RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555569.1

PCNX4-209, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 515 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-209ENST00000555569 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.2■■■■□ 3.07
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PCNX4-209ENST00000555569 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.4■■□□□ 1.98
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PCNX4-209ENST00000555569 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PCNX4-209ENST00000555569 SMARCA2P51531 1590 aa26.54■■□□□ 1.84
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PCNX4-209ENST00000555569 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.35■■□□□ 1.81
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PCNX4-209ENST00000555569 CUX2O14529 1486 aa26.01■■□□□ 1.75
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PCNX4-209ENST00000555569 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.81■■□□□ 1.72
PCNX4-209ENST00000555569 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.81■■□□□ 1.72
PCNX4-209ENST00000555569 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
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PCNX4-209ENST00000555569 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.54■■□□□ 1.68
PCNX4-209ENST00000555569 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.53■■□□□ 1.68
PCNX4-209ENST00000555569 WDR62O43379 1518 aa25.51■■□□□ 1.67
PCNX4-209ENST00000555569 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.45■■□□□ 1.66
PCNX4-209ENST00000555569 PRDM2Q13029 1718 aa25.42■■□□□ 1.66
PCNX4-209ENST00000555569 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
PCNX4-209ENST00000555569 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PCNX4-209ENST00000555569 TOPBP1Q92547 1522 aa25.08■■□□□ 1.61
PCNX4-209ENST00000555569 ABCC8Q09428 1581 aa25.05■■□□□ 1.6
PCNX4-209ENST00000555569 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.02■■□□□ 1.6
PCNX4-209ENST00000555569 IFT140Q96RY7 1462 aa25.02■■□□□ 1.6
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PCNX4-209ENST00000555569 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
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PCNX4-209ENST00000555569 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
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PCNX4-209ENST00000555569 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
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PCNX4-209ENST00000555569 SOGA1O94964 1423 aa24.73■■□□□ 1.55
PCNX4-209ENST00000555569 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.72■■□□□ 1.55
PCNX4-209ENST00000555569 TRIM41Q8WV44 630 aa24.65■■□□□ 1.54
PCNX4-209ENST00000555569 WDR97A6NE52 1622 aa24.63■■□□□ 1.53
PCNX4-209ENST00000555569 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PCNX4-209ENST00000555569 CHD1O14646 1710 aa24.62■■□□□ 1.53
PCNX4-209ENST00000555569 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.53■■□□□ 1.52
PCNX4-209ENST00000555569 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.53■■□□□ 1.52
PCNX4-209ENST00000555569 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.53■■□□□ 1.52
PCNX4-209ENST00000555569 FBLN2P98095 1184 aa24.52■■□□□ 1.52
PCNX4-209ENST00000555569 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.51■■□□□ 1.51
PCNX4-209ENST00000555569 GRIN2BQ13224 1484 aa24.49■■□□□ 1.51
PCNX4-209ENST00000555569 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.47■■□□□ 1.51
PCNX4-209ENST00000555569 ARHGEF11O15085 1522 aa24.46■■□□□ 1.51
PCNX4-209ENST00000555569 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
PCNX4-209ENST00000555569 PBRM1Q86U86 1689 aa24.45■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.45■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 TOP2BQ02880 1626 aa24.44■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.44■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.44■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.42■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 SYNJ1O43426 1573 aa24.42■■□□□ 1.5
PCNX4-209ENST00000555569 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.39■■□□□ 1.49
PCNX4-209ENST00000555569 SYNJ2O15056 1496 aa24.38■■□□□ 1.49
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PCNX4-209ENST00000555569 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.25■■□□□ 1.47
PCNX4-209ENST00000555569 ARAP1Q96P48 1450 aa24.25■■□□□ 1.47
PCNX4-209ENST00000555569 ADAMTS12P58397 1594 aa24.21■■□□□ 1.47
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PCNX4-209ENST00000555569 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.17■■□□□ 1.46
PCNX4-209ENST00000555569 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.14■■□□□ 1.45
PCNX4-209ENST00000555569 NUP160Q12769 1436 aa24.08■■□□□ 1.44
PCNX4-209ENST00000555569 CEP170Q5SW79 1584 aa24.08■■□□□ 1.44
PCNX4-209ENST00000555569 KIF27Q86VH2 1401 aa23.96■■□□□ 1.43
PCNX4-209ENST00000555569 SHROOM2Q13796 1616 aa23.95■■□□□ 1.43
PCNX4-209ENST00000555569 ERCC6L2Q5T890 1561 aa23.95■■□□□ 1.43
PCNX4-209ENST00000555569 IGF1RP08069 1367 aa23.91■■□□□ 1.42
PCNX4-209ENST00000555569 CUL7Q14999 1698 aa23.89■■□□□ 1.42
PCNX4-209ENST00000555569 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
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