RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556776.1

RPS6KL1-213, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 4

Gene RPS6KL1, Length 583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-213ENST00000556776 NISCHQ9Y2I1 1504 aa48.02■■■■■ 5.28
RPS6KL1-213ENST00000556776 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa43.11■■■■■ 4.49
RPS6KL1-213ENST00000556776 ABCC9O60706 1549 aa42.71■■■■■ 4.43
RPS6KL1-213ENST00000556776 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa40.88■■■■■ 4.13
RPS6KL1-213ENST00000556776 NACADO15069 1562 aa40.65■■■■■ 4.1
RPS6KL1-213ENST00000556776 DCAF8L2P0C7V8 631 aa40.41■■■■■ 4.06
RPS6KL1-213ENST00000556776 MYO15BQ96JP2 1530 aa40.16■■■■■ 4.02
RPS6KL1-213ENST00000556776 UNC13AQ9UPW8 1703 aa40■■■■□ 3.99
RPS6KL1-213ENST00000556776 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
RPS6KL1-213ENST00000556776 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP39.75■■■■□ 3.95
RPS6KL1-213ENST00000556776 DNAJC5BQ9UF47 199 aa39.75■■■■□ 3.95
RPS6KL1-213ENST00000556776 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa39.73■■■■□ 3.95
RPS6KL1-213ENST00000556776 BICRAQ9NZM4 1560 aa39.59■■■■□ 3.93
RPS6KL1-213ENST00000556776 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa39.18■■■■□ 3.86
RPS6KL1-213ENST00000556776 SCRIBQ14160 1630 aa39.18■■■■□ 3.86
RPS6KL1-213ENST00000556776 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa38.66■■■■□ 3.78
RPS6KL1-213ENST00000556776 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP38.63■■■■□ 3.77
RPS6KL1-213ENST00000556776 CECR2Q9BXF3 1484 aa38.47■■■■□ 3.75
RPS6KL1-213ENST00000556776 NCAPD3P42695 1498 aa37.46■■■■□ 3.59
RPS6KL1-213ENST00000556776 SMARCA4P51532 1647 aa37.43■■■■□ 3.58
RPS6KL1-213ENST00000556776 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa37.36■■■■□ 3.57
RPS6KL1-213ENST00000556776 SMARCA2P51531 1590 aa37.36■■■■□ 3.57
RPS6KL1-213ENST00000556776 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP37.31■■■■□ 3.56
RPS6KL1-213ENST00000556776 HMGXB3Q12766 1538 aa37.25■■■■□ 3.55
RPS6KL1-213ENST00000556776 PEG3Q9GZU2 1588 aa37.08■■■■□ 3.53
RPS6KL1-213ENST00000556776 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP37.06■■■■□ 3.52
RPS6KL1-213ENST00000556776 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.95■■■■□ 3.51
RPS6KL1-213ENST00000556776 ERCC6Q03468 1493 aa36.93■■■■□ 3.5
RPS6KL1-213ENST00000556776 CUX2O14529 1486 aa36.8■■■■□ 3.48
RPS6KL1-213ENST00000556776 NESP48681 1621 aa36.74■■■■□ 3.47
RPS6KL1-213ENST00000556776 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa36.66■■■■□ 3.46
RPS6KL1-213ENST00000556776 WIZO95785 1651 aa36.58■■■■□ 3.45
RPS6KL1-213ENST00000556776 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.44■■■■□ 3.42
RPS6KL1-213ENST00000556776 PDS5BQ9NTI5 1447 aa36.41■■■■□ 3.42
RPS6KL1-213ENST00000556776 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa36.39■■■■□ 3.42
RPS6KL1-213ENST00000556776 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP36.39■■■■□ 3.42
RPS6KL1-213ENST00000556776 CADPSQ9ULU8 1353 aa36.33■■■■□ 3.41
RPS6KL1-213ENST00000556776 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP36.27■■■■□ 3.4
RPS6KL1-213ENST00000556776 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
RPS6KL1-213ENST00000556776 MRC2Q9UBG0 1479 aa36.05■■■■□ 3.36
RPS6KL1-213ENST00000556776 CFTRP13569 1480 aa35.97■■■■□ 3.35
RPS6KL1-213ENST00000556776 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.97■■■■□ 3.35
RPS6KL1-213ENST00000556776 WDR62O43379 1518 aa35.95■■■■□ 3.35
RPS6KL1-213ENST00000556776 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.92■■■■□ 3.34
RPS6KL1-213ENST00000556776 PRDM2Q13029 1718 aa35.83■■■■□ 3.33
RPS6KL1-213ENST00000556776 CCDC88BA6NC98 1476 aa35.68■■■■□ 3.3
RPS6KL1-213ENST00000556776 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP35.57■■■■□ 3.29
RPS6KL1-213ENST00000556776 ABCC8Q09428 1581 aa35.31■■■■□ 3.24
RPS6KL1-213ENST00000556776 TOPBP1Q92547 1522 aa35.27■■■■□ 3.24
RPS6KL1-213ENST00000556776 IFT140Q96RY7 1462 aa35.23■■■■□ 3.23
RPS6KL1-213ENST00000556776 DNMBPQ6XZF7 1577 aa35.2■■■■□ 3.23
RPS6KL1-213ENST00000556776 OSCARQ8IYS5 282 aa35.14■■■■□ 3.22
RPS6KL1-213ENST00000556776 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP35.07■■■■□ 3.21
RPS6KL1-213ENST00000556776 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.98■■■■□ 3.19
RPS6KL1-213ENST00000556776 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
RPS6KL1-213ENST00000556776 TRIM41Q8WV44 630 aa34.92■■■■□ 3.18
RPS6KL1-213ENST00000556776 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.9■■■■□ 3.18
RPS6KL1-213ENST00000556776 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.85■■■■□ 3.17
RPS6KL1-213ENST00000556776 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.8■■■■□ 3.16
RPS6KL1-213ENST00000556776 SOGA1O94964 1423 aa34.78■■■■□ 3.16
RPS6KL1-213ENST00000556776 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.74■■■■□ 3.15
RPS6KL1-213ENST00000556776 FGD5Q6ZNL6 1462 aa34.73■■■■□ 3.15
RPS6KL1-213ENST00000556776 CHD1O14646 1710 aa34.73■■■■□ 3.15
RPS6KL1-213ENST00000556776 CUX1P39880 1505 aa34.72■■■■□ 3.15
RPS6KL1-213ENST00000556776 WDR97A6NE52 1622 aa34.72■■■■□ 3.15
RPS6KL1-213ENST00000556776 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa34.66■■■■□ 3.14
RPS6KL1-213ENST00000556776 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa34.66■■■■□ 3.14
RPS6KL1-213ENST00000556776 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa34.66■■■■□ 3.14
RPS6KL1-213ENST00000556776 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP34.62■■■■□ 3.13
RPS6KL1-213ENST00000556776 FBLN2P98095 1184 aa34.56■■■■□ 3.12
RPS6KL1-213ENST00000556776 ARHGEF11O15085 1522 aa34.55■■■■□ 3.12
RPS6KL1-213ENST00000556776 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa34.48■■■■□ 3.11
RPS6KL1-213ENST00000556776 GRIN2BQ13224 1484 aa34.46■■■■□ 3.11
RPS6KL1-213ENST00000556776 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP34.46■■■■□ 3.11
RPS6KL1-213ENST00000556776 PBRM1Q86U86 1689 aa34.43■■■■□ 3.1
RPS6KL1-213ENST00000556776 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
RPS6KL1-213ENST00000556776 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa34.37■■■■□ 3.09
RPS6KL1-213ENST00000556776 GAPVD1Q14C86 1478 aa34.37■■■■□ 3.09
RPS6KL1-213ENST00000556776 SYNJ1O43426 1573 aa34.33■■■■□ 3.09
RPS6KL1-213ENST00000556776 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa34.33■■■■□ 3.09
RPS6KL1-213ENST00000556776 SYNJ2O15056 1496 aa34.33■■■■□ 3.09
RPS6KL1-213ENST00000556776 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa34.32■■■■□ 3.08
RPS6KL1-213ENST00000556776 TOP2BQ02880 1626 aa34.3■■■■□ 3.08
RPS6KL1-213ENST00000556776 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP34.3■■■■□ 3.08
RPS6KL1-213ENST00000556776 CYB5RLQ6IPT4 315 aa34.26■■■■□ 3.08
RPS6KL1-213ENST00000556776 CLASP1Q7Z460 1538 aa34.25■■■■□ 3.07
RPS6KL1-213ENST00000556776 ARAP1Q96P48 1450 aa34.19■■■■□ 3.06
RPS6KL1-213ENST00000556776 ADAMTS12P58397 1594 aa34.03■■■■□ 3.04
RPS6KL1-213ENST00000556776 GRIN2AQ12879 1464 aa34.01■■■■□ 3.03
RPS6KL1-213ENST00000556776 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.99■■■■□ 3.03
RPS6KL1-213ENST00000556776 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.94■■■■□ 3.02
RPS6KL1-213ENST00000556776 NUP160Q12769 1436 aa33.87■■■■□ 3.01
RPS6KL1-213ENST00000556776 CEP170Q5SW79 1584 aa33.86■■■■□ 3.01
RPS6KL1-213ENST00000556776 TRHP20396 242 aaPredicted RBP33.84■■■■□ 3.01
RPS6KL1-213ENST00000556776 SHROOM2Q13796 1616 aa33.75■■■□□ 2.99
RPS6KL1-213ENST00000556776 ERCC6L2Q5T890 1561 aa33.68■■■□□ 2.98
RPS6KL1-213ENST00000556776 KIF27Q86VH2 1401 aa33.62■■■□□ 2.97
RPS6KL1-213ENST00000556776 CUL7Q14999 1698 aa33.59■■■□□ 2.97
RPS6KL1-213ENST00000556776 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa33.54■■■□□ 2.96
RPS6KL1-213ENST00000556776 JPH4Q96JJ6 628 aa33.53■■■□□ 2.96
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