RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557383.1

RPS6KL1-215, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 595 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-215ENST00000557383 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.57■■■■□ 3.29
RPS6KL1-215ENST00000557383 ABCC9O60706 1549 aa32.05■■■□□ 2.72
RPS6KL1-215ENST00000557383 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32■■■□□ 2.71
RPS6KL1-215ENST00000557383 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa30.49■■■□□ 2.47
RPS6KL1-215ENST00000557383 NACADO15069 1562 aa30.26■■■□□ 2.43
RPS6KL1-215ENST00000557383 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.15■■■□□ 2.42
RPS6KL1-215ENST00000557383 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.98■■■□□ 2.39
RPS6KL1-215ENST00000557383 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.83■■■□□ 2.37
RPS6KL1-215ENST00000557383 UNC13AQ9UPW8 1703 aa29.81■■■□□ 2.36
RPS6KL1-215ENST00000557383 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP29.79■■■□□ 2.36
RPS6KL1-215ENST00000557383 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.61■■■□□ 2.33
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
RPS6KL1-215ENST00000557383 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.4■■■□□ 2.3
RPS6KL1-215ENST00000557383 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.23■■■□□ 2.27
RPS6KL1-215ENST00000557383 SCRIBQ14160 1630 aa29.11■■■□□ 2.25
RPS6KL1-215ENST00000557383 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa28.97■■■□□ 2.23
RPS6KL1-215ENST00000557383 CECR2Q9BXF3 1484 aa28.9■■■□□ 2.22
RPS6KL1-215ENST00000557383 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
RPS6KL1-215ENST00000557383 NCAPD3P42695 1498 aa27.94■■■□□ 2.06
RPS6KL1-215ENST00000557383 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.83■■■□□ 2.04
RPS6KL1-215ENST00000557383 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.78■■■□□ 2.04
RPS6KL1-215ENST00000557383 SMARCA4P51532 1647 aa27.78■■■□□ 2.04
RPS6KL1-215ENST00000557383 SMARCA2P51531 1590 aa27.75■■■□□ 2.03
RPS6KL1-215ENST00000557383 HMGXB3Q12766 1538 aa27.73■■■□□ 2.03
RPS6KL1-215ENST00000557383 CUX2O14529 1486 aa27.7■■■□□ 2.02
RPS6KL1-215ENST00000557383 ERCC6Q03468 1493 aa27.68■■■□□ 2.02
RPS6KL1-215ENST00000557383 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
RPS6KL1-215ENST00000557383 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.55■■■□□ 2
RPS6KL1-215ENST00000557383 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.53■■■□□ 2
RPS6KL1-215ENST00000557383 NESP48681 1621 aa27.5■■□□□ 1.99
RPS6KL1-215ENST00000557383 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.39■■□□□ 1.98
RPS6KL1-215ENST00000557383 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa27.32■■□□□ 1.96
RPS6KL1-215ENST00000557383 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP27.28■■□□□ 1.96
RPS6KL1-215ENST00000557383 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.17■■□□□ 1.94
RPS6KL1-215ENST00000557383 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.16■■□□□ 1.94
RPS6KL1-215ENST00000557383 WIZO95785 1651 aa27.07■■□□□ 1.92
RPS6KL1-215ENST00000557383 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.06■■□□□ 1.92
RPS6KL1-215ENST00000557383 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.93■■□□□ 1.9
RPS6KL1-215ENST00000557383 WDR62O43379 1518 aa26.88■■□□□ 1.89
RPS6KL1-215ENST00000557383 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.8■■□□□ 1.88
RPS6KL1-215ENST00000557383 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
RPS6KL1-215ENST00000557383 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.76■■□□□ 1.87
RPS6KL1-215ENST00000557383 CFTRP13569 1480 aa26.74■■□□□ 1.87
RPS6KL1-215ENST00000557383 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.74■■□□□ 1.87
RPS6KL1-215ENST00000557383 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RPS6KL1-215ENST00000557383 PRDM2Q13029 1718 aa26.5■■□□□ 1.83
RPS6KL1-215ENST00000557383 TRIM41Q8WV44 630 aa26.47■■□□□ 1.83
RPS6KL1-215ENST00000557383 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.42■■□□□ 1.82
RPS6KL1-215ENST00000557383 OSCARQ8IYS5 282 aa26.37■■□□□ 1.81
RPS6KL1-215ENST00000557383 IFT140Q96RY7 1462 aa26.27■■□□□ 1.8
RPS6KL1-215ENST00000557383 TOPBP1Q92547 1522 aa26.24■■□□□ 1.79
RPS6KL1-215ENST00000557383 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
RPS6KL1-215ENST00000557383 ABCC8Q09428 1581 aa26.19■■□□□ 1.78
RPS6KL1-215ENST00000557383 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.15■■□□□ 1.78
RPS6KL1-215ENST00000557383 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
RPS6KL1-215ENST00000557383 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1-215ENST00000557383 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1-215ENST00000557383 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.07■■□□□ 1.76
RPS6KL1-215ENST00000557383 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
RPS6KL1-215ENST00000557383 ARHGEF11O15085 1522 aa25.98■■□□□ 1.75
RPS6KL1-215ENST00000557383 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.97■■□□□ 1.75
RPS6KL1-215ENST00000557383 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
RPS6KL1-215ENST00000557383 CHD1O14646 1710 aa25.93■■□□□ 1.74
RPS6KL1-215ENST00000557383 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.85■■□□□ 1.73
RPS6KL1-215ENST00000557383 SOGA1O94964 1423 aa25.83■■□□□ 1.73
RPS6KL1-215ENST00000557383 FBLN2P98095 1184 aa25.79■■□□□ 1.72
RPS6KL1-215ENST00000557383 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
RPS6KL1-215ENST00000557383 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.79■■□□□ 1.72
RPS6KL1-215ENST00000557383 WDR97A6NE52 1622 aa25.78■■□□□ 1.72
RPS6KL1-215ENST00000557383 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
RPS6KL1-215ENST00000557383 CUX1P39880 1505 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KL1-215ENST00000557383 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.75■■□□□ 1.71
RPS6KL1-215ENST00000557383 ARAP1Q96P48 1450 aa25.72■■□□□ 1.71
RPS6KL1-215ENST00000557383 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1-215ENST00000557383 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1-215ENST00000557383 GRIN2BQ13224 1484 aa25.64■■□□□ 1.69
RPS6KL1-215ENST00000557383 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1-215ENST00000557383 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1-215ENST00000557383 SYNJ1O43426 1573 aa25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1-215ENST00000557383 SYNJ2O15056 1496 aa25.58■■□□□ 1.69
RPS6KL1-215ENST00000557383 PBRM1Q86U86 1689 aa25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1-215ENST00000557383 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1-215ENST00000557383 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1-215ENST00000557383 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1-215ENST00000557383 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
RPS6KL1-215ENST00000557383 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
RPS6KL1-215ENST00000557383 TOP2BQ02880 1626 aa25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1-215ENST00000557383 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.33■■□□□ 1.65
RPS6KL1-215ENST00000557383 GRIN2AQ12879 1464 aa25.31■■□□□ 1.64
RPS6KL1-215ENST00000557383 ADAMTS12P58397 1594 aa25.3■■□□□ 1.64
RPS6KL1-215ENST00000557383 NUP160Q12769 1436 aa25.23■■□□□ 1.63
RPS6KL1-215ENST00000557383 CEP170Q5SW79 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
RPS6KL1-215ENST00000557383 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.21■■□□□ 1.63
RPS6KL1-215ENST00000557383 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.2■■□□□ 1.63
RPS6KL1-215ENST00000557383 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.18■■□□□ 1.62
RPS6KL1-215ENST00000557383 SHROOM2Q13796 1616 aa25.15■■□□□ 1.62
RPS6KL1-215ENST00000557383 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
RPS6KL1-215ENST00000557383 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.95■■□□□ 1.58
RPS6KL1-215ENST00000557383 JPH4Q96JJ6 628 aa24.94■■□□□ 1.58
RPS6KL1-215ENST00000557383 KIF13AQ9H1H9 1805 aa24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms