RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553315.1

RPS6KL1-202, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 3

Gene RPS6KL1, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-202ENST00000553315 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.22■■■■□ 3.55
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RPS6KL1-202ENST00000553315 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.52■■■□□ 2.8
RPS6KL1-202ENST00000553315 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.28■■■□□ 2.76
RPS6KL1-202ENST00000553315 NACADO15069 1562 aa31.93■■■□□ 2.7
RPS6KL1-202ENST00000553315 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.74■■■□□ 2.67
RPS6KL1-202ENST00000553315 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.61■■■□□ 2.65
RPS6KL1-202ENST00000553315 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.47■■■□□ 2.63
RPS6KL1-202ENST00000553315 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.37■■■□□ 2.61
RPS6KL1-202ENST00000553315 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.34■■■□□ 2.61
RPS6KL1-202ENST00000553315 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.91■■■□□ 2.54
RPS6KL1-202ENST00000553315 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.88■■■□□ 2.53
RPS6KL1-202ENST00000553315 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.81■■■□□ 2.52
RPS6KL1-202ENST00000553315 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
RPS6KL1-202ENST00000553315 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.73■■■□□ 2.51
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RPS6KL1-202ENST00000553315 SCRIBQ14160 1630 aa30.64■■■□□ 2.5
RPS6KL1-202ENST00000553315 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.19■■■□□ 2.42
RPS6KL1-202ENST00000553315 CUX2O14529 1486 aa29.67■■■□□ 2.34
RPS6KL1-202ENST00000553315 NCAPD3P42695 1498 aa29.46■■■□□ 2.31
RPS6KL1-202ENST00000553315 ERCC6Q03468 1493 aa29.45■■■□□ 2.31
RPS6KL1-202ENST00000553315 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.32■■■□□ 2.28
RPS6KL1-202ENST00000553315 HMGXB3Q12766 1538 aa29.25■■■□□ 2.27
RPS6KL1-202ENST00000553315 NESP48681 1621 aa29.22■■■□□ 2.27
RPS6KL1-202ENST00000553315 SMARCA4P51532 1647 aa29.2■■■□□ 2.26
RPS6KL1-202ENST00000553315 SMARCA2P51531 1590 aa29.18■■■□□ 2.26
RPS6KL1-202ENST00000553315 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
RPS6KL1-202ENST00000553315 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
RPS6KL1-202ENST00000553315 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.94■■■□□ 2.22
RPS6KL1-202ENST00000553315 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.92■■■□□ 2.22
RPS6KL1-202ENST00000553315 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
RPS6KL1-202ENST00000553315 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.9■■■□□ 2.22
RPS6KL1-202ENST00000553315 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.69■■■□□ 2.18
RPS6KL1-202ENST00000553315 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.67■■■□□ 2.18
RPS6KL1-202ENST00000553315 TRIM41Q8WV44 630 aa28.57■■■□□ 2.16
RPS6KL1-202ENST00000553315 WDR62O43379 1518 aa28.54■■■□□ 2.16
RPS6KL1-202ENST00000553315 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.53■■■□□ 2.16
RPS6KL1-202ENST00000553315 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.5■■■□□ 2.15
RPS6KL1-202ENST00000553315 WIZO95785 1651 aa28.34■■■□□ 2.13
RPS6KL1-202ENST00000553315 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.28■■■□□ 2.12
RPS6KL1-202ENST00000553315 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.21■■■□□ 2.11
RPS6KL1-202ENST00000553315 CFTRP13569 1480 aa28.11■■■□□ 2.09
RPS6KL1-202ENST00000553315 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.08
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RPS6KL1-202ENST00000553315 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1-202ENST00000553315 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1-202ENST00000553315 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.98■■■□□ 2.07
RPS6KL1-202ENST00000553315 PRDM2Q13029 1718 aa27.93■■■□□ 2.06
RPS6KL1-202ENST00000553315 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
RPS6KL1-202ENST00000553315 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.84■■■□□ 2.05
RPS6KL1-202ENST00000553315 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
RPS6KL1-202ENST00000553315 ARHGEF11O15085 1522 aa27.8■■■□□ 2.04
RPS6KL1-202ENST00000553315 IFT140Q96RY7 1462 aa27.74■■■□□ 2.03
RPS6KL1-202ENST00000553315 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.67■■■□□ 2.02
RPS6KL1-202ENST00000553315 TOPBP1Q92547 1522 aa27.65■■■□□ 2.02
RPS6KL1-202ENST00000553315 CHD1O14646 1710 aa27.59■■■□□ 2.01
RPS6KL1-202ENST00000553315 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.57■■■□□ 2
RPS6KL1-202ENST00000553315 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.52■■■□□ 2
RPS6KL1-202ENST00000553315 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.52■■■□□ 2
RPS6KL1-202ENST00000553315 ARAP1Q96P48 1450 aa27.51■■□□□ 1.99
RPS6KL1-202ENST00000553315 ABCC8Q09428 1581 aa27.46■■□□□ 1.99
RPS6KL1-202ENST00000553315 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.45■■□□□ 1.98
RPS6KL1-202ENST00000553315 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.42■■□□□ 1.98
RPS6KL1-202ENST00000553315 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.33■■□□□ 1.97
RPS6KL1-202ENST00000553315 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
RPS6KL1-202ENST00000553315 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.25■■□□□ 1.95
RPS6KL1-202ENST00000553315 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.22■■□□□ 1.95
RPS6KL1-202ENST00000553315 FBLN2P98095 1184 aa27.19■■□□□ 1.94
RPS6KL1-202ENST00000553315 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.16■■□□□ 1.94
RPS6KL1-202ENST00000553315 WDR97A6NE52 1622 aa27.15■■□□□ 1.94
RPS6KL1-202ENST00000553315 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.12■■□□□ 1.93
RPS6KL1-202ENST00000553315 SOGA1O94964 1423 aa27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1-202ENST00000553315 SYNJ1O43426 1573 aa27.09■■□□□ 1.93
RPS6KL1-202ENST00000553315 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.06■■□□□ 1.92
RPS6KL1-202ENST00000553315 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
RPS6KL1-202ENST00000553315 CUX1P39880 1505 aa27■■□□□ 1.91
RPS6KL1-202ENST00000553315 GRIN2BQ13224 1484 aa26.97■■□□□ 1.91
RPS6KL1-202ENST00000553315 PBRM1Q86U86 1689 aa26.96■■□□□ 1.91
RPS6KL1-202ENST00000553315 SYNJ2O15056 1496 aa26.96■■□□□ 1.91
RPS6KL1-202ENST00000553315 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
RPS6KL1-202ENST00000553315 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.89■■□□□ 1.9
RPS6KL1-202ENST00000553315 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
RPS6KL1-202ENST00000553315 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.83■■□□□ 1.88
RPS6KL1-202ENST00000553315 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.79■■□□□ 1.88
RPS6KL1-202ENST00000553315 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.75■■□□□ 1.87
RPS6KL1-202ENST00000553315 GRIN2AQ12879 1464 aa26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-202ENST00000553315 ADAMTS12P58397 1594 aa26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-202ENST00000553315 CEP170Q5SW79 1584 aa26.66■■□□□ 1.86
RPS6KL1-202ENST00000553315 SHROOM2Q13796 1616 aa26.63■■□□□ 1.85
RPS6KL1-202ENST00000553315 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS6KL1-202ENST00000553315 NUP160Q12769 1436 aa26.62■■□□□ 1.85
RPS6KL1-202ENST00000553315 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.46■■□□□ 1.83
RPS6KL1-202ENST00000553315 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.43■■□□□ 1.82
RPS6KL1-202ENST00000553315 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.43■■□□□ 1.82
RPS6KL1-202ENST00000553315 TOP2BQ02880 1626 aa26.41■■□□□ 1.82
RPS6KL1-202ENST00000553315 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.39■■□□□ 1.81
RPS6KL1-202ENST00000553315 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
RPS6KL1-202ENST00000553315 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.29■■□□□ 1.8
RPS6KL1-202ENST00000553315 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.28■■□□□ 1.8
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