■ 4.16
GATM-204ENST00000558118 CUX1P39880 1505 aa40.91■■■■■ 4.14
GATM-204ENST00000558118 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.9■■■■■ 4.14
GATM-204ENST00000558118 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
GATM-204ENST00000558118 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
GATM-204ENST00000558118 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.77■■■■■ 4.12
GATM-204ENST00000558118 SOGA1O94964 1423 aa40.75■■■■■ 4.11
GATM-204ENST00000558118 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.72■■■■■ 4.11
GATM-204ENST00000558118 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.66■■■■■ 4.1
GATM-204ENST00000558118 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.098e-6■■■■□ 23.2
GATM-204ENST00000558118 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.59■■■■■ 4.09
GATM-204ENST00000558118 TOP2BQ02880 1626 aa40.53■■■■■ 4.08
GATM-204ENST00000558118 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.53■■■■■ 4.08
GATM-204ENST00000558118 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
GATM-204ENST00000558118 WDR97A6NE52 1622 aa40.52■■■■■ 4.08
GATM-204ENST00000558118 SYNJ1O43426 1573 aa40.49■■■■■ 4.07
GATM-204ENST00000558118 OSCARQ8IYS5 282 aa40.45■■■■■ 4.07
GATM-204ENST00000558118 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa40.41■■■■■ 4.06
GATM-204ENST00000558118 GRIN2BQ13224 1484 aa40.28■■■■■ 4.04
GATM-204ENST00000558118 GAPVD1Q14C86 1478 aa40.26■■■■■ 4.04
GATM-204ENST00000558118 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa40.24■■■■■ 4.03
GATM-204ENST00000558118 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa40.21■■■■■ 4.03
GATM-204ENST00000558118 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP40.19■■■■■ 4.02
GATM-204ENST00000558118 CHD1O14646 1710 aa40.18■■■■■ 4.02
GATM-204ENST00000558118 PBRM1Q86U86 1689 aa40.16■■■■■ 4.02
GATM-204ENST00000558118 FBLN2P98095 1184 aa40.12■■■■■ 4.01
GATM-204ENST00000558118 SYNJ2O15056 1496 aa40.03■■■■■ 4
GATM-204ENST00000558118 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.03■■■■■ 4
GATM-204ENST00000558118 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.91■■■■□ 3.98
GATM-204ENST00000558118 ADAMTS12P58397 1594 aa39.84■■■■□ 3.97
GATM-204ENST00000558118 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.81■■■■□ 3.96
GATM-204ENST00000558118 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.78■■■■□ 3.96
GATM-204ENST00000558118 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.76■■■■□ 3.96
GATM-204ENST00000558118 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.76■■■■□ 3.96
GATM-204ENST00000558118 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.76■■■■□ 3.96
GATM-204ENST00000558118 KIF27Q86VH2 1401 aa39.76■■■■□ 3.96
GATM-204ENST00000558118 GRIN2AQ12879 1464 aa39.75■■■■□ 3.95
GATM-204ENST00000558118 ARHGEF11O15085 1522 aa39.75■■■■□ 3.95
GATM-204ENST00000558118 IGF1RP08069 1367 aa39.67■■■■□ 3.94
GATM-204ENST00000558118 NUP160Q12769 1436 aa39.61■■■■□ 3.93
GATM-204ENST00000558118 TRIM41Q8WV44 630 aa39.59■■■■□ 3.93
GATM-204ENST00000558118 CEP170Q5SW79 1584 aa39.55■■■■□ 3.92
GATM-204ENST00000558118 CUL7Q14999 1698 aa39.5■■■■□ 3.91
GATM-204ENST00000558118 ARAP1Q96P48 1450 aa39.43■■■■□ 3.9
GATM-204ENST00000558118 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.4■■■■□ 3.9
GATM-204ENST00000558118 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa39.39■■■■□ 3.9
GATM-204ENST00000558118 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa39.37■■■■□ 3.89
GATM-204ENST00000558118 SHROOM2Q13796 1616 aa39.32■■■■□ 3.89
GATM-204ENST00000558118 JPH4Q96JJ6 628 aa39.22■■■■□ 3.87
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