RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557189.5

AP1G2-231, Transcript of adaptor related protein complex 1 subunit gamma 2, human

TSL 2

Gene AP1G2, Length 678 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AP1G2-231	ENST00000557189	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		40.05	■■■■■ 4
AP1G2-231	ENST00000557189	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.74	■■■■□ 3.31
AP1G2-231	ENST00000557189	ABCC9	O60706	1549 aa		35.59	■■■■□ 3.29
AP1G2-231	ENST00000557189	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.95	■■■■□ 3.03
AP1G2-231	ENST00000557189	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.92	■■■■□ 3.02
AP1G2-231	ENST00000557189	NACAD	O15069	1562 aa		33.77	■■■■□ 3
AP1G2-231	ENST00000557189	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.34	■■■□□ 2.93
AP1G2-231	ENST00000557189	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	33.25	■■■□□ 2.91
AP1G2-231	ENST00000557189	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
AP1G2-231	ENST00000557189	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		33.12	■■■□□ 2.89
AP1G2-231	ENST00000557189	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33.1	■■■□□ 2.89
AP1G2-231	ENST00000557189	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		33.03	■■■□□ 2.88
AP1G2-231	ENST00000557189	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.89	■■■□□ 2.86
AP1G2-231	ENST00000557189	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.68	■■■□□ 2.82
AP1G2-231	ENST00000557189	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.47	■■■□□ 2.79
AP1G2-231	ENST00000557189	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		32.11	■■■□□ 2.73
AP1G2-231	ENST00000557189	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	32.1	■■■□□ 2.73
AP1G2-231	ENST00000557189	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		32.01	■■■□□ 2.71
AP1G2-231	ENST00000557189	NCAPD3	P42695	1498 aa		31.18	■■■□□ 2.58
AP1G2-231	ENST00000557189	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.16	■■■□□ 2.58
AP1G2-231	ENST00000557189	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		31.14	■■■□□ 2.57
AP1G2-231	ENST00000557189	SMARCA2	P51531	1590 aa		31.07	■■■□□ 2.56
AP1G2-231	ENST00000557189	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	31.07	■■■□□ 2.56
AP1G2-231	ENST00000557189	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.94	■■■□□ 2.54
AP1G2-231	ENST00000557189	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.89	■■■□□ 2.53
AP1G2-231	ENST00000557189	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.87	■■■□□ 2.53
AP1G2-231	ENST00000557189	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.8	■■■□□ 2.52
AP1G2-231	ENST00000557189	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.74	■■■□□ 2.51
AP1G2-231	ENST00000557189	NES	P48681	1621 aa		30.63	■■■□□ 2.49
AP1G2-231	ENST00000557189	WIZ	O95785	1651 aa		30.52	■■■□□ 2.48
AP1G2-231	ENST00000557189	CUX2	O14529	1486 aa		30.49	■■■□□ 2.47
AP1G2-231	ENST00000557189	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.42	■■■□□ 2.46
AP1G2-231	ENST00000557189	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.36	■■■□□ 2.45
AP1G2-231	ENST00000557189	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		30.3	■■■□□ 2.44
AP1G2-231	ENST00000557189	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.29	■■■□□ 2.44
AP1G2-231	ENST00000557189	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		30.21	■■■□□ 2.43
AP1G2-231	ENST00000557189	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.2	■■■□□ 2.42
AP1G2-231	ENST00000557189	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	30.18	■■■□□ 2.42
AP1G2-231	ENST00000557189	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.14	■■■□□ 2.42
AP1G2-231	ENST00000557189	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.99	■■■□□ 2.39
AP1G2-231	ENST00000557189	CFTR	P13569	1480 aa		29.97	■■■□□ 2.39
AP1G2-231	ENST00000557189	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.95	■■■□□ 2.39
AP1G2-231	ENST00000557189	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.94	■■■□□ 2.38
AP1G2-231	ENST00000557189	WDR62	O43379	1518 aa		29.86	■■■□□ 2.37
AP1G2-231	ENST00000557189	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.84	■■■□□ 2.37
AP1G2-231	ENST00000557189	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.65	■■■□□ 2.34
AP1G2-231	ENST00000557189	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.62	■■■□□ 2.33
AP1G2-231	ENST00000557189	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.41	■■■□□ 2.3
AP1G2-231	ENST00000557189	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.39	■■■□□ 2.3
AP1G2-231	ENST00000557189	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.36	■■■□□ 2.29
AP1G2-231	ENST00000557189	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.34	■■■□□ 2.29
AP1G2-231	ENST00000557189	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.29	■■■□□ 2.28
AP1G2-231	ENST00000557189	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		29.27	■■■□□ 2.28
AP1G2-231	ENST00000557189	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
AP1G2-231	ENST00000557189	TRIM41	Q8WV44	630 aa		29.12	■■■□□ 2.25
AP1G2-231	ENST00000557189	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
AP1G2-231	ENST00000557189	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
AP1G2-231	ENST00000557189	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	29.07	■■■□□ 2.24	4e-8	■■■■■ 27
AP1G2-231	ENST00000557189	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	29.06	■■■□□ 2.24
AP1G2-231	ENST00000557189	SOGA1	O94964	1423 aa		29.04	■■■□□ 2.24
AP1G2-231	ENST00000557189	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		29.04	■■■□□ 2.24
AP1G2-231	ENST00000557189	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.98	■■■□□ 2.23
AP1G2-231	ENST00000557189	CUX1	P39880	1505 aa		28.98	■■■□□ 2.23
AP1G2-231	ENST00000557189	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.96	■■■□□ 2.23
AP1G2-231	ENST00000557189	FBLN2	P98095	1184 aa		28.94	■■■□□ 2.22
AP1G2-231	ENST00000557189	CHD1	O14646	1710 aa		28.8	■■■□□ 2.2
AP1G2-231	ENST00000557189	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.76	■■■□□ 2.2
AP1G2-231	ENST00000557189	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.76	■■■□□ 2.19
AP1G2-231	ENST00000557189	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
AP1G2-231	ENST00000557189	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
AP1G2-231	ENST00000557189	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.75	■■■□□ 2.19
AP1G2-231	ENST00000557189	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.74	■■■□□ 2.19
AP1G2-231	ENST00000557189	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.72	■■■□□ 2.19
AP1G2-231	ENST00000557189	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.69	■■■□□ 2.18
AP1G2-231	ENST00000557189	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.66	■■■□□ 2.18
AP1G2-231	ENST00000557189	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.66	■■■□□ 2.18
AP1G2-231	ENST00000557189	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.66	■■■□□ 2.18
AP1G2-231	ENST00000557189	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AP1G2-231	ENST00000557189	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.59	■■■□□ 2.17
AP1G2-231	ENST00000557189	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.58	■■■□□ 2.17
AP1G2-231	ENST00000557189	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.58	■■■□□ 2.17
AP1G2-231	ENST00000557189	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.57	■■■□□ 2.16
AP1G2-231	ENST00000557189	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.57	■■■□□ 2.16
AP1G2-231	ENST00000557189	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AP1G2-231	ENST00000557189	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.54	■■■□□ 2.16
AP1G2-231	ENST00000557189	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.46	■■■□□ 2.15
AP1G2-231	ENST00000557189	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.43	■■■□□ 2.14
AP1G2-231	ENST00000557189	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.34	■■■□□ 2.13
AP1G2-231	ENST00000557189	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.32	■■■□□ 2.12
AP1G2-231	ENST00000557189	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.32	■■■□□ 2.12
AP1G2-231	ENST00000557189	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.29	■■■□□ 2.12
AP1G2-231	ENST00000557189	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
AP1G2-231	ENST00000557189	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.2	■■■□□ 2.1
AP1G2-231	ENST00000557189	NUP160	Q12769	1436 aa		28.19	■■■□□ 2.1
AP1G2-231	ENST00000557189	KIF27	Q86VH2	1401 aa		28.11	■■■□□ 2.09
AP1G2-231	ENST00000557189	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		28.07	■■■□□ 2.08
AP1G2-231	ENST00000557189	IGF1R	P08069	1367 aa		28.05	■■■□□ 2.08
AP1G2-231	ENST00000557189	JPH4	Q96JJ6	628 aa		28.03	■■■□□ 2.08
AP1G2-231	ENST00000557189	SHROOM2	Q13796	1616 aa		28	■■■□□ 2.07
AP1G2-231	ENST00000557189	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	27.99	■■■□□ 2.07

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