RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555747.1

DLK1-204, Transcript of delta like non-canonical Notch ligand 1, humanhuman

TSL 4

Gene DLK1, Length 538 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLK1-204ENST00000555747 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.13■■■■■ 6.1
DLK1-204ENST00000555747 ABCC9O60706 1549 aa48.17■■■■■ 5.3
DLK1-204ENST00000555747 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.06■■■■■ 5.28
DLK1-204ENST00000555747 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.81■■■■■ 4.92
DLK1-204ENST00000555747 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.43■■■■■ 4.86
DLK1-204ENST00000555747 NACADO15069 1562 aa45.39■■■■■ 4.86
DLK1-204ENST00000555747 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.94■■■■■ 4.78
DLK1-204ENST00000555747 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.7■■■■■ 4.75
DLK1-204ENST00000555747 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.67■■■■■ 4.74
DLK1-204ENST00000555747 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.64■■■■■ 4.74
DLK1-204ENST00000555747 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.51■■■■■ 4.72
DLK1-204ENST00000555747 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44■■■■■ 4.63
DLK1-204ENST00000555747 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.94■■■■■ 4.63
DLK1-204ENST00000555747 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.93■■■■■ 4.62
DLK1-204ENST00000555747 SCRIBQ14160 1630 aa43.61■■■■■ 4.57
DLK1-204ENST00000555747 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.61■■■■■ 4.57
DLK1-204ENST00000555747 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.46■■■■■ 4.55
DLK1-204ENST00000555747 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.42■■■■■ 4.54
DLK1-204ENST00000555747 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa42.04■■■■■ 4.32
DLK1-204ENST00000555747 NCAPD3P42695 1498 aa41.84■■■■■ 4.29
DLK1-204ENST00000555747 CUX2O14529 1486 aa41.79■■■■■ 4.28
DLK1-204ENST00000555747 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.65■■■■■ 4.26
DLK1-204ENST00000555747 ERCC6Q03468 1493 aa41.63■■■■■ 4.25
DLK1-204ENST00000555747 SMARCA4P51532 1647 aa41.62■■■■■ 4.25
DLK1-204ENST00000555747 HMGXB3Q12766 1538 aa41.61■■■■■ 4.25
DLK1-204ENST00000555747 SMARCA2P51531 1590 aa41.59■■■■■ 4.25
DLK1-204ENST00000555747 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.31■■■■■ 4.2
DLK1-204ENST00000555747 NESP48681 1621 aa41.29■■■■■ 4.2
DLK1-204ENST00000555747 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.24■■■■■ 4.19
DLK1-204ENST00000555747 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.24■■■■■ 4.19
DLK1-204ENST00000555747 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
DLK1-204ENST00000555747 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.06■■■■■ 4.16
DLK1-204ENST00000555747 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.92■■■■■ 4.14
DLK1-204ENST00000555747 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.92■■■■■ 4.14
DLK1-204ENST00000555747 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.7■■■■■ 4.11
DLK1-204ENST00000555747 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.48■■■■■ 4.07
DLK1-204ENST00000555747 WIZO95785 1651 aa40.47■■■■■ 4.07
DLK1-204ENST00000555747 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.45■■■■■ 4.07
DLK1-204ENST00000555747 WDR62O43379 1518 aa40.42■■■■■ 4.06
DLK1-204ENST00000555747 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.2■■■■■ 4.03
DLK1-204ENST00000555747 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.08■■■■■ 4.01
DLK1-204ENST00000555747 CFTRP13569 1480 aa40■■■■□ 3.99
DLK1-204ENST00000555747 TRIM41Q8WV44 630 aa39.96■■■■□ 3.99
DLK1-204ENST00000555747 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.94■■■■□ 3.98
DLK1-204ENST00000555747 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
DLK1-204ENST00000555747 PRDM2Q13029 1718 aa39.86■■■■□ 3.97
DLK1-204ENST00000555747 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
DLK1-204ENST00000555747 OSCARQ8IYS5 282 aa39.61■■■■□ 3.93
DLK1-204ENST00000555747 IFT140Q96RY7 1462 aa39.39■■■■□ 3.9
DLK1-204ENST00000555747 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.37■■■■□ 3.89
DLK1-204ENST00000555747 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.37■■■■□ 3.89
DLK1-204ENST00000555747 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.37■■■■□ 3.89
DLK1-204ENST00000555747 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.37■■■■□ 3.89
DLK1-204ENST00000555747 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
DLK1-204ENST00000555747 TOPBP1Q92547 1522 aa39.31■■■■□ 3.88
DLK1-204ENST00000555747 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.25■■■■□ 3.87
DLK1-204ENST00000555747 ABCC8Q09428 1581 aa39.2■■■■□ 3.87
DLK1-204ENST00000555747 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.19■■■■□ 3.86
DLK1-204ENST00000555747 ARHGEF11O15085 1522 aa39.16■■■■□ 3.86
DLK1-204ENST00000555747 CHD1O14646 1710 aa39.08■■■■□ 3.85
DLK1-204ENST00000555747 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
DLK1-204ENST00000555747 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.88■■■■□ 3.819e-7■■■■□ 24.7
DLK1-204ENST00000555747 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.88■■■■□ 3.81
DLK1-204ENST00000555747 ARAP1Q96P48 1450 aa38.73■■■■□ 3.79
DLK1-204ENST00000555747 WDR97A6NE52 1622 aa38.71■■■■□ 3.79
DLK1-204ENST00000555747 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.67■■■■□ 3.78
DLK1-204ENST00000555747 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.67■■■■□ 3.78
DLK1-204ENST00000555747 SOGA1O94964 1423 aa38.59■■■■□ 3.77
DLK1-204ENST00000555747 FBLN2P98095 1184 aa38.58■■■■□ 3.77
DLK1-204ENST00000555747 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.57■■■■□ 3.76
DLK1-204ENST00000555747 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.55■■■■□ 3.76
DLK1-204ENST00000555747 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.55■■■■□ 3.76
DLK1-204ENST00000555747 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.54■■■■□ 3.76
DLK1-204ENST00000555747 CUX1P39880 1505 aa38.49■■■■□ 3.75
DLK1-204ENST00000555747 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.47■■■■□ 3.75
DLK1-204ENST00000555747 SYNJ1O43426 1573 aa38.47■■■■□ 3.75
DLK1-204ENST00000555747 GRIN2BQ13224 1484 aa38.39■■■■□ 3.74
DLK1-204ENST00000555747 PBRM1Q86U86 1689 aa38.39■■■■□ 3.74
DLK1-204ENST00000555747 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
DLK1-204ENST00000555747 SYNJ2O15056 1496 aa38.32■■■■□ 3.72
DLK1-204ENST00000555747 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.27■■■■□ 3.72
DLK1-204ENST00000555747 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.21■■■■□ 3.71
DLK1-204ENST00000555747 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.18■■■■□ 3.7
DLK1-204ENST00000555747 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.13■■■■□ 3.69
DLK1-204ENST00000555747 ADAMTS12P58397 1594 aa37.93■■■■□ 3.66
DLK1-204ENST00000555747 GRIN2AQ12879 1464 aa37.91■■■■□ 3.66
DLK1-204ENST00000555747 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.89■■■■□ 3.66
DLK1-204ENST00000555747 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.86■■■■□ 3.65
DLK1-204ENST00000555747 CEP170Q5SW79 1584 aa37.85■■■■□ 3.65
DLK1-204ENST00000555747 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.82■■■■□ 3.64
DLK1-204ENST00000555747 TOP2BQ02880 1626 aa37.82■■■■□ 3.64
DLK1-204ENST00000555747 SHROOM2Q13796 1616 aa37.8■■■■□ 3.64
DLK1-204ENST00000555747 NUP160Q12769 1436 aa37.8■■■■□ 3.64
DLK1-204ENST00000555747 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.68■■■■□ 3.62
DLK1-204ENST00000555747 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.67■■■■□ 3.62
DLK1-204ENST00000555747 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.61■■■■□ 3.61
DLK1-204ENST00000555747 KIF13AQ9H1H9 1805 aa37.55■■■■□ 3.6
DLK1-204ENST00000555747 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP37.55■■■■□ 3.6
DLK1-204ENST00000555747 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.43■■■■□ 3.58
DLK1-204ENST00000555747 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms