RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558068.1

JDP2-205, Transcript of Jun dimerization protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene JDP2, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JDP2-205ENST00000558068 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.32■■■■■ 7.89
JDP2-205ENST00000558068 ABCC9O60706 1549 aa57.77■■■■■ 6.84
JDP2-205ENST00000558068 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa57.6■■■■■ 6.81
JDP2-205ENST00000558068 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.89■■■■■ 6.38
JDP2-205ENST00000558068 NACADO15069 1562 aa54.54■■■■■ 6.32
JDP2-205ENST00000558068 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.35■■■■■ 6.29
JDP2-205ENST00000558068 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.35■■■■■ 6.29
JDP2-205ENST00000558068 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.86■■■■■ 6.21
JDP2-205ENST00000558068 MYO15BQ96JP2 1530 aa53.81■■■■■ 6.2
JDP2-205ENST00000558068 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.58■■■■■ 6.17
JDP2-205ENST00000558068 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.37■■■■■ 6.13
JDP2-205ENST00000558068 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.28■■■■■ 6.12
JDP2-205ENST00000558068 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.11■■■■■ 6.09
JDP2-205ENST00000558068 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa52.59■■■■■ 6.01
JDP2-205ENST00000558068 SCRIBQ14160 1630 aa52.55■■■■■ 6
JDP2-205ENST00000558068 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.14■■■■■ 5.94
JDP2-205ENST00000558068 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.04■■■■■ 5.92
JDP2-205ENST00000558068 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.04■■■■■ 5.92
JDP2-205ENST00000558068 NCAPD3P42695 1498 aa50.43■■■■■ 5.66
JDP2-205ENST00000558068 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.26■■■■■ 5.64
JDP2-205ENST00000558068 SMARCA4P51532 1647 aa50.12■■■■■ 5.61
JDP2-205ENST00000558068 SMARCA2P51531 1590 aa50.04■■■■■ 5.6
JDP2-205ENST00000558068 HMGXB3Q12766 1538 aa49.97■■■■■ 5.59
JDP2-205ENST00000558068 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP49.88■■■■■ 5.58
JDP2-205ENST00000558068 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.88■■■■■ 5.58
JDP2-205ENST00000558068 ERCC6Q03468 1493 aa49.83■■■■■ 5.57
JDP2-205ENST00000558068 CUX2O14529 1486 aa49.76■■■■■ 5.56
JDP2-205ENST00000558068 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP49.72■■■■■ 5.55
JDP2-205ENST00000558068 PEG3Q9GZU2 1588 aa49.66■■■■■ 5.54
JDP2-205ENST00000558068 NESP48681 1621 aa49.64■■■■■ 5.54
JDP2-205ENST00000558068 MROH2BQ7Z745 1585 aa49.58■■■■■ 5.53
JDP2-205ENST00000558068 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.2■■■■■ 5.47
JDP2-205ENST00000558068 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.06■■■■■ 5.44
JDP2-205ENST00000558068 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.97■■■■■ 5.43
JDP2-205ENST00000558068 WIZO95785 1651 aa48.91■■■■■ 5.42
JDP2-205ENST00000558068 CADPSQ9ULU8 1353 aa48.9■■■■■ 5.42
JDP2-205ENST00000558068 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.87■■■■■ 5.41
JDP2-205ENST00000558068 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.58■■■■■ 5.37
JDP2-205ENST00000558068 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.55■■■■■ 5.36
JDP2-205ENST00000558068 WDR62O43379 1518 aa48.41■■■■■ 5.34
JDP2-205ENST00000558068 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.33■■■■■ 5.33
JDP2-205ENST00000558068 CFTRP13569 1480 aa48.32■■■■■ 5.33
JDP2-205ENST00000558068 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.3■■■■■ 5.32
JDP2-205ENST00000558068 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.3■■■■■ 5.32
JDP2-205ENST00000558068 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
JDP2-205ENST00000558068 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.83■■■■■ 5.25
JDP2-205ENST00000558068 TRIM41Q8WV44 630 aa47.64■■■■■ 5.22
JDP2-205ENST00000558068 PRDM2Q13029 1718 aa47.61■■■■■ 5.21
JDP2-205ENST00000558068 OSCARQ8IYS5 282 aa47.56■■■■■ 5.2
JDP2-205ENST00000558068 IFT140Q96RY7 1462 aa47.39■■■■■ 5.18
JDP2-205ENST00000558068 TOPBP1Q92547 1522 aa47.38■■■■■ 5.18
JDP2-205ENST00000558068 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.36■■■■■ 5.17
JDP2-205ENST00000558068 ABCC8Q09428 1581 aa47.24■■■■■ 5.15
JDP2-205ENST00000558068 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.16■■■■■ 5.14
JDP2-205ENST00000558068 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47■■■■■ 5.11
JDP2-205ENST00000558068 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP46.94■■■■■ 5.11
JDP2-205ENST00000558068 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.94■■■■■ 5.1
JDP2-205ENST00000558068 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP46.91■■■■■ 5.1
JDP2-205ENST00000558068 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.85■■■■■ 5.09
JDP2-205ENST00000558068 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.85■■■■■ 5.09
JDP2-205ENST00000558068 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.85■■■■■ 5.09
JDP2-205ENST00000558068 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa46.76■■■■■ 5.08
JDP2-205ENST00000558068 ARHGEF11O15085 1522 aa46.74■■■■■ 5.07
JDP2-205ENST00000558068 SOGA1O94964 1423 aa46.71■■■■■ 5.07
JDP2-205ENST00000558068 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.66■■■■■ 5.06
JDP2-205ENST00000558068 FBLN2P98095 1184 aa46.62■■■■■ 5.05
JDP2-205ENST00000558068 CHD1O14646 1710 aa46.6■■■■■ 5.05
JDP2-205ENST00000558068 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.6■■■■■ 5.05
JDP2-205ENST00000558068 CUX1P39880 1505 aa46.57■■■■■ 5.05
JDP2-205ENST00000558068 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.46■■■■■ 5.03
JDP2-205ENST00000558068 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.41■■■■■ 5.02
JDP2-205ENST00000558068 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
JDP2-205ENST00000558068 WDR97A6NE52 1622 aa46.39■■■■■ 5.02
JDP2-205ENST00000558068 ARAP1Q96P48 1450 aa46.31■■■■■ 5
JDP2-205ENST00000558068 GRIN2BQ13224 1484 aa46.28■■■■■ 5
JDP2-205ENST00000558068 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.27■■■■■ 5
JDP2-205ENST00000558068 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.26■■■■■ 5
JDP2-205ENST00000558068 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.17■■■■■ 4.98
JDP2-205ENST00000558068 SYNJ2O15056 1496 aa46.13■■■■■ 4.98
JDP2-205ENST00000558068 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.12■■■■■ 4.97
JDP2-205ENST00000558068 SYNJ1O43426 1573 aa46.08■■■■■ 4.97
JDP2-205ENST00000558068 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.08■■■■■ 4.97
JDP2-205ENST00000558068 PBRM1Q86U86 1689 aa45.97■■■■■ 4.95
JDP2-205ENST00000558068 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa45.95■■■■■ 4.95
JDP2-205ENST00000558068 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.92■■■■■ 4.94
JDP2-205ENST00000558068 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP45.89■■■■■ 4.94
JDP2-205ENST00000558068 TOP2BQ02880 1626 aa45.77■■■■■ 4.92
JDP2-205ENST00000558068 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.73■■■■■ 4.91
JDP2-205ENST00000558068 GRIN2AQ12879 1464 aa45.68■■■■■ 4.9
JDP2-205ENST00000558068 ADAMTS12P58397 1594 aa45.61■■■■■ 4.89
JDP2-205ENST00000558068 NUP160Q12769 1436 aa45.56■■■■■ 4.88
JDP2-205ENST00000558068 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.54■■■■■ 4.88
JDP2-205ENST00000558068 CEP170Q5SW79 1584 aa45.51■■■■■ 4.88
JDP2-205ENST00000558068 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.48■■■■■ 4.87
JDP2-205ENST00000558068 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.47■■■■■ 4.87
JDP2-205ENST00000558068 SHROOM2Q13796 1616 aa45.3■■■■■ 4.84
JDP2-205ENST00000558068 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.13■■■■■ 4.82
JDP2-205ENST00000558068 JPH4Q96JJ6 628 aa45.13■■■■■ 4.82
JDP2-205ENST00000558068 IGF1RP08069 1367 aa44.98■■■■■ 4.79
JDP2-205ENST00000558068 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.96■■■■■ 4.79
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