RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557207.1

GPATCH2L-211, Transcript of G-patch domain containing 2 like, humanhuman

TSL 2

Gene GPATCH2L, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPATCH2L-211ENST00000557207 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.22■■■■■ 4.03
GPATCH2L-211ENST00000557207 ABCC9O60706 1549 aa36.09■■■■□ 3.37
GPATCH2L-211ENST00000557207 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.09■■■■□ 3.37
GPATCH2L-211ENST00000557207 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.36■■■■□ 3.09
GPATCH2L-211ENST00000557207 NACADO15069 1562 aa34.12■■■■□ 3.05
GPATCH2L-211ENST00000557207 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.93■■■■□ 3.02
GPATCH2L-211ENST00000557207 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.8■■■■□ 3
GPATCH2L-211ENST00000557207 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.66■■■□□ 2.98
GPATCH2L-211ENST00000557207 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.59■■■□□ 2.97
GPATCH2L-211ENST00000557207 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.54■■■□□ 2.96
GPATCH2L-211ENST00000557207 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
GPATCH2L-211ENST00000557207 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.35■■■□□ 2.93
GPATCH2L-211ENST00000557207 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.23■■■□□ 2.91
GPATCH2L-211ENST00000557207 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.93■■■□□ 2.86
GPATCH2L-211ENST00000557207 SCRIBQ14160 1630 aa32.91■■■□□ 2.86
GPATCH2L-211ENST00000557207 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.59■■■□□ 2.81
GPATCH2L-211ENST00000557207 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.54■■■□□ 2.8
GPATCH2L-211ENST00000557207 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.51■■■□□ 2.79
GPATCH2L-211ENST00000557207 NCAPD3P42695 1498 aa31.5■■■□□ 2.63
GPATCH2L-211ENST00000557207 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.4■■■□□ 2.62
GPATCH2L-211ENST00000557207 SMARCA4P51532 1647 aa31.38■■■□□ 2.61
GPATCH2L-211ENST00000557207 SMARCA2P51531 1590 aa31.34■■■□□ 2.61
GPATCH2L-211ENST00000557207 HMGXB3Q12766 1538 aa31.29■■■□□ 2.6
GPATCH2L-211ENST00000557207 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31.24■■■□□ 2.59
GPATCH2L-211ENST00000557207 ERCC6Q03468 1493 aa31.18■■■□□ 2.58
GPATCH2L-211ENST00000557207 CUX2O14529 1486 aa31.12■■■□□ 2.57
GPATCH2L-211ENST00000557207 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
GPATCH2L-211ENST00000557207 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.08■■■□□ 2.57
GPATCH2L-211ENST00000557207 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.04■■■□□ 2.56
GPATCH2L-211ENST00000557207 NESP48681 1621 aa31.01■■■□□ 2.55
GPATCH2L-211ENST00000557207 MROH2BQ7Z745 1585 aa31■■■□□ 2.55
GPATCH2L-211ENST00000557207 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.79■■■□□ 2.52
GPATCH2L-211ENST00000557207 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP30.7■■■□□ 2.5
GPATCH2L-211ENST00000557207 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.62■■■□□ 2.49
GPATCH2L-211ENST00000557207 WIZO95785 1651 aa30.62■■■□□ 2.49
GPATCH2L-211ENST00000557207 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.59■■■□□ 2.49
GPATCH2L-211ENST00000557207 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.54■■■□□ 2.48
GPATCH2L-211ENST00000557207 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.37■■■□□ 2.45
GPATCH2L-211ENST00000557207 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.36■■■□□ 2.45
GPATCH2L-211ENST00000557207 WDR62O43379 1518 aa30.29■■■□□ 2.44
GPATCH2L-211ENST00000557207 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
GPATCH2L-211ENST00000557207 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.25■■■□□ 2.43
GPATCH2L-211ENST00000557207 CFTRP13569 1480 aa30.21■■■□□ 2.43
GPATCH2L-211ENST00000557207 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.21■■■□□ 2.43
GPATCH2L-211ENST00000557207 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.96■■■□□ 2.39
GPATCH2L-211ENST00000557207 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.89■■■□□ 2.38
GPATCH2L-211ENST00000557207 PRDM2Q13029 1718 aa29.88■■■□□ 2.37
GPATCH2L-211ENST00000557207 TRIM41Q8WV44 630 aa29.71■■■□□ 2.35
GPATCH2L-211ENST00000557207 OSCARQ8IYS5 282 aa29.66■■■□□ 2.34
GPATCH2L-211ENST00000557207 IFT140Q96RY7 1462 aa29.64■■■□□ 2.34
GPATCH2L-211ENST00000557207 TOPBP1Q92547 1522 aa29.63■■■□□ 2.33
GPATCH2L-211ENST00000557207 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
GPATCH2L-211ENST00000557207 ABCC8Q09428 1581 aa29.56■■■□□ 2.32
GPATCH2L-211ENST00000557207 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.53■■■□□ 2.32
GPATCH2L-211ENST00000557207 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
GPATCH2L-211ENST00000557207 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
GPATCH2L-211ENST00000557207 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
GPATCH2L-211ENST00000557207 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.3■■■□□ 2.28
GPATCH2L-211ENST00000557207 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.29■■■□□ 2.28
GPATCH2L-211ENST00000557207 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.29■■■□□ 2.28
GPATCH2L-211ENST00000557207 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.29■■■□□ 2.28
GPATCH2L-211ENST00000557207 ARHGEF11O15085 1522 aa29.22■■■□□ 2.27
GPATCH2L-211ENST00000557207 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.22■■■□□ 2.27
GPATCH2L-211ENST00000557207 CHD1O14646 1710 aa29.19■■■□□ 2.26
GPATCH2L-211ENST00000557207 SOGA1O94964 1423 aa29.19■■■□□ 2.26
GPATCH2L-211ENST00000557207 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.16■■■□□ 2.26
GPATCH2L-211ENST00000557207 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 CUX1P39880 1505 aa29.13■■■□□ 2.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 FBLN2P98095 1184 aa29.11■■■□□ 2.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 WDR97A6NE52 1622 aa29.09■■■□□ 2.25
GPATCH2L-211ENST00000557207 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.04■■■□□ 2.24
GPATCH2L-211ENST00000557207 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP29.01■■■□□ 2.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.97■■■□□ 2.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 GRIN2BQ13224 1484 aa28.96■■■□□ 2.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
GPATCH2L-211ENST00000557207 ARAP1Q96P48 1450 aa28.93■■■□□ 2.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
GPATCH2L-211ENST00000557207 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.87■■■□□ 2.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 SYNJ1O43426 1573 aa28.86■■■□□ 2.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 SYNJ2O15056 1496 aa28.85■■■□□ 2.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.85■■■□□ 2.21
GPATCH2L-211ENST00000557207 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.82■■■□□ 2.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 PBRM1Q86U86 1689 aa28.82■■■□□ 2.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.79■■■□□ 2.2
GPATCH2L-211ENST00000557207 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.71■■■□□ 2.19
GPATCH2L-211ENST00000557207 TOP2BQ02880 1626 aa28.66■■■□□ 2.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.66■■■□□ 2.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.65■■■□□ 2.18
GPATCH2L-211ENST00000557207 GRIN2AQ12879 1464 aa28.59■■■□□ 2.17
GPATCH2L-211ENST00000557207 ADAMTS12P58397 1594 aa28.58■■■□□ 2.17
GPATCH2L-211ENST00000557207 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.49■■■□□ 2.15
GPATCH2L-211ENST00000557207 NUP160Q12769 1436 aa28.49■■■□□ 2.15
GPATCH2L-211ENST00000557207 CEP170Q5SW79 1584 aa28.48■■■□□ 2.15
GPATCH2L-211ENST00000557207 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.46■■■□□ 2.15
GPATCH2L-211ENST00000557207 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.41■■■□□ 2.14
GPATCH2L-211ENST00000557207 SHROOM2Q13796 1616 aa28.35■■■□□ 2.13
GPATCH2L-211ENST00000557207 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
GPATCH2L-211ENST00000557207 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa28.18■■■□□ 2.1
GPATCH2L-211ENST00000557207 JPH4Q96JJ6 628 aa28.15■■■□□ 2.1
GPATCH2L-211ENST00000557207 KIF27Q86VH2 1401 aa28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.8 ms