RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556785.1

EGLN3-210, Transcript of egl-9 family hypoxia inducible factor 3, humanhuman

TSL 2

Gene EGLN3, Length 864 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGLN3-210ENST00000556785 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP17.58■□□□□ 0.4
EGLN3-210ENST00000556785 NISCHQ9Y2I1 1504 aa17.01■□□□□ 0.31
EGLN3-210ENST00000556785 CHIC1Q5VXU3 224 aa16.71■□□□□ 0.27
EGLN3-210ENST00000556785 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa15.14■□□□□ 0.01
EGLN3-210ENST00000556785 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
EGLN3-210ENST00000556785 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
EGLN3-210ENST00000556785 ABCC9O60706 1549 aa14.75□□□□□ -0.05
EGLN3-210ENST00000556785 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa14.19□□□□□ -0.14
EGLN3-210ENST00000556785 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP14.18□□□□□ -0.14
EGLN3-210ENST00000556785 NACADO15069 1562 aa14.18□□□□□ -0.14
EGLN3-210ENST00000556785 DCAF8L2P0C7V8 631 aa14.13□□□□□ -0.15
EGLN3-210ENST00000556785 MYO15BQ96JP2 1530 aa14.08□□□□□ -0.16
EGLN3-210ENST00000556785 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa14.05□□□□□ -0.16
EGLN3-210ENST00000556785 UNC13AQ9UPW8 1703 aa14.03□□□□□ -0.16
EGLN3-210ENST00000556785 FOXD1Q16676 465 aa13.96□□□□□ -0.17
EGLN3-210ENST00000556785 SCRIBQ14160 1630 aa13.83□□□□□ -0.2
EGLN3-210ENST00000556785 BICRAQ9NZM4 1560 aa13.81□□□□□ -0.2
EGLN3-210ENST00000556785 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP13.76□□□□□ -0.21
EGLN3-210ENST00000556785 PLPPR3Q6T4P5 718 aa13.6□□□□□ -0.23
EGLN3-210ENST00000556785 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa13.58□□□□□ -0.24
EGLN3-210ENST00000556785 DNAJC5BQ9UF47 199 aa13.49□□□□□ -0.25
EGLN3-210ENST00000556785 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP13.41□□□□□ -0.26
EGLN3-210ENST00000556785 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa13.37□□□□□ -0.27
EGLN3-210ENST00000556785 CECR2Q9BXF3 1484 aa13.26□□□□□ -0.29
EGLN3-210ENST00000556785 SMARCA4P51532 1647 aa13.22□□□□□ -0.29
EGLN3-210ENST00000556785 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
EGLN3-210ENST00000556785 MROH2BQ7Z745 1585 aa13.13□□□□□ -0.31
EGLN3-210ENST00000556785 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa13.1□□□□□ -0.31
EGLN3-210ENST00000556785 SMARCA2P51531 1590 aa13.08□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 MSH5O43196 834 aa13.08□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 PEG3Q9GZU2 1588 aa13.07□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 NCAPD3P42695 1498 aa13.06□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.05□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 HMGXB3Q12766 1538 aa13.03□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 WIZO95785 1651 aa13.02□□□□□ -0.32
EGLN3-210ENST00000556785 ADRA2BP18089 450 aa13.02□□□□□ -0.33
EGLN3-210ENST00000556785 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
EGLN3-210ENST00000556785 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
EGLN3-210ENST00000556785 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
EGLN3-210ENST00000556785 NESP48681 1621 aa12.8□□□□□ -0.36
EGLN3-210ENST00000556785 POTEDQ86YR6 584 aa12.74□□□□□ -0.37
EGLN3-210ENST00000556785 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa12.73□□□□□ -0.37
EGLN3-210ENST00000556785 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa12.71□□□□□ -0.37
EGLN3-210ENST00000556785 ERCC6Q03468 1493 aa12.68□□□□□ -0.38
EGLN3-210ENST00000556785 PRDM2Q13029 1718 aa12.68□□□□□ -0.38
EGLN3-210ENST00000556785 CADPSQ9ULU8 1353 aa12.68□□□□□ -0.38
EGLN3-210ENST00000556785 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.67□□□□□ -0.38
EGLN3-210ENST00000556785 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
EGLN3-210ENST00000556785 CFTRP13569 1480 aa12.63□□□□□ -0.39
EGLN3-210ENST00000556785 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
EGLN3-210ENST00000556785 PDS5BQ9NTI5 1447 aa12.6□□□□□ -0.39
EGLN3-210ENST00000556785 FANCD2Q9BXW9 1451 aa12.55□□□□□ -0.4
EGLN3-210ENST00000556785 CEP164Q9UPV0 1460 aa12.53□□□□□ -0.4
EGLN3-210ENST00000556785 CUX2O14529 1486 aa12.53□□□□□ -0.4
EGLN3-210ENST00000556785 MRC2Q9UBG0 1479 aa12.51□□□□□ -0.41
EGLN3-210ENST00000556785 WDR62O43379 1518 aa12.49□□□□□ -0.41
EGLN3-210ENST00000556785 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.42
EGLN3-210ENST00000556785 TOPBP1Q92547 1522 aa12.38□□□□□ -0.43
EGLN3-210ENST00000556785 KCNA4P22459 653 aa12.38□□□□□ -0.43
EGLN3-210ENST00000556785 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.37□□□□□ -0.43
EGLN3-210ENST00000556785 ABCC8Q09428 1581 aa12.32□□□□□ -0.44
EGLN3-210ENST00000556785 CUX1P39880 1505 aa12.32□□□□□ -0.44
EGLN3-210ENST00000556785 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.44
EGLN3-210ENST00000556785 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.44
EGLN3-210ENST00000556785 IFT140Q96RY7 1462 aa12.26□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.25□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 SYNJ1O43426 1573 aa12.24□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP12.24□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa12.24□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 WDR97A6NE52 1622 aa12.22□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.22□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 TOP2BQ02880 1626 aa12.22□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
EGLN3-210ENST00000556785 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP12.2□□□□□ -0.46
EGLN3-210ENST00000556785 SOGA1O94964 1423 aa12.18□□□□□ -0.46
EGLN3-210ENST00000556785 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.15□□□□□ -0.462e-8■■■■□ 23.1
EGLN3-210ENST00000556785 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.14□□□□□ -0.47
EGLN3-210ENST00000556785 PBRM1Q86U86 1689 aa12.13□□□□□ -0.47
EGLN3-210ENST00000556785 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
EGLN3-210ENST00000556785 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa12.12□□□□□ -0.47
EGLN3-210ENST00000556785 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa12.11□□□□□ -0.47
EGLN3-210ENST00000556785 CHD1O14646 1710 aa12.11□□□□□ -0.47
EGLN3-210ENST00000556785 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa12.08□□□□□ -0.48
EGLN3-210ENST00000556785 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa12.07□□□□□ -0.48
EGLN3-210ENST00000556785 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.06□□□□□ -0.48
EGLN3-210ENST00000556785 GRIN2BQ13224 1484 aa12.05□□□□□ -0.48
EGLN3-210ENST00000556785 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.05□□□□□ -0.48
EGLN3-210ENST00000556785 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
EGLN3-210ENST00000556785 ADAMTS12P58397 1594 aa11.99□□□□□ -0.49
EGLN3-210ENST00000556785 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.97□□□□□ -0.49
EGLN3-210ENST00000556785 SYNJ2O15056 1496 aa11.97□□□□□ -0.49
EGLN3-210ENST00000556785 OSCARQ8IYS5 282 aa11.97□□□□□ -0.49
EGLN3-210ENST00000556785 FBLN2P98095 1184 aa11.96□□□□□ -0.49
EGLN3-210ENST00000556785 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
EGLN3-210ENST00000556785 KIF27Q86VH2 1401 aa11.93□□□□□ -0.5
EGLN3-210ENST00000556785 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
EGLN3-210ENST00000556785 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
EGLN3-210ENST00000556785 GRIN2AQ12879 1464 aa11.91□□□□□ -0.5
EGLN3-210ENST00000556785 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.8 ms