RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555081.5

IFI27-201, Transcript of interferon alpha inducible protein 27, humanhuman

TSL 2

Gene IFI27, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI27-201ENST00000555081 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.08■■■■■ 7.85
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IFI27-201ENST00000555081 SMARCA2P51531 1590 aa49.7■■■■■ 5.55
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IFI27-201ENST00000555081 ERCC6Q03468 1493 aa48.97■■■■■ 5.43
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IFI27-201ENST00000555081 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.63■■■■■ 5.38
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IFI27-201ENST00000555081 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP48.59■■■■■ 5.37
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IFI27-201ENST00000555081 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.37■■■■■ 5.33
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IFI27-201ENST00000555081 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP48.22■■■■■ 5.31
IFI27-201ENST00000555081 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.21■■■■■ 5.31
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IFI27-201ENST00000555081 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.9■■■■■ 5.26
IFI27-201ENST00000555081 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa47.89■■■■■ 5.26
IFI27-201ENST00000555081 CEP164Q9UPV0 1460 aa47.84■■■■■ 5.25
IFI27-201ENST00000555081 FANCD2Q9BXW9 1451 aa47.83■■■■■ 5.25
IFI27-201ENST00000555081 WDR62O43379 1518 aa47.72■■■■■ 5.23
IFI27-201ENST00000555081 CCDC88BA6NC98 1476 aa47.71■■■■■ 5.23
IFI27-201ENST00000555081 PRDM2Q13029 1718 aa47.45■■■■■ 5.19
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IFI27-201ENST00000555081 TOPBP1Q92547 1522 aa46.98■■■■■ 5.11
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IFI27-201ENST00000555081 ABCC8Q09428 1581 aa46.94■■■■■ 5.11
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IFI27-201ENST00000555081 IFT140Q96RY7 1462 aa46.86■■■■■ 5.09
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IFI27-201ENST00000555081 WDR97A6NE52 1622 aa46.08■■■■■ 4.97
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IFI27-201ENST00000555081 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa45.8■■■■■ 4.92
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IFI27-201ENST00000555081 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa45.8■■■■■ 4.92
IFI27-201ENST00000555081 TOP2BQ02880 1626 aa45.79■■■■■ 4.92
IFI27-201ENST00000555081 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa45.77■■■■■ 4.92
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IFI27-201ENST00000555081 CEP170Q5SW79 1584 aa45.07■■■■■ 4.8
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IFI27-201ENST00000555081 TRHP20396 242 aaPredicted RBP44.75■■■■■ 4.75
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IFI27-201ENST00000555081 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa44.67■■■■■ 4.74
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