RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557484.5

GABRA5-211, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, humanhuman

TSL 5

Gene GABRA5, Length 506 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5-211ENST00000557484 NISCHQ9Y2I1 1504 aa75■■■■■ 9.6
GABRA5-211ENST00000557484 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa66.9■■■■■ 8.3
GABRA5-211ENST00000557484 ABCC9O60706 1549 aa65.76■■■■■ 8.12
GABRA5-211ENST00000557484 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa63.2■■■■■ 7.71
GABRA5-211ENST00000557484 NACADO15069 1562 aa63.06■■■■■ 7.69
GABRA5-211ENST00000557484 DCAF8L2P0C7V8 631 aa62.78■■■■■ 7.64
GABRA5-211ENST00000557484 MYO15BQ96JP2 1530 aa62.63■■■■■ 7.62
GABRA5-211ENST00000557484 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP62.34■■■■■ 7.57
GABRA5-211ENST00000557484 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa62.14■■■■■ 7.54
GABRA5-211ENST00000557484 UNC13AQ9UPW8 1703 aa61.63■■■■■ 7.46
GABRA5-211ENST00000557484 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP61.38■■■■■ 7.42
GABRA5-211ENST00000557484 BICRAQ9NZM4 1560 aa61.22■■■■■ 7.39
GABRA5-211ENST00000557484 SCRIBQ14160 1630 aa60.82■■■■■ 7.33
GABRA5-211ENST00000557484 DNAJC5BQ9UF47 199 aa60.82■■■■■ 7.33
GABRA5-211ENST00000557484 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa60.75■■■■■ 7.32
GABRA5-211ENST00000557484 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP59.66■■■■■ 7.14
GABRA5-211ENST00000557484 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa59.51■■■■■ 7.12
GABRA5-211ENST00000557484 CECR2Q9BXF3 1484 aa59.22■■■■■ 7.07
GABRA5-211ENST00000557484 SMARCA4P51532 1647 aa58.23■■■■■ 6.91
GABRA5-211ENST00000557484 NCAPD3P42695 1498 aa58.21■■■■■ 6.91
GABRA5-211ENST00000557484 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP58.18■■■■■ 6.9
GABRA5-211ENST00000557484 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa58.1■■■■■ 6.89
GABRA5-211ENST00000557484 SMARCA2P51531 1590 aa58.05■■■■■ 6.88
GABRA5-211ENST00000557484 HMGXB3Q12766 1538 aa57.82■■■■■ 6.85
GABRA5-211ENST00000557484 PEG3Q9GZU2 1588 aa57.78■■■■■ 6.84
GABRA5-211ENST00000557484 MROH2BQ7Z745 1585 aa57.7■■■■■ 6.83
GABRA5-211ENST00000557484 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP57.56■■■■■ 6.81
GABRA5-211ENST00000557484 WIZO95785 1651 aa57.03■■■■■ 6.72
GABRA5-211ENST00000557484 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP56.94■■■■■ 6.71
GABRA5-211ENST00000557484 ERCC6Q03468 1493 aa56.78■■■■■ 6.68
GABRA5-211ENST00000557484 NESP48681 1621 aa56.74■■■■■ 6.67
GABRA5-211ENST00000557484 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa56.71■■■■■ 6.67
GABRA5-211ENST00000557484 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP56.48■■■■■ 6.63
GABRA5-211ENST00000557484 CADPSQ9ULU8 1353 aa56.47■■■■■ 6.63
GABRA5-211ENST00000557484 CUX2O14529 1486 aa56.45■■■■■ 6.63
GABRA5-211ENST00000557484 PDS5BQ9NTI5 1447 aa56.39■■■■■ 6.62
GABRA5-211ENST00000557484 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa56.07■■■■■ 6.57
GABRA5-211ENST00000557484 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP56.03■■■■■ 6.56
GABRA5-211ENST00000557484 CFTRP13569 1480 aa56.01■■■■■ 6.56
GABRA5-211ENST00000557484 CCDC88BA6NC98 1476 aa55.81■■■■■ 6.53
GABRA5-211ENST00000557484 FANCD2Q9BXW9 1451 aa55.75■■■■■ 6.51
GABRA5-211ENST00000557484 MRC2Q9UBG0 1479 aa55.75■■■■■ 6.51
GABRA5-211ENST00000557484 CEP164Q9UPV0 1460 aa55.73■■■■■ 6.51
GABRA5-211ENST00000557484 WDR62O43379 1518 aa55.57■■■■■ 6.49
GABRA5-211ENST00000557484 PRDM2Q13029 1718 aa55.49■■■■■ 6.47
GABRA5-211ENST00000557484 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa55.3■■■■■ 6.44
GABRA5-211ENST00000557484 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP55.17■■■■■ 6.42
GABRA5-211ENST00000557484 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP55.07■■■■■ 6.41
GABRA5-211ENST00000557484 ABCC8Q09428 1581 aa54.93■■■■■ 6.38
GABRA5-211ENST00000557484 TOPBP1Q92547 1522 aa54.8■■■■■ 6.36
GABRA5-211ENST00000557484 DNMBPQ6XZF7 1577 aa54.7■■■■■ 6.35
GABRA5-211ENST00000557484 IFT140Q96RY7 1462 aa54.62■■■■■ 6.33
GABRA5-211ENST00000557484 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP54.29■■■■■ 6.28
GABRA5-211ENST00000557484 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP54.28■■■■■ 6.28
GABRA5-211ENST00000557484 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
GABRA5-211ENST00000557484 CUX1P39880 1505 aa54.17■■■■■ 6.26
GABRA5-211ENST00000557484 SOGA1O94964 1423 aa54.12■■■■■ 6.25
GABRA5-211ENST00000557484 OSCARQ8IYS5 282 aa54.08■■■■■ 6.25
GABRA5-211ENST00000557484 FGD5Q6ZNL6 1462 aa54.07■■■■■ 6.25
GABRA5-211ENST00000557484 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP54.05■■■■■ 6.24
GABRA5-211ENST00000557484 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa54■■■■■ 6.23
GABRA5-211ENST00000557484 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP53.96■■■■■ 6.23
GABRA5-211ENST00000557484 WDR97A6NE52 1622 aa53.91■■■■■ 6.22
GABRA5-211ENST00000557484 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP53.8■■■■■ 6.2
GABRA5-211ENST00000557484 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP53.71■■■■■ 6.19
GABRA5-211ENST00000557484 TOP2BQ02880 1626 aa53.64■■■■■ 6.18
GABRA5-211ENST00000557484 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa53.61■■■■■ 6.17
GABRA5-211ENST00000557484 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa53.6■■■■■ 6.17
GABRA5-211ENST00000557484 GRIN2BQ13224 1484 aa53.55■■■■■ 6.16
GABRA5-211ENST00000557484 SYNJ1O43426 1573 aa53.49■■■■■ 6.15
GABRA5-211ENST00000557484 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP53.47■■■■■ 6.15
GABRA5-211ENST00000557484 GAPVD1Q14C86 1478 aa53.46■■■■■ 6.15
GABRA5-211ENST00000557484 CHD1O14646 1710 aa53.45■■■■■ 6.15
GABRA5-211ENST00000557484 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa53.43■■■■■ 6.14
GABRA5-211ENST00000557484 FBLN2P98095 1184 aa53.42■■■■■ 6.14
GABRA5-211ENST00000557484 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa53.35■■■■■ 6.13
GABRA5-211ENST00000557484 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP53.3■■■■■ 6.12
GABRA5-211ENST00000557484 PBRM1Q86U86 1689 aa53.28■■■■■ 6.12
GABRA5-211ENST00000557484 SYNJ2O15056 1496 aa53.25■■■■■ 6.11
GABRA5-211ENST00000557484 TRIM41Q8WV44 630 aa53.09■■■■■ 6.09
GABRA5-211ENST00000557484 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa53.08■■■■■ 6.09
GABRA5-211ENST00000557484 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa53.08■■■■■ 6.09
GABRA5-211ENST00000557484 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa53.08■■■■■ 6.09
GABRA5-211ENST00000557484 ARHGEF11O15085 1522 aa53.06■■■■■ 6.08
GABRA5-211ENST00000557484 ERICH3Q5RHP9 1530 aa52.98■■■■■ 6.07
GABRA5-211ENST00000557484 CLASP1Q7Z460 1538 aa52.93■■■■■ 6.06
GABRA5-211ENST00000557484 FHAD1B1AJZ9 1412 aa52.87■■■■■ 6.05
GABRA5-211ENST00000557484 ADAMTS12P58397 1594 aa52.85■■■■■ 6.05
GABRA5-211ENST00000557484 GRIN2AQ12879 1464 aa52.82■■■■■ 6.05
GABRA5-211ENST00000557484 KIF27Q86VH2 1401 aa52.67■■■■■ 6.02
GABRA5-211ENST00000557484 CYB5RLQ6IPT4 315 aa52.64■■■■■ 6.02
GABRA5-211ENST00000557484 NUP160Q12769 1436 aa52.64■■■■■ 6.02
GABRA5-211ENST00000557484 ARAP1Q96P48 1450 aa52.57■■■■■ 6.01
GABRA5-211ENST00000557484 IGF1RP08069 1367 aa52.52■■■■■ 6
GABRA5-211ENST00000557484 CEP170Q5SW79 1584 aa52.5■■■■■ 5.99
GABRA5-211ENST00000557484 CUL7Q14999 1698 aa52.37■■■■■ 5.97
GABRA5-211ENST00000557484 SHROOM2Q13796 1616 aa52.26■■■■■ 5.96
GABRA5-211ENST00000557484 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa52.2■■■■■ 5.95
GABRA5-211ENST00000557484 JPH4Q96JJ6 628 aa52.16■■■■■ 5.94
GABRA5-211ENST00000557484 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa52.08■■■■■ 5.93
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