RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554292.1

PCNX1-206, Transcript of pecanex 1, humanhuman

TSL 4

Gene PCNX1, Length 402 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1-206ENST00000554292 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.8■■■■■ 8.6
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PCNX1-206ENST00000554292 ABCC9O60706 1549 aa59.65■■■■■ 7.14
PCNX1-206ENST00000554292 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.57■■■■■ 6.81
PCNX1-206ENST00000554292 NACADO15069 1562 aa57.51■■■■■ 6.8
PCNX1-206ENST00000554292 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.35■■■■■ 6.77
PCNX1-206ENST00000554292 DCAF8L2P0C7V8 631 aa57.34■■■■■ 6.77
PCNX1-206ENST00000554292 MYO15BQ96JP2 1530 aa57.21■■■■■ 6.75
PCNX1-206ENST00000554292 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.99■■■■■ 6.71
PCNX1-206ENST00000554292 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.25■■■■■ 6.59
PCNX1-206ENST00000554292 SCRIBQ14160 1630 aa55.79■■■■■ 6.52
PCNX1-206ENST00000554292 BICRAQ9NZM4 1560 aa55.7■■■■■ 6.51
PCNX1-206ENST00000554292 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.68■■■■■ 6.5
PCNX1-206ENST00000554292 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.3■■■■■ 6.44
PCNX1-206ENST00000554292 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.49■■■■■ 6.31
PCNX1-206ENST00000554292 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.27■■■■■ 6.28
PCNX1-206ENST00000554292 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.01■■■■■ 6.24
PCNX1-206ENST00000554292 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.62■■■■■ 6.17
PCNX1-206ENST00000554292 SMARCA4P51532 1647 aa53.4■■■■■ 6.14
PCNX1-206ENST00000554292 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP53.38■■■■■ 6.14
PCNX1-206ENST00000554292 SMARCA2P51531 1590 aa53.06■■■■■ 6.09
PCNX1-206ENST00000554292 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa53.02■■■■■ 6.08
PCNX1-206ENST00000554292 NCAPD3P42695 1498 aa52.99■■■■■ 6.07
PCNX1-206ENST00000554292 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.98■■■■■ 6.07
PCNX1-206ENST00000554292 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.89■■■■■ 6.06
PCNX1-206ENST00000554292 HMGXB3Q12766 1538 aa52.81■■■■■ 6.05
PCNX1-206ENST00000554292 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP52.65■■■■■ 6.02
PCNX1-206ENST00000554292 WIZO95785 1651 aa52.45■■■■■ 5.99
PCNX1-206ENST00000554292 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.4■■■■■ 5.98
PCNX1-206ENST00000554292 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.95■■■■■ 5.91
PCNX1-206ENST00000554292 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.66■■■■■ 5.86
PCNX1-206ENST00000554292 NESP48681 1621 aa51.63■■■■■ 5.86
PCNX1-206ENST00000554292 ERCC6Q03468 1493 aa51.49■■■■■ 5.83
PCNX1-206ENST00000554292 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.45■■■■■ 5.83
PCNX1-206ENST00000554292 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.28■■■■■ 5.8
PCNX1-206ENST00000554292 CCDC88BA6NC98 1476 aa51.25■■■■■ 5.79
PCNX1-206ENST00000554292 CFTRP13569 1480 aa51.17■■■■■ 5.78
PCNX1-206ENST00000554292 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.14■■■■■ 5.78
PCNX1-206ENST00000554292 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.13■■■■■ 5.78
PCNX1-206ENST00000554292 PRDM2Q13029 1718 aa50.98■■■■■ 5.75
PCNX1-206ENST00000554292 CUX2O14529 1486 aa50.92■■■■■ 5.74
PCNX1-206ENST00000554292 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.92■■■■■ 5.74
PCNX1-206ENST00000554292 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.88■■■■■ 5.74
PCNX1-206ENST00000554292 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.84■■■■■ 5.73
PCNX1-206ENST00000554292 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.74■■■■■ 5.71
PCNX1-206ENST00000554292 WDR62O43379 1518 aa50.57■■■■■ 5.69
PCNX1-206ENST00000554292 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.33■■■■■ 5.65
PCNX1-206ENST00000554292 ABCC8Q09428 1581 aa50.17■■■■■ 5.62
PCNX1-206ENST00000554292 TOPBP1Q92547 1522 aa50.08■■■■■ 5.61
PCNX1-206ENST00000554292 DNMBPQ6XZF7 1577 aa50.08■■■■■ 5.61
PCNX1-206ENST00000554292 IFT140Q96RY7 1462 aa49.77■■■■■ 5.56
PCNX1-206ENST00000554292 CUX1P39880 1505 aa49.71■■■■■ 5.55
PCNX1-206ENST00000554292 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP49.64■■■■■ 5.54
PCNX1-206ENST00000554292 FGD5Q6ZNL6 1462 aa49.56■■■■■ 5.52
PCNX1-206ENST00000554292 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.53■■■■■ 5.52
PCNX1-206ENST00000554292 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.47■■■■■ 5.51
PCNX1-206ENST00000554292 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.44■■■■■ 5.5
PCNX1-206ENST00000554292 SOGA1O94964 1423 aa49.43■■■■■ 5.5
PCNX1-206ENST00000554292 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.4■■■■■ 5.5
PCNX1-206ENST00000554292 TOP2BQ02880 1626 aa49.38■■■■■ 5.5
PCNX1-206ENST00000554292 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa49.37■■■■■ 5.49
PCNX1-206ENST00000554292 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.36■■■■■ 5.49
PCNX1-206ENST00000554292 SYNJ1O43426 1573 aa49.32■■■■■ 5.49
PCNX1-206ENST00000554292 WDR97A6NE52 1622 aa49.27■■■■■ 5.48
PCNX1-206ENST00000554292 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.17■■■■■ 5.46
PCNX1-206ENST00000554292 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.11■■■■■ 5.45
PCNX1-206ENST00000554292 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
PCNX1-206ENST00000554292 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa49.09■■■■■ 5.45
PCNX1-206ENST00000554292 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.91■■■■■ 5.42
PCNX1-206ENST00000554292 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.9■■■■■ 5.42
PCNX1-206ENST00000554292 GRIN2BQ13224 1484 aa48.89■■■■■ 5.42
PCNX1-206ENST00000554292 PBRM1Q86U86 1689 aa48.87■■■■■ 5.41
PCNX1-206ENST00000554292 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.78■■■■■ 5.4
PCNX1-206ENST00000554292 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.78■■■■■ 5.4
PCNX1-206ENST00000554292 OSCARQ8IYS5 282 aa48.76■■■■■ 5.4
PCNX1-206ENST00000554292 CHD1O14646 1710 aa48.74■■■■■ 5.39
PCNX1-206ENST00000554292 FBLN2P98095 1184 aa48.58■■■■■ 5.37
PCNX1-206ENST00000554292 SYNJ2O15056 1496 aa48.56■■■■■ 5.36
PCNX1-206ENST00000554292 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.55■■■■■ 5.36
PCNX1-206ENST00000554292 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.5■■■■■ 5.35
PCNX1-206ENST00000554292 ADAMTS12P58397 1594 aa48.45■■■■■ 5.35
PCNX1-206ENST00000554292 KIF27Q86VH2 1401 aa48.45■■■■■ 5.35
PCNX1-206ENST00000554292 FHAD1B1AJZ9 1412 aa48.35■■■■■ 5.33
PCNX1-206ENST00000554292 TRIM41Q8WV44 630 aa48.33■■■■■ 5.33
PCNX1-206ENST00000554292 GRIN2AQ12879 1464 aa48.26■■■■■ 5.32
PCNX1-206ENST00000554292 CUL7Q14999 1698 aa48.18■■■■■ 5.3
PCNX1-206ENST00000554292 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.17■■■■■ 5.3
PCNX1-206ENST00000554292 IGF1RP08069 1367 aa48.14■■■■■ 5.3
PCNX1-206ENST00000554292 NUP160Q12769 1436 aa48.02■■■■■ 5.28
PCNX1-206ENST00000554292 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa48.01■■■■■ 5.28
PCNX1-206ENST00000554292 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa48.01■■■■■ 5.28
PCNX1-206ENST00000554292 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa48.01■■■■■ 5.28
PCNX1-206ENST00000554292 ARHGEF11O15085 1522 aa48■■■■■ 5.27
PCNX1-206ENST00000554292 CEP170Q5SW79 1584 aa47.99■■■■■ 5.27
PCNX1-206ENST00000554292 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.91■■■■■ 5.26
PCNX1-206ENST00000554292 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa47.91■■■■■ 5.26
PCNX1-206ENST00000554292 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.76■■■■■ 5.24
PCNX1-206ENST00000554292 SHROOM2Q13796 1616 aa47.69■■■■■ 5.22
PCNX1-206ENST00000554292 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.67■■■■■ 5.22
PCNX1-206ENST00000554292 EEA1Q15075 1411 aa47.64■■■■■ 5.22
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