RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555920.5

GALNT16-208, Transcript of polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 16, human

TSL 4

Gene GALNT16, Length 604 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GALNT16-208	ENST00000555920	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.94	■■■■□ 3.98
GALNT16-208	ENST00000555920	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.56	■■■■□ 3.28
GALNT16-208	ENST00000555920	ABCC9	O60706	1549 aa		35.24	■■■■□ 3.23
GALNT16-208	ENST00000555920	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		33.64	■■■□□ 2.98
GALNT16-208	ENST00000555920	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		33.63	■■■□□ 2.97
GALNT16-208	ENST00000555920	NACAD	O15069	1562 aa		33.51	■■■□□ 2.96
GALNT16-208	ENST00000555920	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.18	■■■□□ 2.9
GALNT16-208	ENST00000555920	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		33.16	■■■□□ 2.9
GALNT16-208	ENST00000555920	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		33	■■■□□ 2.87
GALNT16-208	ENST00000555920	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	32.95	■■■□□ 2.87
GALNT16-208	ENST00000555920	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.93	■■■□□ 2.86
GALNT16-208	ENST00000555920	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GALNT16-208	ENST00000555920	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		32.73	■■■□□ 2.83
GALNT16-208	ENST00000555920	SCRIB	Q14160	1630 aa		32.55	■■■□□ 2.8
GALNT16-208	ENST00000555920	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		32.14	■■■□□ 2.74
GALNT16-208	ENST00000555920	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
GALNT16-208	ENST00000555920	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		31.82	■■■□□ 2.69
GALNT16-208	ENST00000555920	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		31.65	■■■□□ 2.66
GALNT16-208	ENST00000555920	SMARCA4	P51532	1647 aa		31.06	■■■□□ 2.56
GALNT16-208	ENST00000555920	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.98	■■■□□ 2.55
GALNT16-208	ENST00000555920	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.96	■■■□□ 2.55
GALNT16-208	ENST00000555920	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.93	■■■□□ 2.54
GALNT16-208	ENST00000555920	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.84	■■■□□ 2.53
GALNT16-208	ENST00000555920	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.83	■■■□□ 2.53
GALNT16-208	ENST00000555920	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.74	■■■□□ 2.51
GALNT16-208	ENST00000555920	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.7	■■■□□ 2.5
GALNT16-208	ENST00000555920	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.68	■■■□□ 2.5
GALNT16-208	ENST00000555920	WIZ	O95785	1651 aa		30.5	■■■□□ 2.47
GALNT16-208	ENST00000555920	NES	P48681	1621 aa		30.44	■■■□□ 2.46
GALNT16-208	ENST00000555920	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.35	■■■□□ 2.45
GALNT16-208	ENST00000555920	ERCC6	Q03468	1493 aa		30.32	■■■□□ 2.44
GALNT16-208	ENST00000555920	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		30.17	■■■□□ 2.42
GALNT16-208	ENST00000555920	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		30.07	■■■□□ 2.4
GALNT16-208	ENST00000555920	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	30.06	■■■□□ 2.4
GALNT16-208	ENST00000555920	CUX2	O14529	1486 aa		30.05	■■■□□ 2.4
GALNT16-208	ENST00000555920	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		30.03	■■■□□ 2.4
GALNT16-208	ENST00000555920	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.98	■■■□□ 2.39
GALNT16-208	ENST00000555920	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	29.95	■■■□□ 2.39
GALNT16-208	ENST00000555920	CFTR	P13569	1480 aa		29.81	■■■□□ 2.36
GALNT16-208	ENST00000555920	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.79	■■■□□ 2.36
GALNT16-208	ENST00000555920	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.74	■■■□□ 2.35
GALNT16-208	ENST00000555920	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		29.71	■■■□□ 2.35
GALNT16-208	ENST00000555920	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		29.69	■■■□□ 2.34
GALNT16-208	ENST00000555920	WDR62	O43379	1518 aa		29.62	■■■□□ 2.33
GALNT16-208	ENST00000555920	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		29.59	■■■□□ 2.33
GALNT16-208	ENST00000555920	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.55	■■■□□ 2.32
GALNT16-208	ENST00000555920	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	29.5	■■■□□ 2.31
GALNT16-208	ENST00000555920	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.46	■■■□□ 2.31
GALNT16-208	ENST00000555920	TOPBP1	Q92547	1522 aa		29.24	■■■□□ 2.27
GALNT16-208	ENST00000555920	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		29.13	■■■□□ 2.25
GALNT16-208	ENST00000555920	ABCC8	Q09428	1581 aa		29.11	■■■□□ 2.25
GALNT16-208	ENST00000555920	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	29.08	■■■□□ 2.25
GALNT16-208	ENST00000555920	IFT140	Q96RY7	1462 aa		29.07	■■■□□ 2.24
GALNT16-208	ENST00000555920	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.97	■■■□□ 2.23
GALNT16-208	ENST00000555920	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.94	■■■□□ 2.22
GALNT16-208	ENST00000555920	CUX1	P39880	1505 aa		28.93	■■■□□ 2.22
GALNT16-208	ENST00000555920	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.91	■■■□□ 2.22
GALNT16-208	ENST00000555920	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.88	■■■□□ 2.21
GALNT16-208	ENST00000555920	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.88	■■■□□ 2.21
GALNT16-208	ENST00000555920	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GALNT16-208	ENST00000555920	SOGA1	O94964	1423 aa		28.86	■■■□□ 2.21
GALNT16-208	ENST00000555920	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		28.83	■■■□□ 2.21
GALNT16-208	ENST00000555920	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.78	■■■□□ 2.2
GALNT16-208	ENST00000555920	CHD1	O14646	1710 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GALNT16-208	ENST00000555920	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.61	■■■□□ 2.17
GALNT16-208	ENST00000555920	FBLN2	P98095	1184 aa		28.6	■■■□□ 2.17
GALNT16-208	ENST00000555920	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.6	■■■□□ 2.17
GALNT16-208	ENST00000555920	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.58	■■■□□ 2.17
GALNT16-208	ENST00000555920	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.56	■■■□□ 2.16
GALNT16-208	ENST00000555920	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		28.55	■■■□□ 2.16
GALNT16-208	ENST00000555920	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GALNT16-208	ENST00000555920	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.54	■■■□□ 2.16
GALNT16-208	ENST00000555920	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.53	■■■□□ 2.16
GALNT16-208	ENST00000555920	GRIN2B	Q13224	1484 aa		28.51	■■■□□ 2.15
GALNT16-208	ENST00000555920	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.49	■■■□□ 2.15
GALNT16-208	ENST00000555920	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.45	■■■□□ 2.15
GALNT16-208	ENST00000555920	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.45	■■■□□ 2.14
GALNT16-208	ENST00000555920	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	28.43	■■■□□ 2.14
GALNT16-208	ENST00000555920	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GALNT16-208	ENST00000555920	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GALNT16-208	ENST00000555920	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		28.43	■■■□□ 2.14
GALNT16-208	ENST00000555920	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	28.42	■■■□□ 2.14
GALNT16-208	ENST00000555920	ARHGEF11	O15085	1522 aa		28.36	■■■□□ 2.13
GALNT16-208	ENST00000555920	SYNJ2	O15056	1496 aa		28.34	■■■□□ 2.13
GALNT16-208	ENST00000555920	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GALNT16-208	ENST00000555920	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GALNT16-208	ENST00000555920	ADAMTS12	P58397	1594 aa		28.2	■■■□□ 2.1
GALNT16-208	ENST00000555920	GRIN2A	Q12879	1464 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GALNT16-208	ENST00000555920	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GALNT16-208	ENST00000555920	ARAP1	Q96P48	1450 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GALNT16-208	ENST00000555920	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GALNT16-208	ENST00000555920	CEP170	Q5SW79	1584 aa		28.07	■■■□□ 2.08
GALNT16-208	ENST00000555920	NUP160	Q12769	1436 aa		28.03	■■■□□ 2.08
GALNT16-208	ENST00000555920	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GALNT16-208	ENST00000555920	IGF1R	P08069	1367 aa		27.99	■■■□□ 2.07
GALNT16-208	ENST00000555920	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		27.94	■■■□□ 2.06
GALNT16-208	ENST00000555920	SHROOM2	Q13796	1616 aa		27.85	■■■□□ 2.05
GALNT16-208	ENST00000555920	CUL7	Q14999	1698 aa		27.83	■■■□□ 2.05
GALNT16-208	ENST00000555920	JPH4	Q96JJ6	628 aa		27.81	■■■□□ 2.04
GALNT16-208	ENST00000555920	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.81	■■■□□ 2.04

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.7 ms