RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556088.1

NRXN3-212, Transcript of neurexin 3, humanhuman

TSL 3

Gene NRXN3, Length 557 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3-212ENST00000556088 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.63■■■■□ 3.93
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NRXN3-212ENST00000556088 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.01■■■■□ 3.03
NRXN3-212ENST00000556088 DNAJC5BQ9UF47 199 aa33.81■■■■□ 3
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NRXN3-212ENST00000556088 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.5■■■□□ 2.95
NRXN3-212ENST00000556088 UNC13AQ9UPW8 1703 aa33.42■■■□□ 2.94
NRXN3-212ENST00000556088 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP33.33■■■□□ 2.93
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NRXN3-212ENST00000556088 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.1■■■□□ 2.89
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NRXN3-212ENST00000556088 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.67■■■□□ 2.82
NRXN3-212ENST00000556088 SCRIBQ14160 1630 aa32.54■■■□□ 2.8
NRXN3-212ENST00000556088 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa32.48■■■□□ 2.79
NRXN3-212ENST00000556088 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa32.4■■■□□ 2.78
NRXN3-212ENST00000556088 CECR2Q9BXF3 1484 aa32.28■■■□□ 2.76
NRXN3-212ENST00000556088 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
NRXN3-212ENST00000556088 NCAPD3P42695 1498 aa31.1■■■□□ 2.57
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NRXN3-212ENST00000556088 SMARCA4P51532 1647 aa30.99■■■□□ 2.55
NRXN3-212ENST00000556088 ERCC6Q03468 1493 aa30.92■■■□□ 2.54
NRXN3-212ENST00000556088 CUX2O14529 1486 aa30.9■■■□□ 2.54
NRXN3-212ENST00000556088 SMARCA2P51531 1590 aa30.9■■■□□ 2.54
NRXN3-212ENST00000556088 HMGXB3Q12766 1538 aa30.88■■■□□ 2.53
NRXN3-212ENST00000556088 NESP48681 1621 aa30.78■■■□□ 2.52
NRXN3-212ENST00000556088 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.75■■■□□ 2.51
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NRXN3-212ENST00000556088 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.58■■■□□ 2.49
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NRXN3-212ENST00000556088 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa30.47■■■□□ 2.47
NRXN3-212ENST00000556088 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa30.44■■■□□ 2.46
NRXN3-212ENST00000556088 WIZO95785 1651 aa30.25■■■□□ 2.43
NRXN3-212ENST00000556088 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.23■■■□□ 2.43
NRXN3-212ENST00000556088 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.15■■■□□ 2.42
NRXN3-212ENST00000556088 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.04■■■□□ 2.4
NRXN3-212ENST00000556088 WDR62O43379 1518 aa30.01■■■□□ 2.39
NRXN3-212ENST00000556088 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.88■■■□□ 2.37
NRXN3-212ENST00000556088 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.85■■■□□ 2.37
NRXN3-212ENST00000556088 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.82■■■□□ 2.36
NRXN3-212ENST00000556088 CFTRP13569 1480 aa29.79■■■□□ 2.36
NRXN3-212ENST00000556088 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NRXN3-212ENST00000556088 TRIM41Q8WV44 630 aa29.7■■■□□ 2.35
NRXN3-212ENST00000556088 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
NRXN3-212ENST00000556088 PRDM2Q13029 1718 aa29.61■■■□□ 2.33
NRXN3-212ENST00000556088 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.43■■■□□ 2.3
NRXN3-212ENST00000556088 OSCARQ8IYS5 282 aa29.43■■■□□ 2.3
NRXN3-212ENST00000556088 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
NRXN3-212ENST00000556088 TOPBP1Q92547 1522 aa29.28■■■□□ 2.28
NRXN3-212ENST00000556088 IFT140Q96RY7 1462 aa29.28■■■□□ 2.28
NRXN3-212ENST00000556088 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa29.21■■■□□ 2.27
NRXN3-212ENST00000556088 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa29.21■■■□□ 2.27
NRXN3-212ENST00000556088 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa29.21■■■□□ 2.27
NRXN3-212ENST00000556088 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
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NRXN3-212ENST00000556088 ABCC8Q09428 1581 aa29.11■■■□□ 2.25
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NRXN3-212ENST00000556088 ARHGEF11O15085 1522 aa29.05■■■□□ 2.24
NRXN3-212ENST00000556088 CHD1O14646 1710 aa29.05■■■□□ 2.24
NRXN3-212ENST00000556088 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.01■■■□□ 2.23
NRXN3-212ENST00000556088 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
NRXN3-212ENST00000556088 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.89■■■□□ 2.22
NRXN3-212ENST00000556088 FBLN2P98095 1184 aa28.81■■■□□ 2.2
NRXN3-212ENST00000556088 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28.8■■■□□ 2.2
NRXN3-212ENST00000556088 SOGA1O94964 1423 aa28.78■■■□□ 2.2
NRXN3-212ENST00000556088 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
NRXN3-212ENST00000556088 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.77■■■□□ 2.2
NRXN3-212ENST00000556088 ARAP1Q96P48 1450 aa28.76■■■□□ 2.19
NRXN3-212ENST00000556088 CUX1P39880 1505 aa28.74■■■□□ 2.19
NRXN3-212ENST00000556088 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.71■■■□□ 2.19
NRXN3-212ENST00000556088 WDR97A6NE52 1622 aa28.68■■■□□ 2.18
NRXN3-212ENST00000556088 CLASP1Q7Z460 1538 aa28.63■■■□□ 2.17
NRXN3-212ENST00000556088 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.58■■■□□ 2.17
NRXN3-212ENST00000556088 PBRM1Q86U86 1689 aa28.57■■■□□ 2.16
NRXN3-212ENST00000556088 GRIN2BQ13224 1484 aa28.56■■■□□ 2.16
NRXN3-212ENST00000556088 SYNJ1O43426 1573 aa28.55■■■□□ 2.16
NRXN3-212ENST00000556088 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
NRXN3-212ENST00000556088 TRHP20396 242 aaPredicted RBP28.53■■■□□ 2.16
NRXN3-212ENST00000556088 SYNJ2O15056 1496 aa28.49■■■□□ 2.15
NRXN3-212ENST00000556088 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.45■■■□□ 2.14
NRXN3-212ENST00000556088 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.43■■■□□ 2.14
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NRXN3-212ENST00000556088 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
NRXN3-212ENST00000556088 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.25■■■□□ 2.11
NRXN3-212ENST00000556088 ADAMTS12P58397 1594 aa28.23■■■□□ 2.11
NRXN3-212ENST00000556088 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.23■■■□□ 2.11
NRXN3-212ENST00000556088 GRIN2AQ12879 1464 aa28.21■■■□□ 2.11
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NRXN3-212ENST00000556088 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.2■■■□□ 2.11
NRXN3-212ENST00000556088 CEP170Q5SW79 1584 aa28.19■■■□□ 2.1
NRXN3-212ENST00000556088 NUP160Q12769 1436 aa28.12■■■□□ 2.09
NRXN3-212ENST00000556088 SHROOM2Q13796 1616 aa28.07■■■□□ 2.08
NRXN3-212ENST00000556088 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.06■■■□□ 2.08
NRXN3-212ENST00000556088 ERICH3Q5RHP9 1530 aa28.02■■■□□ 2.08
NRXN3-212ENST00000556088 KIF13AQ9H1H9 1805 aa27.88■■■□□ 2.05
NRXN3-212ENST00000556088 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.86■■■□□ 2.05
NRXN3-212ENST00000556088 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.84■■■□□ 2.05
NRXN3-212ENST00000556088 JPH4Q96JJ6 628 aa27.8■■■□□ 2.04
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