RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558086.1

TMC3-AS1-201, TMC3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TMC3-AS1, Length 658 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.38■■■■□ 3.09
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCC9O60706 1549 aa31.01■■■□□ 2.55
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.01■■■□□ 2.55
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.54■■■□□ 2.32
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NACADO15069 1562 aa29.33■■■□□ 2.29
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29.29■■■□□ 2.28
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.97■■■□□ 2.23
TMC3-AS1-201ENST00000558086 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.87■■■□□ 2.21
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.76■■■□□ 2.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.76■■■□□ 2.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.73■■■□□ 2.19
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.49■■■□□ 2.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.43■■■□□ 2.14
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SCRIBQ14160 1630 aa28.07■■■□□ 2.08
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.07■■■□□ 2.08
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.01■■■□□ 2.07
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NCAPD3P42695 1498 aa27.08■■□□□ 1.93
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.07■■□□□ 1.92
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CUX2O14529 1486 aa26.94■■□□□ 1.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.93■■□□□ 1.9
TMC3-AS1-201ENST00000558086 HMGXB3Q12766 1538 aa26.89■■□□□ 1.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMARCA2P51531 1590 aa26.86■■□□□ 1.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SMARCA4P51532 1647 aa26.86■■□□□ 1.89
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERCC6Q03468 1493 aa26.77■■□□□ 1.88
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.71■■□□□ 1.87
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.86
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NESP48681 1621 aa26.61■■□□□ 1.85
TMC3-AS1-201ENST00000558086 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.49■■□□□ 1.83
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.45■■□□□ 1.82
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.3■■□□□ 1.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.28■■□□□ 1.8
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.19■■□□□ 1.78
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.09■■□□□ 1.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WIZO95785 1651 aa26.09■■□□□ 1.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WDR62O43379 1518 aa26.09■■□□□ 1.77
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.91■■□□□ 1.74
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CFTRP13569 1480 aa25.9■■□□□ 1.74
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.87■■□□□ 1.73
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
TMC3-AS1-201ENST00000558086 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRDM2Q13029 1718 aa25.63■■□□□ 1.69
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRIM41Q8WV44 630 aa25.61■■□□□ 1.69
TMC3-AS1-201ENST00000558086 OSCARQ8IYS5 282 aa25.54■■□□□ 1.68
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.47■■□□□ 1.67
TMC3-AS1-201ENST00000558086 IFT140Q96RY7 1462 aa25.44■■□□□ 1.66
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TOPBP1Q92547 1522 aa25.38■■□□□ 1.65
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCC8Q09428 1581 aa25.34■■□□□ 1.65
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
TMC3-AS1-201ENST00000558086 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.29■■□□□ 1.64
TMC3-AS1-201ENST00000558086 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARHGEF11O15085 1522 aa25.22■■□□□ 1.63
TMC3-AS1-201ENST00000558086 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHD1O14646 1710 aa25.09■■□□□ 1.61
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WDR97A6NE52 1622 aa25.01■■□□□ 1.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ARAP1Q96P48 1450 aa24.96■■□□□ 1.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.96■■□□□ 1.59
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SOGA1O94964 1423 aa24.93■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.9■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.89■■□□□ 1.58
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.88■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CUX1P39880 1505 aa24.86■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.85■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-201ENST00000558086 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FBLN2P98095 1184 aa24.81■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRIN2BQ13224 1484 aa24.79■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SYNJ1O43426 1573 aa24.78■■□□□ 1.56
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SYNJ2O15056 1496 aa24.75■■□□□ 1.55
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PBRM1Q86U86 1689 aa24.68■■□□□ 1.54
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.67■■□□□ 1.54
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.66■■□□□ 1.54
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.65■■□□□ 1.54
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.61■■□□□ 1.53
TMC3-AS1-201ENST00000558086 GRIN2AQ12879 1464 aa24.48■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.46■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ADAMTS12P58397 1594 aa24.46■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.46■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 NUP160Q12769 1436 aa24.45■■□□□ 1.51
TMC3-AS1-201ENST00000558086 TOP2BQ02880 1626 aa24.45■■□□□ 1.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 CEP170Q5SW79 1584 aa24.41■■□□□ 1.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SHROOM2Q13796 1616 aa24.4■■□□□ 1.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.39■■□□□ 1.5
TMC3-AS1-201ENST00000558086 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.35■■□□□ 1.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.35■■□□□ 1.49
TMC3-AS1-201ENST00000558086 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
TMC3-AS1-201ENST00000558086 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.14■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
TMC3-AS1-201ENST00000558086 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.11■■□□□ 1.45
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