RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555096.5

EML1-210, Transcript of echinoderm microtubule associated protein like 1, humanhuman

TSL 4

Gene EML1, Length 480 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EML1-210ENST00000555096 NISCHQ9Y2I1 1504 aa72.52■■■■■ 9.2
EML1-210ENST00000555096 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa64.59■■■■■ 7.93
EML1-210ENST00000555096 ABCC9O60706 1549 aa63.8■■■■■ 7.8
EML1-210ENST00000555096 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa61.12■■■■■ 7.37
EML1-210ENST00000555096 DCAF8L2P0C7V8 631 aa61■■■■■ 7.36
EML1-210ENST00000555096 NACADO15069 1562 aa60.94■■■■■ 7.35
EML1-210ENST00000555096 MYO15BQ96JP2 1530 aa60.41■■■■■ 7.26
EML1-210ENST00000555096 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP60.25■■■■■ 7.24
EML1-210ENST00000555096 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa59.95■■■■■ 7.19
EML1-210ENST00000555096 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP59.63■■■■■ 7.14
EML1-210ENST00000555096 UNC13AQ9UPW8 1703 aa59.6■■■■■ 7.13
EML1-210ENST00000555096 BICRAQ9NZM4 1560 aa59.24■■■■■ 7.07
EML1-210ENST00000555096 DNAJC5BQ9UF47 199 aa59.1■■■■■ 7.05
EML1-210ENST00000555096 SCRIBQ14160 1630 aa58.92■■■■■ 7.02
EML1-210ENST00000555096 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa58.61■■■■■ 6.97
EML1-210ENST00000555096 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP57.74■■■■■ 6.83
EML1-210ENST00000555096 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa57.64■■■■■ 6.82
EML1-210ENST00000555096 CECR2Q9BXF3 1484 aa57.4■■■■■ 6.78
EML1-210ENST00000555096 SMARCA4P51532 1647 aa56.32■■■■■ 6.61
EML1-210ENST00000555096 NCAPD3P42695 1498 aa56.29■■■■■ 6.6
EML1-210ENST00000555096 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP56.23■■■■■ 6.59
EML1-210ENST00000555096 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa56.21■■■■■ 6.59
EML1-210ENST00000555096 SMARCA2P51531 1590 aa56.1■■■■■ 6.57
EML1-210ENST00000555096 HMGXB3Q12766 1538 aa55.87■■■■■ 6.54
EML1-210ENST00000555096 MROH2BQ7Z745 1585 aa55.87■■■■■ 6.53
EML1-210ENST00000555096 PEG3Q9GZU2 1588 aa55.78■■■■■ 6.52
EML1-210ENST00000555096 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP55.72■■■■■ 6.51
EML1-210ENST00000555096 WIZO95785 1651 aa55.2■■■■■ 6.43
EML1-210ENST00000555096 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP55.1■■■■■ 6.41
EML1-210ENST00000555096 ERCC6Q03468 1493 aa55.05■■■■■ 6.4
EML1-210ENST00000555096 NESP48681 1621 aa55.04■■■■■ 6.4
EML1-210ENST00000555096 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa54.82■■■■■ 6.37
EML1-210ENST00000555096 CADPSQ9ULU8 1353 aa54.65■■■■■ 6.34
EML1-210ENST00000555096 CUX2O14529 1486 aa54.63■■■■■ 6.34
EML1-210ENST00000555096 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP54.6■■■■■ 6.33
EML1-210ENST00000555096 PDS5BQ9NTI5 1447 aa54.56■■■■■ 6.32
EML1-210ENST00000555096 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa54.28■■■■■ 6.28
EML1-210ENST00000555096 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP54.22■■■■■ 6.27
EML1-210ENST00000555096 CFTRP13569 1480 aa54.17■■■■■ 6.26
EML1-210ENST00000555096 CCDC88BA6NC98 1476 aa54.03■■■■■ 6.24
EML1-210ENST00000555096 FANCD2Q9BXW9 1451 aa53.97■■■■■ 6.23
EML1-210ENST00000555096 MRC2Q9UBG0 1479 aa53.96■■■■■ 6.23
EML1-210ENST00000555096 CEP164Q9UPV0 1460 aa53.94■■■■■ 6.23
EML1-210ENST00000555096 WDR62O43379 1518 aa53.76■■■■■ 6.2
EML1-210ENST00000555096 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.67■■■■■ 6.18
EML1-210ENST00000555096 PRDM2Q13029 1718 aa53.54■■■■■ 6.16
EML1-210ENST00000555096 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.44■■■■■ 6.15
EML1-210ENST00000555096 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP53.43■■■■■ 6.14
EML1-210ENST00000555096 ABCC8Q09428 1581 aa53.06■■■■■ 6.09
EML1-210ENST00000555096 TOPBP1Q92547 1522 aa53.03■■■■■ 6.08
EML1-210ENST00000555096 DNMBPQ6XZF7 1577 aa52.89■■■■■ 6.06
EML1-210ENST00000555096 IFT140Q96RY7 1462 aa52.85■■■■■ 6.05
EML1-210ENST00000555096 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP52.62■■■■■ 6.01
EML1-210ENST00000555096 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP52.55■■■■■ 6
EML1-210ENST00000555096 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP52.45■■■■■ 5.99
EML1-210ENST00000555096 OSCARQ8IYS5 282 aa52.43■■■■■ 5.98
EML1-210ENST00000555096 CUX1P39880 1505 aa52.43■■■■■ 5.98
EML1-210ENST00000555096 SOGA1O94964 1423 aa52.41■■■■■ 5.98
EML1-210ENST00000555096 FGD5Q6ZNL6 1462 aa52.35■■■■■ 5.97
EML1-210ENST00000555096 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa52.35■■■■■ 5.97
EML1-210ENST00000555096 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP52.32■■■■■ 5.97
EML1-210ENST00000555096 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP52.32■■■■■ 5.97
EML1-210ENST00000555096 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP52.18■■■■■ 5.94
EML1-210ENST00000555096 WDR97A6NE52 1622 aa52■■■■■ 5.92
EML1-210ENST00000555096 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP51.97■■■■■ 5.91
EML1-210ENST00000555096 FBLN2P98095 1184 aa51.9■■■■■ 5.9
EML1-210ENST00000555096 TOP2BQ02880 1626 aa51.83■■■■■ 5.89
EML1-210ENST00000555096 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa51.82■■■■■ 5.89
EML1-210ENST00000555096 GRIN2BQ13224 1484 aa51.81■■■■■ 5.88
EML1-210ENST00000555096 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa51.79■■■■■ 5.88
EML1-210ENST00000555096 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa51.77■■■■■ 5.88
EML1-210ENST00000555096 SYNJ1O43426 1573 aa51.76■■■■■ 5.88
EML1-210ENST00000555096 GAPVD1Q14C86 1478 aa51.75■■■■■ 5.88
EML1-210ENST00000555096 CHD1O14646 1710 aa51.74■■■■■ 5.87
EML1-210ENST00000555096 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP51.7■■■■■ 5.87
EML1-210ENST00000555096 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP51.68■■■■■ 5.86
EML1-210ENST00000555096 TRIM41Q8WV44 630 aa51.68■■■■■ 5.86
EML1-210ENST00000555096 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa51.58■■■■■ 5.85
EML1-210ENST00000555096 PBRM1Q86U86 1689 aa51.53■■■■■ 5.84
EML1-210ENST00000555096 SYNJ2O15056 1496 aa51.52■■■■■ 5.84
EML1-210ENST00000555096 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa51.44■■■■■ 5.83
EML1-210ENST00000555096 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa51.44■■■■■ 5.83
EML1-210ENST00000555096 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa51.44■■■■■ 5.83
EML1-210ENST00000555096 ARHGEF11O15085 1522 aa51.4■■■■■ 5.82
EML1-210ENST00000555096 CLASP1Q7Z460 1538 aa51.22■■■■■ 5.79
EML1-210ENST00000555096 ERICH3Q5RHP9 1530 aa51.18■■■■■ 5.78
EML1-210ENST00000555096 FHAD1B1AJZ9 1412 aa51.15■■■■■ 5.78
EML1-210ENST00000555096 ADAMTS12P58397 1594 aa51.13■■■■■ 5.78
EML1-210ENST00000555096 CYB5RLQ6IPT4 315 aa51.12■■■■■ 5.77
EML1-210ENST00000555096 GRIN2AQ12879 1464 aa51.11■■■■■ 5.77
EML1-210ENST00000555096 ARAP1Q96P48 1450 aa50.96■■■■■ 5.75
EML1-210ENST00000555096 KIF27Q86VH2 1401 aa50.95■■■■■ 5.75
EML1-210ENST00000555096 NUP160Q12769 1436 aa50.91■■■■■ 5.74
EML1-210ENST00000555096 IGF1RP08069 1367 aa50.83■■■■■ 5.73
EML1-210ENST00000555096 CEP170Q5SW79 1584 aa50.83■■■■■ 5.73
EML1-210ENST00000555096 CUL7Q14999 1698 aa50.57■■■■■ 5.69
EML1-210ENST00000555096 JPH4Q96JJ6 628 aa50.53■■■■■ 5.68
EML1-210ENST00000555096 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa50.52■■■■■ 5.68
EML1-210ENST00000555096 SHROOM2Q13796 1616 aa50.51■■■■■ 5.68
EML1-210ENST00000555096 ERCC6L2Q5T890 1561 aa50.47■■■■■ 5.67
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