RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554242.5

GZMB-208, Transcript of granzyme B, humanhuman

TSL 2

Gene GZMB, Length 665 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMB-208ENST00000554242 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.32■■■■□ 3.89
GZMB-208ENST00000554242 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.1■■■■□ 3.21
GZMB-208ENST00000554242 ABCC9O60706 1549 aa34.86■■■■□ 3.17
GZMB-208ENST00000554242 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.3■■■□□ 2.92
GZMB-208ENST00000554242 NACADO15069 1562 aa33.15■■■□□ 2.9
GZMB-208ENST00000554242 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.14■■■□□ 2.9
GZMB-208ENST00000554242 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.81■■■□□ 2.84
GZMB-208ENST00000554242 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
GZMB-208ENST00000554242 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.54■■■□□ 2.8
GZMB-208ENST00000554242 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.5■■■□□ 2.79
GZMB-208ENST00000554242 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.42■■■□□ 2.78
GZMB-208ENST00000554242 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.4■■■□□ 2.78
GZMB-208ENST00000554242 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.28■■■□□ 2.76
GZMB-208ENST00000554242 SCRIBQ14160 1630 aa32.04■■■□□ 2.72
GZMB-208ENST00000554242 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.93■■■□□ 2.7
GZMB-208ENST00000554242 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.49■■■□□ 2.63
GZMB-208ENST00000554242 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.46■■■□□ 2.63
GZMB-208ENST00000554242 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.37■■■□□ 2.61
GZMB-208ENST00000554242 NCAPD3P42695 1498 aa30.63■■■□□ 2.49
GZMB-208ENST00000554242 SMARCA4P51532 1647 aa30.58■■■□□ 2.49
GZMB-208ENST00000554242 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.57■■■□□ 2.48
GZMB-208ENST00000554242 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.51■■■□□ 2.47
GZMB-208ENST00000554242 SMARCA2P51531 1590 aa30.49■■■□□ 2.47
GZMB-208ENST00000554242 HMGXB3Q12766 1538 aa30.4■■■□□ 2.46
GZMB-208ENST00000554242 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
GZMB-208ENST00000554242 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.29■■■□□ 2.44
GZMB-208ENST00000554242 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.28■■■□□ 2.44
GZMB-208ENST00000554242 ERCC6Q03468 1493 aa30.1■■■□□ 2.41
GZMB-208ENST00000554242 NESP48681 1621 aa30.01■■■□□ 2.39
GZMB-208ENST00000554242 CUX2O14529 1486 aa29.92■■■□□ 2.38
GZMB-208ENST00000554242 WIZO95785 1651 aa29.91■■■□□ 2.38
GZMB-208ENST00000554242 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
GZMB-208ENST00000554242 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
GZMB-208ENST00000554242 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.72■■■□□ 2.35
GZMB-208ENST00000554242 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.72■■■□□ 2.35
GZMB-208ENST00000554242 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
GZMB-208ENST00000554242 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
GZMB-208ENST00000554242 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.58■■■□□ 2.33
GZMB-208ENST00000554242 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.55■■■□□ 2.32
GZMB-208ENST00000554242 CFTRP13569 1480 aa29.43■■■□□ 2.3
GZMB-208ENST00000554242 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
GZMB-208ENST00000554242 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.37■■■□□ 2.29
GZMB-208ENST00000554242 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.37■■■□□ 2.29
GZMB-208ENST00000554242 WDR62O43379 1518 aa29.31■■■□□ 2.28
GZMB-208ENST00000554242 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.28■■■□□ 2.28
GZMB-208ENST00000554242 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
GZMB-208ENST00000554242 PRDM2Q13029 1718 aa29.04■■■□□ 2.24
GZMB-208ENST00000554242 TOPBP1Q92547 1522 aa28.84■■■□□ 2.21
GZMB-208ENST00000554242 ABCC8Q09428 1581 aa28.82■■■□□ 2.2
GZMB-208ENST00000554242 IFT140Q96RY7 1462 aa28.78■■■□□ 2.2
GZMB-208ENST00000554242 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.78■■■□□ 2.2
GZMB-208ENST00000554242 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.75■■■□□ 2.19
GZMB-208ENST00000554242 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
GZMB-208ENST00000554242 OSCARQ8IYS5 282 aa28.65■■■□□ 2.18
GZMB-208ENST00000554242 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.57■■■□□ 2.16
GZMB-208ENST00000554242 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
GZMB-208ENST00000554242 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.51■■■□□ 2.15
GZMB-208ENST00000554242 SOGA1O94964 1423 aa28.48■■■□□ 2.15
GZMB-208ENST00000554242 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.47■■■□□ 2.15
GZMB-208ENST00000554242 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.46■■■□□ 2.15
GZMB-208ENST00000554242 CUX1P39880 1505 aa28.44■■■□□ 2.14
GZMB-208ENST00000554242 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.44■■■□□ 2.14
GZMB-208ENST00000554242 TRIM41Q8WV44 630 aa28.42■■■□□ 2.14
GZMB-208ENST00000554242 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.37■■■□□ 2.13
GZMB-208ENST00000554242 FBLN2P98095 1184 aa28.28■■■□□ 2.12
GZMB-208ENST00000554242 WDR97A6NE52 1622 aa28.28■■■□□ 2.12
GZMB-208ENST00000554242 CHD1O14646 1710 aa28.2■■■□□ 2.1
GZMB-208ENST00000554242 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.2■■■□□ 2.1
GZMB-208ENST00000554242 GRIN2BQ13224 1484 aa28.18■■■□□ 2.1
GZMB-208ENST00000554242 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.15■■■□□ 2.1
GZMB-208ENST00000554242 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.15■■■□□ 2.1
GZMB-208ENST00000554242 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.15■■■□□ 2.1
GZMB-208ENST00000554242 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.09
GZMB-208ENST00000554242 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.13■■■□□ 2.09
GZMB-208ENST00000554242 ARHGEF11O15085 1522 aa28.13■■■□□ 2.09
GZMB-208ENST00000554242 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.13■■■□□ 2.09
GZMB-208ENST00000554242 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.12■■■□□ 2.09
GZMB-208ENST00000554242 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.12■■■□□ 2.09
GZMB-208ENST00000554242 TOP2BQ02880 1626 aa28.07■■■□□ 2.08
GZMB-208ENST00000554242 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.04■■■□□ 2.08
GZMB-208ENST00000554242 SYNJ1O43426 1573 aa28.04■■■□□ 2.08
GZMB-208ENST00000554242 SYNJ2O15056 1496 aa28.04■■■□□ 2.08
GZMB-208ENST00000554242 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.02■■■□□ 2.08
GZMB-208ENST00000554242 PBRM1Q86U86 1689 aa28■■■□□ 2.07
GZMB-208ENST00000554242 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.95■■■□□ 2.06
GZMB-208ENST00000554242 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.93■■■□□ 2.06
GZMB-208ENST00000554242 ARAP1Q96P48 1450 aa27.87■■■□□ 2.05
GZMB-208ENST00000554242 GRIN2AQ12879 1464 aa27.8■■■□□ 2.04
GZMB-208ENST00000554242 ADAMTS12P58397 1594 aa27.8■■■□□ 2.04
GZMB-208ENST00000554242 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.79■■■□□ 2.04
GZMB-208ENST00000554242 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.78■■■□□ 2.04
GZMB-208ENST00000554242 NUP160Q12769 1436 aa27.69■■■□□ 2.02
GZMB-208ENST00000554242 CEP170Q5SW79 1584 aa27.66■■■□□ 2.02
GZMB-208ENST00000554242 KIF27Q86VH2 1401 aa27.58■■■□□ 2.01
GZMB-208ENST00000554242 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
GZMB-208ENST00000554242 IGF1RP08069 1367 aa27.53■■■□□ 2
GZMB-208ENST00000554242 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.52■■■□□ 2
GZMB-208ENST00000554242 SHROOM2Q13796 1616 aa27.49■■□□□ 1.99
GZMB-208ENST00000554242 JPH4Q96JJ6 628 aa27.45■■□□□ 1.98
GZMB-208ENST00000554242 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
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