RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.44■■■■■ 4.38
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PRRX1-208ENST00000553786 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.49■■■■□ 3.43
PRRX1-208ENST00000553786 DNAJC5BQ9UF47 199 aa36.24■■■■□ 3.39
PRRX1-208ENST00000553786 NACADO15069 1562 aa36.16■■■■□ 3.38
PRRX1-208ENST00000553786 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.94■■■■□ 3.34
PRRX1-208ENST00000553786 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.75■■■■□ 3.31
PRRX1-208ENST00000553786 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.57■■■■□ 3.29
PRRX1-208ENST00000553786 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.57■■■■□ 3.29
PRRX1-208ENST00000553786 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.41■■■■□ 3.26
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PRRX1-208ENST00000553786 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.03■■■■□ 3.2
PRRX1-208ENST00000553786 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.96■■■■□ 3.19
PRRX1-208ENST00000553786 SCRIBQ14160 1630 aa34.81■■■■□ 3.16
PRRX1-208ENST00000553786 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.7■■■■□ 3.15
PRRX1-208ENST00000553786 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.68■■■■□ 3.14
PRRX1-208ENST00000553786 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.58■■■■□ 3.13
PRRX1-208ENST00000553786 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.48■■■□□ 2.95
PRRX1-208ENST00000553786 NCAPD3P42695 1498 aa33.38■■■□□ 2.93
PRRX1-208ENST00000553786 ERCC6Q03468 1493 aa33.26■■■□□ 2.92
PRRX1-208ENST00000553786 CUX2O14529 1486 aa33.25■■■□□ 2.91
PRRX1-208ENST00000553786 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.25■■■□□ 2.91
PRRX1-208ENST00000553786 SMARCA2P51531 1590 aa33.17■■■□□ 2.9
PRRX1-208ENST00000553786 SMARCA4P51532 1647 aa33.16■■■□□ 2.9
PRRX1-208ENST00000553786 HMGXB3Q12766 1538 aa33.14■■■□□ 2.9
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PRRX1-208ENST00000553786 NESP48681 1621 aa32.95■■■□□ 2.87
PRRX1-208ENST00000553786 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.95■■■□□ 2.87
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PRRX1-208ENST00000553786 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.7■■■□□ 2.82
PRRX1-208ENST00000553786 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.69■■■□□ 2.82
PRRX1-208ENST00000553786 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
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PRRX1-208ENST00000553786 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.5■■■□□ 2.79
PRRX1-208ENST00000553786 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.36■■■□□ 2.77
PRRX1-208ENST00000553786 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.27■■■□□ 2.76
PRRX1-208ENST00000553786 WIZO95785 1651 aa32.27■■■□□ 2.76
PRRX1-208ENST00000553786 WDR62O43379 1518 aa32.18■■■□□ 2.74
PRRX1-208ENST00000553786 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.1■■■□□ 2.73
PRRX1-208ENST00000553786 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.03■■■□□ 2.72
PRRX1-208ENST00000553786 TRIM41Q8WV44 630 aa31.96■■■□□ 2.71
PRRX1-208ENST00000553786 CFTRP13569 1480 aa31.95■■■□□ 2.7
PRRX1-208ENST00000553786 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.92■■■□□ 2.7
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PRRX1-208ENST00000553786 PRDM2Q13029 1718 aa31.56■■■□□ 2.64
PRRX1-208ENST00000553786 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.5■■■□□ 2.63
PRRX1-208ENST00000553786 IFT140Q96RY7 1462 aa31.45■■■□□ 2.62
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
PRRX1-208ENST00000553786 TOPBP1Q92547 1522 aa31.38■■■□□ 2.61
PRRX1-208ENST00000553786 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
PRRX1-208ENST00000553786 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
PRRX1-208ENST00000553786 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.29■■■□□ 2.6
PRRX1-208ENST00000553786 ABCC8Q09428 1581 aa31.28■■■□□ 2.6
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PRRX1-208ENST00000553786 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.93■■■□□ 2.54
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PRRX1-208ENST00000553786 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.82■■■□□ 2.53
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PRRX1-208ENST00000553786 WDR97A6NE52 1622 aa30.78■■■□□ 2.52
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PRRX1-208ENST00000553786 NUP160Q12769 1436 aa30.17■■■□□ 2.42
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PRRX1-208ENST00000553786 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.06■■■□□ 2.4
PRRX1-208ENST00000553786 SHROOM2Q13796 1616 aa30.05■■■□□ 2.4
PRRX1-208ENST00000553786 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.01■■■□□ 2.39
PRRX1-208ENST00000553786 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
PRRX1-208ENST00000553786 JPH4Q96JJ6 628 aa29.83■■■□□ 2.37
PRRX1-208ENST00000553786 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.82■■■□□ 2.36
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