RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553274.1

KLHDC1-202, Transcript of kelch domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene KLHDC1, Length 645 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC1-202ENST00000553274 NISCHQ9Y2I1 1504 aa60.24■■■■■ 7.23
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KLHDC1-202ENST00000553274 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa51■■■■■ 5.75
KLHDC1-202ENST00000553274 NACADO15069 1562 aa50.82■■■■■ 5.73
KLHDC1-202ENST00000553274 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.41■■■■■ 5.66
KLHDC1-202ENST00000553274 DCAF8L2P0C7V8 631 aa50.33■■■■■ 5.65
KLHDC1-202ENST00000553274 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP50.07■■■■■ 5.61
KLHDC1-202ENST00000553274 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa49.9■■■■■ 5.58
KLHDC1-202ENST00000553274 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.78■■■■■ 5.56
KLHDC1-202ENST00000553274 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP49.57■■■■■ 5.53
KLHDC1-202ENST00000553274 BICRAQ9NZM4 1560 aa49.51■■■■■ 5.52
KLHDC1-202ENST00000553274 DNAJC5BQ9UF47 199 aa49.48■■■■■ 5.51
KLHDC1-202ENST00000553274 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.06■■■■■ 5.44
KLHDC1-202ENST00000553274 SCRIBQ14160 1630 aa48.98■■■■■ 5.43
KLHDC1-202ENST00000553274 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP48.24■■■■■ 5.31
KLHDC1-202ENST00000553274 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa48.17■■■■■ 5.3
KLHDC1-202ENST00000553274 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.96■■■■■ 5.27
KLHDC1-202ENST00000553274 NCAPD3P42695 1498 aa46.92■■■■■ 5.1
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KLHDC1-202ENST00000553274 SMARCA2P51531 1590 aa46.72■■■■■ 5.07
KLHDC1-202ENST00000553274 HMGXB3Q12766 1538 aa46.64■■■■■ 5.06
KLHDC1-202ENST00000553274 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.52■■■■■ 5.04
KLHDC1-202ENST00000553274 MROH2BQ7Z745 1585 aa46.37■■■■■ 5.01
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KLHDC1-202ENST00000553274 NESP48681 1621 aa45.88■■■■■ 4.93
KLHDC1-202ENST00000553274 CUX2O14529 1486 aa45.81■■■■■ 4.92
KLHDC1-202ENST00000553274 WIZO95785 1651 aa45.79■■■■■ 4.92
KLHDC1-202ENST00000553274 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.76■■■■■ 4.92
KLHDC1-202ENST00000553274 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP45.62■■■■■ 4.89
KLHDC1-202ENST00000553274 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.46■■■■■ 4.87
KLHDC1-202ENST00000553274 PDS5BQ9NTI5 1447 aa45.44■■■■■ 4.87
KLHDC1-202ENST00000553274 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP45.41■■■■■ 4.86
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KLHDC1-202ENST00000553274 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa45.32■■■■■ 4.85
KLHDC1-202ENST00000553274 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa45.14■■■■■ 4.82
KLHDC1-202ENST00000553274 CFTRP13569 1480 aa45.09■■■■■ 4.81
KLHDC1-202ENST00000553274 MRC2Q9UBG0 1479 aa45.03■■■■■ 4.8
KLHDC1-202ENST00000553274 WDR62O43379 1518 aa44.94■■■■■ 4.78
KLHDC1-202ENST00000553274 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.93■■■■■ 4.78
KLHDC1-202ENST00000553274 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.91■■■■■ 4.78
KLHDC1-202ENST00000553274 CCDC88BA6NC98 1476 aa44.78■■■■■ 4.76
KLHDC1-202ENST00000553274 PRDM2Q13029 1718 aa44.64■■■■■ 4.74
KLHDC1-202ENST00000553274 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.53■■■■■ 4.72
KLHDC1-202ENST00000553274 TOPBP1Q92547 1522 aa44.14■■■■■ 4.66
KLHDC1-202ENST00000553274 ABCC8Q09428 1581 aa44.14■■■■■ 4.66
KLHDC1-202ENST00000553274 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.05■■■■■ 4.64
KLHDC1-202ENST00000553274 IFT140Q96RY7 1462 aa44.04■■■■■ 4.64
KLHDC1-202ENST00000553274 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
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KLHDC1-202ENST00000553274 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP43.73■■■■■ 4.59
KLHDC1-202ENST00000553274 OSCARQ8IYS5 282 aa43.69■■■■■ 4.58
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KLHDC1-202ENST00000553274 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.5■■■■■ 4.55
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KLHDC1-202ENST00000553274 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.48■■■■■ 4.55
KLHDC1-202ENST00000553274 WDR97A6NE52 1622 aa43.42■■■■■ 4.54
KLHDC1-202ENST00000553274 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
KLHDC1-202ENST00000553274 CHD1O14646 1710 aa43.19■■■■■ 4.51
KLHDC1-202ENST00000553274 TRIM41Q8WV44 630 aa43.18■■■■■ 4.5
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KLHDC1-202ENST00000553274 GRIN2BQ13224 1484 aa43.1■■■■■ 4.49
KLHDC1-202ENST00000553274 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.1■■■■■ 4.49
KLHDC1-202ENST00000553274 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP43.09■■■■■ 4.49
KLHDC1-202ENST00000553274 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLHDC1-202ENST00000553274 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLHDC1-202ENST00000553274 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa43.08■■■■■ 4.49
KLHDC1-202ENST00000553274 ARHGEF11O15085 1522 aa43.04■■■■■ 4.48
KLHDC1-202ENST00000553274 TOP2BQ02880 1626 aa43.02■■■■■ 4.48
KLHDC1-202ENST00000553274 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa43.02■■■■■ 4.48
KLHDC1-202ENST00000553274 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.48
KLHDC1-202ENST00000553274 GAPVD1Q14C86 1478 aa43■■■■■ 4.47
KLHDC1-202ENST00000553274 FBLN2P98095 1184 aa42.99■■■■■ 4.47
KLHDC1-202ENST00000553274 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa42.98■■■■■ 4.47
KLHDC1-202ENST00000553274 SYNJ1O43426 1573 aa42.94■■■■■ 4.46
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KLHDC1-202ENST00000553274 PBRM1Q86U86 1689 aa42.92■■■■■ 4.46
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KLHDC1-202ENST00000553274 ARAP1Q96P48 1450 aa42.65■■■■■ 4.42
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KLHDC1-202ENST00000553274 ERICH3Q5RHP9 1530 aa42.57■■■■■ 4.41
KLHDC1-202ENST00000553274 CYB5RLQ6IPT4 315 aa42.56■■■■■ 4.4
KLHDC1-202ENST00000553274 GRIN2AQ12879 1464 aa42.55■■■■■ 4.4
KLHDC1-202ENST00000553274 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.5■■■■■ 4.39
KLHDC1-202ENST00000553274 NUP160Q12769 1436 aa42.44■■■■■ 4.38
KLHDC1-202ENST00000553274 CEP170Q5SW79 1584 aa42.35■■■■■ 4.37
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KLHDC1-202ENST00000553274 KIF27Q86VH2 1401 aa42.17■■■■■ 4.34
KLHDC1-202ENST00000553274 ERCC6L2Q5T890 1561 aa42.1■■■■■ 4.33
KLHDC1-202ENST00000553274 IGF1RP08069 1367 aa42.09■■■■■ 4.33
KLHDC1-202ENST00000553274 CUL7Q14999 1698 aa42.03■■■■■ 4.32
KLHDC1-202ENST00000553274 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa42■■■■■ 4.31
KLHDC1-202ENST00000553274 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.3
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