RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555288.1

RAX-203, Transcript of retina and anterior neural fold homeobox, humanhuman

TSL 3

Gene RAX, Length 473 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX-203ENST00000555288 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.96■■■■■ 6.55
RAX-203ENST00000555288 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.81■■■■■ 5.56
RAX-203ENST00000555288 ABCC9O60706 1549 aa49.06■■■■■ 5.44
RAX-203ENST00000555288 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa47.03■■■■■ 5.12
RAX-203ENST00000555288 NACADO15069 1562 aa46.94■■■■■ 5.1
RAX-203ENST00000555288 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.85■■■■■ 5.09
RAX-203ENST00000555288 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.59■■■■■ 5.05
RAX-203ENST00000555288 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP46.53■■■■■ 5.04
RAX-203ENST00000555288 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa46.28■■■■■ 5
RAX-203ENST00000555288 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.96■■■■■ 4.95
RAX-203ENST00000555288 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.84■■■■■ 4.93
RAX-203ENST00000555288 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.7■■■■■ 4.91
RAX-203ENST00000555288 SCRIBQ14160 1630 aa45.42■■■■■ 4.86
RAX-203ENST00000555288 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.42■■■■■ 4.86
RAX-203ENST00000555288 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa45.13■■■■■ 4.82
RAX-203ENST00000555288 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.47■■■■■ 4.71
RAX-203ENST00000555288 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.35■■■■■ 4.69
RAX-203ENST00000555288 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.12■■■■■ 4.65
RAX-203ENST00000555288 SMARCA4P51532 1647 aa43.45■■■■■ 4.55
RAX-203ENST00000555288 NCAPD3P42695 1498 aa43.37■■■■■ 4.53
RAX-203ENST00000555288 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
RAX-203ENST00000555288 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa43.33■■■■■ 4.53
RAX-203ENST00000555288 SMARCA2P51531 1590 aa43.21■■■■■ 4.51
RAX-203ENST00000555288 MROH2BQ7Z745 1585 aa43.13■■■■■ 4.5
RAX-203ENST00000555288 HMGXB3Q12766 1538 aa43.07■■■■■ 4.48
RAX-203ENST00000555288 PEG3Q9GZU2 1588 aa43.06■■■■■ 4.48
RAX-203ENST00000555288 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.9■■■■■ 4.46
RAX-203ENST00000555288 WIZO95785 1651 aa42.61■■■■■ 4.41
RAX-203ENST00000555288 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP42.54■■■■■ 4.4
RAX-203ENST00000555288 NESP48681 1621 aa42.39■■■■■ 4.38
RAX-203ENST00000555288 ERCC6Q03468 1493 aa42.25■■■■■ 4.35
RAX-203ENST00000555288 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42.2■■■■■ 4.35
RAX-203ENST00000555288 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
RAX-203ENST00000555288 CADPSQ9ULU8 1353 aa42.08■■■■■ 4.33
RAX-203ENST00000555288 CUX2O14529 1486 aa41.96■■■■■ 4.31
RAX-203ENST00000555288 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.95■■■■■ 4.31
RAX-203ENST00000555288 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.82■■■■■ 4.29
RAX-203ENST00000555288 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
RAX-203ENST00000555288 CFTRP13569 1480 aa41.76■■■■■ 4.28
RAX-203ENST00000555288 CCDC88BA6NC98 1476 aa41.7■■■■■ 4.27
RAX-203ENST00000555288 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.55■■■■■ 4.24
RAX-203ENST00000555288 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.52■■■■■ 4.24
RAX-203ENST00000555288 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.5■■■■■ 4.23
RAX-203ENST00000555288 WDR62O43379 1518 aa41.4■■■■■ 4.22
RAX-203ENST00000555288 PRDM2Q13029 1718 aa41.3■■■■■ 4.2
RAX-203ENST00000555288 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
RAX-203ENST00000555288 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
RAX-203ENST00000555288 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.1■■■■■ 4.17
RAX-203ENST00000555288 TOPBP1Q92547 1522 aa40.87■■■■■ 4.13
RAX-203ENST00000555288 ABCC8Q09428 1581 aa40.83■■■■■ 4.13
RAX-203ENST00000555288 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.78■■■■■ 4.12
RAX-203ENST00000555288 IFT140Q96RY7 1462 aa40.67■■■■■ 4.1
RAX-203ENST00000555288 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
RAX-203ENST00000555288 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.51■■■■■ 4.07
RAX-203ENST00000555288 CUX1P39880 1505 aa40.47■■■■■ 4.07
RAX-203ENST00000555288 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.45■■■■■ 4.07
RAX-203ENST00000555288 FGD5Q6ZNL6 1462 aa40.35■■■■■ 4.05
RAX-203ENST00000555288 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa40.35■■■■■ 4.05
RAX-203ENST00000555288 SOGA1O94964 1423 aa40.34■■■■■ 4.05
RAX-203ENST00000555288 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.31■■■■■ 4.04
RAX-203ENST00000555288 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP40.29■■■■■ 4.04
RAX-203ENST00000555288 OSCARQ8IYS5 282 aa40.21■■■■■ 4.03
RAX-203ENST00000555288 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
RAX-203ENST00000555288 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP40.08■■■■■ 4.01
RAX-203ENST00000555288 WDR97A6NE52 1622 aa40.06■■■■■ 4
RAX-203ENST00000555288 TOP2BQ02880 1626 aa40.02■■■■■ 4
RAX-203ENST00000555288 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa40.01■■■■■ 4
RAX-203ENST00000555288 SYNJ1O43426 1573 aa40■■■■□ 3.99
RAX-203ENST00000555288 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.97■■■■□ 3.99
RAX-203ENST00000555288 GRIN2BQ13224 1484 aa39.88■■■■□ 3.98
RAX-203ENST00000555288 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.87■■■■□ 3.97
RAX-203ENST00000555288 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.86■■■■□ 3.97
RAX-203ENST00000555288 CHD1O14646 1710 aa39.84■■■■□ 3.97
RAX-203ENST00000555288 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.81■■■■□ 3.96
RAX-203ENST00000555288 FBLN2P98095 1184 aa39.81■■■■□ 3.96
RAX-203ENST00000555288 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.8■■■■□ 3.96
RAX-203ENST00000555288 PBRM1Q86U86 1689 aa39.73■■■■□ 3.95
RAX-203ENST00000555288 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.68■■■■□ 3.94
RAX-203ENST00000555288 SYNJ2O15056 1496 aa39.66■■■■□ 3.94
RAX-203ENST00000555288 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.55■■■■□ 3.92
RAX-203ENST00000555288 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.55■■■■□ 3.92
RAX-203ENST00000555288 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.55■■■■□ 3.92
RAX-203ENST00000555288 TRIM41Q8WV44 630 aa39.54■■■■□ 3.92
RAX-203ENST00000555288 ARHGEF11O15085 1522 aa39.52■■■■□ 3.92
RAX-203ENST00000555288 ERICH3Q5RHP9 1530 aa39.46■■■■□ 3.91
RAX-203ENST00000555288 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.46■■■■□ 3.91
RAX-203ENST00000555288 ADAMTS12P58397 1594 aa39.42■■■■□ 3.9
RAX-203ENST00000555288 FHAD1B1AJZ9 1412 aa39.39■■■■□ 3.9
RAX-203ENST00000555288 GRIN2AQ12879 1464 aa39.37■■■■□ 3.89
RAX-203ENST00000555288 KIF27Q86VH2 1401 aa39.25■■■■□ 3.87
RAX-203ENST00000555288 NUP160Q12769 1436 aa39.24■■■■□ 3.87
RAX-203ENST00000555288 IGF1RP08069 1367 aa39.21■■■■□ 3.87
RAX-203ENST00000555288 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.21■■■■□ 3.87
RAX-203ENST00000555288 ARAP1Q96P48 1450 aa39.2■■■■□ 3.87
RAX-203ENST00000555288 CEP170Q5SW79 1584 aa39.19■■■■□ 3.86
RAX-203ENST00000555288 CUL7Q14999 1698 aa39■■■■□ 3.83
RAX-203ENST00000555288 SHROOM2Q13796 1616 aa38.95■■■■□ 3.83
RAX-203ENST00000555288 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa38.93■■■■□ 3.82
RAX-203ENST00000555288 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.92■■■■□ 3.82
RAX-203ENST00000555288 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.88■■■■□ 3.81
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