RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555657.5

NDRG2-245, Transcript of NDRG family member 2, human

TSL 5

Gene NDRG2, Length 578 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDRG2-245	ENST00000555657	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		58.55	■■■■■ 6.96
NDRG2-245	ENST00000555657	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		51.96	■■■■■ 5.91
NDRG2-245	ENST00000555657	ABCC9	O60706	1549 aa		50.86	■■■■■ 5.73
NDRG2-245	ENST00000555657	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		49.04	■■■■■ 5.44
NDRG2-245	ENST00000555657	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		48.89	■■■■■ 5.42
NDRG2-245	ENST00000555657	NACAD	O15069	1562 aa		48.82	■■■■■ 5.41
NDRG2-245	ENST00000555657	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	48.8	■■■■■ 5.4
NDRG2-245	ENST00000555657	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		48.5	■■■■■ 5.35
NDRG2-245	ENST00000555657	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		48.37	■■■■■ 5.33
NDRG2-245	ENST00000555657	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		47.76	■■■■■ 5.24
NDRG2-245	ENST00000555657	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	47.57	■■■■■ 5.21
NDRG2-245	ENST00000555657	SCRIB	Q14160	1630 aa		47.56	■■■■■ 5.2
NDRG2-245	ENST00000555657	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		47.39	■■■■■ 5.18
NDRG2-245	ENST00000555657	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		46.82	■■■■■ 5.09
NDRG2-245	ENST00000555657	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.51	■■■■■ 5.04
NDRG2-245	ENST00000555657	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	46.16	■■■■■ 4.98
NDRG2-245	ENST00000555657	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		45.95	■■■■■ 4.95
NDRG2-245	ENST00000555657	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		45.66	■■■■■ 4.9
NDRG2-245	ENST00000555657	SMARCA4	P51532	1647 aa		45.42	■■■■■ 4.86
NDRG2-245	ENST00000555657	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	45.38	■■■■■ 4.86
NDRG2-245	ENST00000555657	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		45.17	■■■■■ 4.82
NDRG2-245	ENST00000555657	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		45.13	■■■■■ 4.82
NDRG2-245	ENST00000555657	SMARCA2	P51531	1590 aa		45.07	■■■■■ 4.81
NDRG2-245	ENST00000555657	NCAPD3	P42695	1498 aa		45.04	■■■■■ 4.8
NDRG2-245	ENST00000555657	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		44.9	■■■■■ 4.78
NDRG2-245	ENST00000555657	HMGXB3	Q12766	1538 aa		44.85	■■■■■ 4.77
NDRG2-245	ENST00000555657	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	44.82	■■■■■ 4.77
NDRG2-245	ENST00000555657	WIZ	O95785	1651 aa		44.7	■■■■■ 4.75
NDRG2-245	ENST00000555657	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	44.68	■■■■■ 4.74
NDRG2-245	ENST00000555657	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	44.21	■■■■■ 4.67
NDRG2-245	ENST00000555657	NES	P48681	1621 aa		44.03	■■■■■ 4.64
NDRG2-245	ENST00000555657	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		43.86	■■■■■ 4.61
NDRG2-245	ENST00000555657	ERCC6	Q03468	1493 aa		43.83	■■■■■ 4.61
NDRG2-245	ENST00000555657	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	43.79	■■■■■ 4.6
NDRG2-245	ENST00000555657	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		43.78	■■■■■ 4.6
NDRG2-245	ENST00000555657	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		43.7	■■■■■ 4.59
NDRG2-245	ENST00000555657	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		43.58	■■■■■ 4.57
NDRG2-245	ENST00000555657	CFTR	P13569	1480 aa		43.53	■■■■■ 4.56
NDRG2-245	ENST00000555657	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		43.49	■■■■■ 4.55
NDRG2-245	ENST00000555657	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		43.32	■■■■■ 4.53
NDRG2-245	ENST00000555657	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	43.29	■■■■■ 4.52
NDRG2-245	ENST00000555657	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		43.26	■■■■■ 4.52
NDRG2-245	ENST00000555657	CUX2	O14529	1486 aa		43.21	■■■■■ 4.51
NDRG2-245	ENST00000555657	PRDM2	Q13029	1718 aa		43.19	■■■■■ 4.5
NDRG2-245	ENST00000555657	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		43.15	■■■■■ 4.5
NDRG2-245	ENST00000555657	WDR62	O43379	1518 aa		42.97	■■■■■ 4.47
NDRG2-245	ENST00000555657	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	42.87	■■■■■ 4.45
NDRG2-245	ENST00000555657	TOPBP1	Q92547	1522 aa		42.63	■■■■■ 4.42
NDRG2-245	ENST00000555657	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		42.58	■■■■■ 4.41
NDRG2-245	ENST00000555657	ABCC8	Q09428	1581 aa		42.56	■■■■■ 4.4
NDRG2-245	ENST00000555657	CUX1	P39880	1505 aa		42.36	■■■■■ 4.37
NDRG2-245	ENST00000555657	IFT140	Q96RY7	1462 aa		42.31	■■■■■ 4.36
NDRG2-245	ENST00000555657	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	42.28	■■■■■ 4.36
NDRG2-245	ENST00000555657	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		42.22	■■■■■ 4.35
NDRG2-245	ENST00000555657	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	42.16	■■■■■ 4.34
NDRG2-245	ENST00000555657	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	42.15	■■■■■ 4.34
NDRG2-245	ENST00000555657	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		42.13	■■■■■ 4.34
NDRG2-245	ENST00000555657	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	42.13	■■■■■ 4.33
NDRG2-245	ENST00000555657	SOGA1	O94964	1423 aa		42.12	■■■■■ 4.33
NDRG2-245	ENST00000555657	SYNJ1	O43426	1573 aa		42.05	■■■■■ 4.32
NDRG2-245	ENST00000555657	TOP2B	Q02880	1626 aa		42.01	■■■■■ 4.32
NDRG2-245	ENST00000555657	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		41.99	■■■■■ 4.31
NDRG2-245	ENST00000555657	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	41.99	■■■■■ 4.31
NDRG2-245	ENST00000555657	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	41.94	■■■■■ 4.3	2e-8	■■■■□ 23.7
NDRG2-245	ENST00000555657	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	41.9	■■■■■ 4.3
NDRG2-245	ENST00000555657	WDR97	A6NE52	1622 aa		41.8	■■■■■ 4.28
NDRG2-245	ENST00000555657	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		41.76	■■■■■ 4.28
NDRG2-245	ENST00000555657	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		41.73	■■■■■ 4.27
NDRG2-245	ENST00000555657	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		41.63	■■■■■ 4.25
NDRG2-245	ENST00000555657	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		41.6	■■■■■ 4.25
NDRG2-245	ENST00000555657	GRIN2B	Q13224	1484 aa		41.6	■■■■■ 4.25
NDRG2-245	ENST00000555657	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		41.57	■■■■■ 4.25
NDRG2-245	ENST00000555657	PBRM1	Q86U86	1689 aa		41.53	■■■■■ 4.24
NDRG2-245	ENST00000555657	FBLN2	P98095	1184 aa		41.49	■■■■■ 4.23
NDRG2-245	ENST00000555657	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		41.48	■■■■■ 4.23
NDRG2-245	ENST00000555657	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	41.45	■■■■■ 4.23
NDRG2-245	ENST00000555657	CHD1	O14646	1710 aa		41.43	■■■■■ 4.22
NDRG2-245	ENST00000555657	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	41.33	■■■■■ 4.21
NDRG2-245	ENST00000555657	SYNJ2	O15056	1496 aa		41.3	■■■■■ 4.2
NDRG2-245	ENST00000555657	TRIM41	Q8WV44	630 aa		41.29	■■■■■ 4.2
NDRG2-245	ENST00000555657	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		41.26	■■■■■ 4.2
NDRG2-245	ENST00000555657	KIF27	Q86VH2	1401 aa		41.25	■■■■■ 4.19
NDRG2-245	ENST00000555657	ADAMTS12	P58397	1594 aa		41.21	■■■■■ 4.19
NDRG2-245	ENST00000555657	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		41.14	■■■■■ 4.18
NDRG2-245	ENST00000555657	GRIN2A	Q12879	1464 aa		41.07	■■■■■ 4.16
NDRG2-245	ENST00000555657	IGF1R	P08069	1367 aa		41.04	■■■■■ 4.16
NDRG2-245	ENST00000555657	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		40.96	■■■■■ 4.15
NDRG2-245	ENST00000555657	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		40.94	■■■■■ 4.14
NDRG2-245	ENST00000555657	CUL7	Q14999	1698 aa		40.93	■■■■■ 4.14
NDRG2-245	ENST00000555657	CEP170	Q5SW79	1584 aa		40.87	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		40.85	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	NUP160	Q12769	1436 aa		40.84	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	ARHGEF11	O15085	1522 aa		40.83	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		40.83	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.82	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.82	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.82	■■■■■ 4.13
NDRG2-245	ENST00000555657	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		40.6	■■■■■ 4.09
NDRG2-245	ENST00000555657	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	40.53	■■■■■ 4.08
NDRG2-245	ENST00000555657	ARAP1	Q96P48	1450 aa		40.51	■■■■■ 4.08

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 99.1 ms