RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555117.1

COCH-208, Transcript of cochlin, humanhuman

TSL 2

Gene COCH, Length 619 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCH-208ENST00000555117 NISCHQ9Y2I1 1504 aa55.12■■■■■ 6.41
COCH-208ENST00000555117 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa49.41■■■■■ 5.5
COCH-208ENST00000555117 ABCC9O60706 1549 aa49.02■■■■■ 5.44
COCH-208ENST00000555117 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa46.83■■■■■ 5.09
COCH-208ENST00000555117 NACADO15069 1562 aa46.57■■■■■ 5.05
COCH-208ENST00000555117 DCAF8L2P0C7V8 631 aa46.33■■■■■ 5.01
COCH-208ENST00000555117 MYO15BQ96JP2 1530 aa46.02■■■■■ 4.96
COCH-208ENST00000555117 UNC13AQ9UPW8 1703 aa45.88■■■■■ 4.93
COCH-208ENST00000555117 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP45.77■■■■■ 4.92
COCH-208ENST00000555117 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP45.63■■■■■ 4.9
COCH-208ENST00000555117 DNAJC5BQ9UF47 199 aa45.62■■■■■ 4.89
COCH-208ENST00000555117 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa45.56■■■■■ 4.88
COCH-208ENST00000555117 BICRAQ9NZM4 1560 aa45.45■■■■■ 4.87
COCH-208ENST00000555117 SCRIBQ14160 1630 aa45.02■■■■■ 4.8
COCH-208ENST00000555117 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.86■■■■■ 4.77
COCH-208ENST00000555117 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa44.34■■■■■ 4.69
COCH-208ENST00000555117 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP44.31■■■■■ 4.68
COCH-208ENST00000555117 CECR2Q9BXF3 1484 aa44.11■■■■■ 4.65
COCH-208ENST00000555117 SMARCA4P51532 1647 aa42.97■■■■■ 4.47
COCH-208ENST00000555117 NCAPD3P42695 1498 aa42.94■■■■■ 4.47
COCH-208ENST00000555117 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa42.88■■■■■ 4.46
COCH-208ENST00000555117 SMARCA2P51531 1590 aa42.81■■■■■ 4.44
COCH-208ENST00000555117 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP42.79■■■■■ 4.44
COCH-208ENST00000555117 HMGXB3Q12766 1538 aa42.71■■■■■ 4.43
COCH-208ENST00000555117 PEG3Q9GZU2 1588 aa42.53■■■■■ 4.4
COCH-208ENST00000555117 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
COCH-208ENST00000555117 MROH2BQ7Z745 1585 aa42.48■■■■■ 4.39
COCH-208ENST00000555117 ERCC6Q03468 1493 aa42.3■■■■■ 4.36
COCH-208ENST00000555117 NESP48681 1621 aa42.2■■■■■ 4.35
COCH-208ENST00000555117 CUX2O14529 1486 aa42.11■■■■■ 4.33
COCH-208ENST00000555117 WIZO95785 1651 aa42.03■■■■■ 4.32
COCH-208ENST00000555117 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa42■■■■■ 4.31
COCH-208ENST00000555117 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.77■■■■■ 4.28
COCH-208ENST00000555117 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa41.76■■■■■ 4.28
COCH-208ENST00000555117 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
COCH-208ENST00000555117 PDS5BQ9NTI5 1447 aa41.69■■■■■ 4.26
COCH-208ENST00000555117 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.66■■■■■ 4.26
COCH-208ENST00000555117 CADPSQ9ULU8 1353 aa41.65■■■■■ 4.26
COCH-208ENST00000555117 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
COCH-208ENST00000555117 MRC2Q9UBG0 1479 aa41.33■■■■■ 4.21
COCH-208ENST00000555117 CFTRP13569 1480 aa41.27■■■■■ 4.2
COCH-208ENST00000555117 WDR62O43379 1518 aa41.24■■■■■ 4.19
COCH-208ENST00000555117 CEP164Q9UPV0 1460 aa41.24■■■■■ 4.19
COCH-208ENST00000555117 FANCD2Q9BXW9 1451 aa41.21■■■■■ 4.19
COCH-208ENST00000555117 PRDM2Q13029 1718 aa41.04■■■■■ 4.16
COCH-208ENST00000555117 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.99■■■■■ 4.15
COCH-208ENST00000555117 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
COCH-208ENST00000555117 TOPBP1Q92547 1522 aa40.47■■■■■ 4.07
COCH-208ENST00000555117 ABCC8Q09428 1581 aa40.4■■■■■ 4.06
COCH-208ENST00000555117 IFT140Q96RY7 1462 aa40.39■■■■■ 4.06
COCH-208ENST00000555117 DNMBPQ6XZF7 1577 aa40.39■■■■■ 4.06
COCH-208ENST00000555117 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP40.3■■■■■ 4.04
COCH-208ENST00000555117 OSCARQ8IYS5 282 aa40.19■■■■■ 4.02
COCH-208ENST00000555117 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP40.16■■■■■ 4.02
COCH-208ENST00000555117 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
COCH-208ENST00000555117 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
COCH-208ENST00000555117 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP40.05■■■■■ 4
COCH-208ENST00000555117 TRIM41Q8WV44 630 aa40■■■■□ 3.99
COCH-208ENST00000555117 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.94■■■■□ 3.981e-11■■□□□ 14
COCH-208ENST00000555117 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.91■■■■□ 3.98
COCH-208ENST00000555117 CUX1P39880 1505 aa39.9■■■■□ 3.98
COCH-208ENST00000555117 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.88■■■■□ 3.98
COCH-208ENST00000555117 SOGA1O94964 1423 aa39.87■■■■□ 3.97
COCH-208ENST00000555117 CHD1O14646 1710 aa39.83■■■■□ 3.97
COCH-208ENST00000555117 WDR97A6NE52 1622 aa39.75■■■■□ 3.95
COCH-208ENST00000555117 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP39.74■■■■□ 3.95
COCH-208ENST00000555117 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa39.74■■■■□ 3.95
COCH-208ENST00000555117 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa39.74■■■■□ 3.95
COCH-208ENST00000555117 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa39.74■■■■□ 3.95
COCH-208ENST00000555117 ARHGEF11O15085 1522 aa39.61■■■■□ 3.93
COCH-208ENST00000555117 FBLN2P98095 1184 aa39.61■■■■□ 3.93
COCH-208ENST00000555117 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa39.59■■■■□ 3.93
COCH-208ENST00000555117 GRIN2BQ13224 1484 aa39.51■■■■□ 3.92
COCH-208ENST00000555117 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP39.49■■■■□ 3.91
COCH-208ENST00000555117 PBRM1Q86U86 1689 aa39.49■■■■□ 3.91
COCH-208ENST00000555117 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa39.44■■■■□ 3.9
COCH-208ENST00000555117 GAPVD1Q14C86 1478 aa39.42■■■■□ 3.9
COCH-208ENST00000555117 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa39.4■■■■□ 3.9
COCH-208ENST00000555117 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa39.4■■■■□ 3.9
COCH-208ENST00000555117 TOP2BQ02880 1626 aa39.37■■■■□ 3.89
COCH-208ENST00000555117 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP39.36■■■■□ 3.89
COCH-208ENST00000555117 SYNJ2O15056 1496 aa39.35■■■■□ 3.89
COCH-208ENST00000555117 SYNJ1O43426 1573 aa39.33■■■■□ 3.89
COCH-208ENST00000555117 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP39.33■■■■□ 3.89
COCH-208ENST00000555117 CLASP1Q7Z460 1538 aa39.32■■■■□ 3.89
COCH-208ENST00000555117 CYB5RLQ6IPT4 315 aa39.24■■■■□ 3.87
COCH-208ENST00000555117 ARAP1Q96P48 1450 aa39.24■■■■□ 3.87
COCH-208ENST00000555117 ADAMTS12P58397 1594 aa39.08■■■■□ 3.85
COCH-208ENST00000555117 GRIN2AQ12879 1464 aa39.02■■■■□ 3.84
COCH-208ENST00000555117 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.97■■■■□ 3.83
COCH-208ENST00000555117 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.92■■■■□ 3.82
COCH-208ENST00000555117 CEP170Q5SW79 1584 aa38.89■■■■□ 3.82
COCH-208ENST00000555117 NUP160Q12769 1436 aa38.86■■■■□ 3.81
COCH-208ENST00000555117 ERCC6L2Q5T890 1561 aa38.73■■■■□ 3.79
COCH-208ENST00000555117 SHROOM2Q13796 1616 aa38.71■■■■□ 3.79
COCH-208ENST00000555117 TRHP20396 242 aaPredicted RBP38.7■■■■□ 3.79
COCH-208ENST00000555117 KIF27Q86VH2 1401 aa38.56■■■■□ 3.76
COCH-208ENST00000555117 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa38.53■■■■□ 3.76
COCH-208ENST00000555117 CUL7Q14999 1698 aa38.51■■■■□ 3.76
COCH-208ENST00000555117 IGF1RP08069 1367 aa38.47■■■■□ 3.75
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