RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556385.5

RIN3-209, Transcript of Ras and Rab interactor 3, humanhuman

TSL 3

Gene RIN3, Length 856 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3-209ENST00000556385 NISCHQ9Y2I1 1504 aa41.58■■■■■ 4.25
RIN3-209ENST00000556385 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.03■■■■□ 3.52
RIN3-209ENST00000556385 ABCC9O60706 1549 aa36.72■■■■□ 3.47
RIN3-209ENST00000556385 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.09■■■■□ 3.21
RIN3-209ENST00000556385 NACADO15069 1562 aa34.9■■■■□ 3.18
RIN3-209ENST00000556385 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.83■■■■□ 3.17
RIN3-209ENST00000556385 MYO15BQ96JP2 1530 aa34.65■■■■□ 3.14
RIN3-209ENST00000556385 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.63■■■■□ 3.13
RIN3-209ENST00000556385 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.48■■■■□ 3.11
RIN3-209ENST00000556385 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.3■■■■□ 3.08
RIN3-209ENST00000556385 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.23■■■■□ 3.07
RIN3-209ENST00000556385 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.2■■■■□ 3.07
RIN3-209ENST00000556385 BICRAQ9NZM4 1560 aa34■■■■□ 3.03
RIN3-209ENST00000556385 SCRIBQ14160 1630 aa33.68■■■□□ 2.98
RIN3-209ENST00000556385 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.6■■■□□ 2.97
RIN3-209ENST00000556385 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.19■■■□□ 2.9
RIN3-209ENST00000556385 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.17■■■□□ 2.9
RIN3-209ENST00000556385 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.06■■■□□ 2.88
RIN3-209ENST00000556385 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
RIN3-209ENST00000556385 SMARCA4P51532 1647 aa32.26■■■□□ 2.75
RIN3-209ENST00000556385 NCAPD3P42695 1498 aa32.2■■■□□ 2.75
RIN3-209ENST00000556385 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.12■■■□□ 2.73
RIN3-209ENST00000556385 SMARCA2P51531 1590 aa32.09■■■□□ 2.73
RIN3-209ENST00000556385 PEG3Q9GZU2 1588 aa31.99■■■□□ 2.71
RIN3-209ENST00000556385 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.98■■■□□ 2.71
RIN3-209ENST00000556385 HMGXB3Q12766 1538 aa31.98■■■□□ 2.71
RIN3-209ENST00000556385 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
RIN3-209ENST00000556385 ERCC6Q03468 1493 aa31.72■■■□□ 2.67
RIN3-209ENST00000556385 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.66■■■□□ 2.66
RIN3-209ENST00000556385 WIZO95785 1651 aa31.65■■■□□ 2.66
RIN3-209ENST00000556385 NESP48681 1621 aa31.59■■■□□ 2.65
RIN3-209ENST00000556385 CUX2O14529 1486 aa31.56■■■□□ 2.64
RIN3-209ENST00000556385 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.46■■■□□ 2.63
RIN3-209ENST00000556385 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
RIN3-209ENST00000556385 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.27■■■□□ 2.6
RIN3-209ENST00000556385 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.27■■■□□ 2.6
RIN3-209ENST00000556385 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.24■■■□□ 2.59
RIN3-209ENST00000556385 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.23■■■□□ 2.59
RIN3-209ENST00000556385 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
RIN3-209ENST00000556385 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.96■■■□□ 2.55
RIN3-209ENST00000556385 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.96■■■□□ 2.55
RIN3-209ENST00000556385 CFTRP13569 1480 aa30.95■■■□□ 2.55
RIN3-209ENST00000556385 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.9■■■□□ 2.54
RIN3-209ENST00000556385 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.88■■■□□ 2.53
RIN3-209ENST00000556385 WDR62O43379 1518 aa30.87■■■□□ 2.53
RIN3-209ENST00000556385 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
RIN3-209ENST00000556385 PRDM2Q13029 1718 aa30.78■■■□□ 2.52
RIN3-209ENST00000556385 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.59■■■□□ 2.49
RIN3-209ENST00000556385 ABCC8Q09428 1581 aa30.37■■■□□ 2.45
RIN3-209ENST00000556385 TOPBP1Q92547 1522 aa30.32■■■□□ 2.44
RIN3-209ENST00000556385 IFT140Q96RY7 1462 aa30.28■■■□□ 2.44
RIN3-209ENST00000556385 DNMBPQ6XZF7 1577 aa30.26■■■□□ 2.43
RIN3-209ENST00000556385 OSCARQ8IYS5 282 aa30.2■■■□□ 2.43
RIN3-209ENST00000556385 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
RIN3-209ENST00000556385 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
RIN3-209ENST00000556385 TRIM41Q8WV44 630 aa30.03■■■□□ 2.4
RIN3-209ENST00000556385 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
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RIN3-209ENST00000556385 CUX1P39880 1505 aa30.01■■■□□ 2.39
RIN3-209ENST00000556385 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
RIN3-209ENST00000556385 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.93■■■□□ 2.38
RIN3-209ENST00000556385 SOGA1O94964 1423 aa29.92■■■□□ 2.38
RIN3-209ENST00000556385 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.9■■■□□ 2.38
RIN3-209ENST00000556385 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP29.88■■■□□ 2.37
RIN3-209ENST00000556385 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.83■■■□□ 2.37
RIN3-209ENST00000556385 WDR97A6NE52 1622 aa29.82■■■□□ 2.36
RIN3-209ENST00000556385 TOP2BQ02880 1626 aa29.82■■■□□ 2.36
RIN3-209ENST00000556385 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
RIN3-209ENST00000556385 CHD1O14646 1710 aa29.79■■■□□ 2.36
RIN3-209ENST00000556385 FBLN2P98095 1184 aa29.76■■■□□ 2.35
RIN3-209ENST00000556385 SYNJ1O43426 1573 aa29.75■■■□□ 2.35
RIN3-209ENST00000556385 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.74■■■□□ 2.35
RIN3-209ENST00000556385 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.74■■■□□ 2.35
RIN3-209ENST00000556385 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.74■■■□□ 2.35
RIN3-209ENST00000556385 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa29.68■■■□□ 2.34
RIN3-209ENST00000556385 ARHGEF11O15085 1522 aa29.66■■■□□ 2.34
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RIN3-209ENST00000556385 GRIN2BQ13224 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
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RIN3-209ENST00000556385 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
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RIN3-209ENST00000556385 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa29.54■■■□□ 2.32
RIN3-209ENST00000556385 PBRM1Q86U86 1689 aa29.53■■■□□ 2.32
RIN3-209ENST00000556385 SYNJ2O15056 1496 aa29.49■■■□□ 2.31
RIN3-209ENST00000556385 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.47■■■□□ 2.31
RIN3-209ENST00000556385 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.41■■■□□ 2.3
RIN3-209ENST00000556385 ARAP1Q96P48 1450 aa29.36■■■□□ 2.29
RIN3-209ENST00000556385 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.35■■■□□ 2.29
RIN3-209ENST00000556385 KIF27Q86VH2 1401 aa29.28■■■□□ 2.28
RIN3-209ENST00000556385 ADAMTS12P58397 1594 aa29.25■■■□□ 2.27
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RIN3-209ENST00000556385 IGF1RP08069 1367 aa29.11■■■□□ 2.25
RIN3-209ENST00000556385 NUP160Q12769 1436 aa29.11■■■□□ 2.25
RIN3-209ENST00000556385 CEP170Q5SW79 1584 aa29.1■■■□□ 2.25
RIN3-209ENST00000556385 CUL7Q14999 1698 aa29.1■■■□□ 2.25
RIN3-209ENST00000556385 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.1■■■□□ 2.25
RIN3-209ENST00000556385 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.96■■■□□ 2.23
RIN3-209ENST00000556385 SHROOM2Q13796 1616 aa28.96■■■□□ 2.23
RIN3-209ENST00000556385 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.96■■■□□ 2.23
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