RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555060.1

GABRA5-208, Transcript of gamma-aminobutyric acid type A receptor alpha5 subunit, humanhuman

TSL 4

Gene GABRA5, Length 458 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5-208ENST00000555060 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.67■■■■■ 5.7
GABRA5-208ENST00000555060 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.39■■■■■ 4.86
GABRA5-208ENST00000555060 ABCC9O60706 1549 aa45.16■■■■■ 4.82
GABRA5-208ENST00000555060 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.12■■■■■ 4.49
GABRA5-208ENST00000555060 NACADO15069 1562 aa42.9■■■■■ 4.46
GABRA5-208ENST00000555060 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.61■■■■■ 4.41
GABRA5-208ENST00000555060 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.43■■■■■ 4.38
GABRA5-208ENST00000555060 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.31■■■■■ 4.36
GABRA5-208ENST00000555060 UNC13AQ9UPW8 1703 aa42.15■■■■■ 4.34
GABRA5-208ENST00000555060 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42.09■■■■■ 4.33
GABRA5-208ENST00000555060 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
GABRA5-208ENST00000555060 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.92■■■■■ 4.3
GABRA5-208ENST00000555060 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.87■■■■■ 4.29
GABRA5-208ENST00000555060 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.37■■■■■ 4.21
GABRA5-208ENST00000555060 SCRIBQ14160 1630 aa41.26■■■■■ 4.2
GABRA5-208ENST00000555060 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.85■■■■■ 4.13
GABRA5-208ENST00000555060 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
GABRA5-208ENST00000555060 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.7■■■■■ 4.11
GABRA5-208ENST00000555060 NCAPD3P42695 1498 aa39.63■■■■□ 3.94
GABRA5-208ENST00000555060 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.49■■■■□ 3.91
GABRA5-208ENST00000555060 SMARCA4P51532 1647 aa39.46■■■■□ 3.91
GABRA5-208ENST00000555060 SMARCA2P51531 1590 aa39.38■■■■□ 3.9
GABRA5-208ENST00000555060 HMGXB3Q12766 1538 aa39.3■■■■□ 3.88
GABRA5-208ENST00000555060 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.3■■■■□ 3.88
GABRA5-208ENST00000555060 PEG3Q9GZU2 1588 aa39.14■■■■□ 3.86
GABRA5-208ENST00000555060 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP39.06■■■■□ 3.84
GABRA5-208ENST00000555060 MROH2BQ7Z745 1585 aa39■■■■□ 3.83
GABRA5-208ENST00000555060 ERCC6Q03468 1493 aa38.97■■■■□ 3.83
GABRA5-208ENST00000555060 CUX2O14529 1486 aa38.93■■■■□ 3.82
GABRA5-208ENST00000555060 NESP48681 1621 aa38.85■■■■□ 3.81
GABRA5-208ENST00000555060 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa38.79■■■■□ 3.8
GABRA5-208ENST00000555060 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.67■■■■□ 3.78
GABRA5-208ENST00000555060 WIZO95785 1651 aa38.53■■■■□ 3.76
GABRA5-208ENST00000555060 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.45■■■■□ 3.75
GABRA5-208ENST00000555060 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.44■■■■□ 3.74
GABRA5-208ENST00000555060 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.41■■■■□ 3.74
GABRA5-208ENST00000555060 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.36■■■■□ 3.73
GABRA5-208ENST00000555060 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.29■■■■□ 3.72
GABRA5-208ENST00000555060 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.07■■■■□ 3.68
GABRA5-208ENST00000555060 MRC2Q9UBG0 1479 aa38.06■■■■□ 3.68
GABRA5-208ENST00000555060 CFTRP13569 1480 aa38.01■■■■□ 3.67
GABRA5-208ENST00000555060 WDR62O43379 1518 aa37.97■■■■□ 3.67
GABRA5-208ENST00000555060 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.93■■■■□ 3.66
GABRA5-208ENST00000555060 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.92■■■■□ 3.66
GABRA5-208ENST00000555060 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.66■■■■□ 3.62
GABRA5-208ENST00000555060 PRDM2Q13029 1718 aa37.61■■■■□ 3.61
GABRA5-208ENST00000555060 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
GABRA5-208ENST00000555060 ABCC8Q09428 1581 aa37.23■■■■□ 3.55
GABRA5-208ENST00000555060 TOPBP1Q92547 1522 aa37.23■■■■□ 3.55
GABRA5-208ENST00000555060 OSCARQ8IYS5 282 aa37.22■■■■□ 3.55
GABRA5-208ENST00000555060 IFT140Q96RY7 1462 aa37.2■■■■□ 3.55
GABRA5-208ENST00000555060 DNMBPQ6XZF7 1577 aa37.1■■■■□ 3.53
GABRA5-208ENST00000555060 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP37.1■■■■□ 3.53
GABRA5-208ENST00000555060 TRIM41Q8WV44 630 aa37■■■■□ 3.51
GABRA5-208ENST00000555060 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.91■■■■□ 3.5
GABRA5-208ENST00000555060 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
GABRA5-208ENST00000555060 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.85■■■■□ 3.49
GABRA5-208ENST00000555060 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.79■■■■□ 3.48
GABRA5-208ENST00000555060 SOGA1O94964 1423 aa36.72■■■■□ 3.47
GABRA5-208ENST00000555060 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.69■■■■□ 3.46
GABRA5-208ENST00000555060 CUX1P39880 1505 aa36.64■■■■□ 3.46
GABRA5-208ENST00000555060 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa36.63■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.63■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.62■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 CHD1O14646 1710 aa36.59■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 WDR97A6NE52 1622 aa36.58■■■■□ 3.45
GABRA5-208ENST00000555060 ARHGEF11O15085 1522 aa36.54■■■■□ 3.44
GABRA5-208ENST00000555060 FBLN2P98095 1184 aa36.48■■■■□ 3.43
GABRA5-208ENST00000555060 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.39■■■■□ 3.42
GABRA5-208ENST00000555060 GRIN2BQ13224 1484 aa36.37■■■■□ 3.41
GABRA5-208ENST00000555060 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
GABRA5-208ENST00000555060 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.29■■■■□ 3.4
GABRA5-208ENST00000555060 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.28■■■■□ 3.4
GABRA5-208ENST00000555060 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.28■■■■□ 3.4
GABRA5-208ENST00000555060 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.26■■■■□ 3.4
GABRA5-208ENST00000555060 SYNJ2O15056 1496 aa36.23■■■■□ 3.39
GABRA5-208ENST00000555060 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.2■■■■□ 3.39
GABRA5-208ENST00000555060 PBRM1Q86U86 1689 aa36.19■■■■□ 3.38
GABRA5-208ENST00000555060 SYNJ1O43426 1573 aa36.19■■■■□ 3.38
GABRA5-208ENST00000555060 ARAP1Q96P48 1450 aa36.18■■■■□ 3.38
GABRA5-208ENST00000555060 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.17■■■■□ 3.38
GABRA5-208ENST00000555060 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.15■■■■□ 3.38
GABRA5-208ENST00000555060 TOP2BQ02880 1626 aa36.11■■■■□ 3.37
GABRA5-208ENST00000555060 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.11■■■■□ 3.37
GABRA5-208ENST00000555060 GRIN2AQ12879 1464 aa35.88■■■■□ 3.33
GABRA5-208ENST00000555060 ADAMTS12P58397 1594 aa35.85■■■■□ 3.33
GABRA5-208ENST00000555060 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.83■■■■□ 3.33
GABRA5-208ENST00000555060 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.82■■■■□ 3.32
GABRA5-208ENST00000555060 NUP160Q12769 1436 aa35.8■■■■□ 3.32
GABRA5-208ENST00000555060 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.77■■■■□ 3.32
GABRA5-208ENST00000555060 CEP170Q5SW79 1584 aa35.72■■■■□ 3.31
GABRA5-208ENST00000555060 SHROOM2Q13796 1616 aa35.61■■■■□ 3.29
GABRA5-208ENST00000555060 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.61■■■■□ 3.29
GABRA5-208ENST00000555060 JPH4Q96JJ6 628 aa35.46■■■■□ 3.27
GABRA5-208ENST00000555060 IGF1RP08069 1367 aa35.43■■■■□ 3.26
GABRA5-208ENST00000555060 KIF27Q86VH2 1401 aa35.41■■■■□ 3.26
GABRA5-208ENST00000555060 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
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