RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552963.5

GRASP-208, Transcript of general receptor for phosphoinositides 1 associated scaffold protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GRASP, Length 1,634 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRASP-208ENST00000552963 NISCHQ9Y2I1 1504 aa67.76■■■■■ 8.44
GRASP-208ENST00000552963 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.06■■■■■ 7.05
GRASP-208ENST00000552963 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57.01■■■■■ 6.72
GRASP-208ENST00000552963 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.17■■■■■ 6.58
GRASP-208ENST00000552963 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.65■■■■■ 6.5
GRASP-208ENST00000552963 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.42■■■■■ 6.46
GRASP-208ENST00000552963 ABCC9O60706 1549 aa55.36■■■■■ 6.45
GRASP-208ENST00000552963 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.25■■■■■ 6.43
GRASP-208ENST00000552963 NACADO15069 1562 aa54.92■■■■■ 6.38
GRASP-208ENST00000552963 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa54.36■■■■■ 6.29
GRASP-208ENST00000552963 SCRIBQ14160 1630 aa54.17■■■■■ 6.26
GRASP-208ENST00000552963 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP53.35■■■■■ 6.13
GRASP-208ENST00000552963 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.16■■■■■ 6.1
GRASP-208ENST00000552963 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.63■■■■■ 6.02
GRASP-208ENST00000552963 BICRAQ9NZM4 1560 aa52.6■■■■■ 6.01
GRASP-208ENST00000552963 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.5■■■■■ 6
GRASP-208ENST00000552963 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.36■■■■■ 5.97
GRASP-208ENST00000552963 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.28■■■■■ 5.96
GRASP-208ENST00000552963 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP52.19■■■■■ 5.95
GRASP-208ENST00000552963 SMARCA4P51532 1647 aa52.03■■■■■ 5.92
GRASP-208ENST00000552963 WIZO95785 1651 aa51.86■■■■■ 5.89
GRASP-208ENST00000552963 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.46■■■■■ 5.83
GRASP-208ENST00000552963 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.46■■■■■ 5.83
GRASP-208ENST00000552963 CHIC1Q5VXU3 224 aa51.3■■■■■ 5.8
GRASP-208ENST00000552963 SMARCA2P51531 1590 aa51.16■■■■■ 5.78
GRASP-208ENST00000552963 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.08■■■■■ 5.77
GRASP-208ENST00000552963 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP51.03■■■■■ 5.76
GRASP-208ENST00000552963 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.85■■■■■ 5.73
GRASP-208ENST00000552963 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.83■■■■■ 5.73
GRASP-208ENST00000552963 NCAPD3P42695 1498 aa50.65■■■■■ 5.7
GRASP-208ENST00000552963 HMGXB3Q12766 1538 aa50.65■■■■■ 5.7
GRASP-208ENST00000552963 TRIM41Q8WV44 630 aa50.25■■■■■ 5.63
GRASP-208ENST00000552963 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa50.17■■■■■ 5.62
GRASP-208ENST00000552963 ABCC8Q09428 1581 aa49.8■■■■■ 5.56
GRASP-208ENST00000552963 CFTRP13569 1480 aa49.59■■■■■ 5.53
GRASP-208ENST00000552963 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.58■■■■■ 5.53
GRASP-208ENST00000552963 PRDM2Q13029 1718 aa49.42■■■■■ 5.5
GRASP-208ENST00000552963 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.34■■■■■ 5.49
GRASP-208ENST00000552963 SYNJ1O43426 1573 aa49.3■■■■■ 5.48
GRASP-208ENST00000552963 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa49.22■■■■■ 5.47
GRASP-208ENST00000552963 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP49.18■■■■■ 5.46
GRASP-208ENST00000552963 TOP2BQ02880 1626 aa49.16■■■■■ 5.46
GRASP-208ENST00000552963 EEA1Q15075 1411 aa49.16■■■■■ 5.46
GRASP-208ENST00000552963 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.12■■■■■ 5.45
GRASP-208ENST00000552963 SOGA1O94964 1423 aa48.93■■■■■ 5.42
GRASP-208ENST00000552963 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa48.91■■■■■ 5.42
GRASP-208ENST00000552963 CUX1P39880 1505 aa48.89■■■■■ 5.42
GRASP-208ENST00000552963 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.78■■■■■ 5.4
GRASP-208ENST00000552963 CSRNP3Q8WYN3 585 aa48.7■■■■■ 5.39
GRASP-208ENST00000552963 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.69■■■■■ 5.38
GRASP-208ENST00000552963 NESP48681 1621 aa48.66■■■■■ 5.38
GRASP-208ENST00000552963 DNAJC5BQ9UF47 199 aa48.55■■■■■ 5.36
GRASP-208ENST00000552963 PDS5BQ9NTI5 1447 aa48.51■■■■■ 5.36
GRASP-208ENST00000552963 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.47■■■■■ 5.35
GRASP-208ENST00000552963 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.45■■■■■ 5.35
GRASP-208ENST00000552963 KIF21BO75037 1637 aa48.43■■■■■ 5.34
GRASP-208ENST00000552963 GOLGA3Q08378 1498 aa48.4■■■■■ 5.34
GRASP-208ENST00000552963 EHMT2Q96KQ7 1210 aa48.36■■■■■ 5.33
GRASP-208ENST00000552963 KIF27Q86VH2 1401 aa48.33■■■■■ 5.33
GRASP-208ENST00000552963 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.33■■■■■ 5.33
GRASP-208ENST00000552963 TNIKQ9UKE5 1360 aa48.29■■■■■ 5.32
GRASP-208ENST00000552963 TOPBP1Q92547 1522 aa48.29■■■■■ 5.32
GRASP-208ENST00000552963 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa48.16■■■■■ 5.3
GRASP-208ENST00000552963 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
GRASP-208ENST00000552963 ERICH3Q5RHP9 1530 aa48.08■■■■■ 5.29
GRASP-208ENST00000552963 CUX2O14529 1486 aa48.07■■■■■ 5.29
GRASP-208ENST00000552963 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.06■■■■■ 5.28
GRASP-208ENST00000552963 PRXQ9BXM0 1461 aa48.06■■■■■ 5.28
GRASP-208ENST00000552963 UBTFP17480 764 aaKnown RBP48.06■■■■■ 5.28
GRASP-208ENST00000552963 CEP162Q5TB80 1403 aa48■■■■■ 5.28
GRASP-208ENST00000552963 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.98■■■■■ 5.27
GRASP-208ENST00000552963 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.98■■■■■ 5.27
GRASP-208ENST00000552963 MRC2Q9UBG0 1479 aa47.85■■■■■ 5.25
GRASP-208ENST00000552963 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.83■■■■■ 5.25
GRASP-208ENST00000552963 IGF1RP08069 1367 aa47.79■■■■■ 5.24
GRASP-208ENST00000552963 WDR97A6NE52 1622 aa47.77■■■■■ 5.24
GRASP-208ENST00000552963 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.6■■■■■ 5.21
GRASP-208ENST00000552963 WDR62O43379 1518 aa47.59■■■■■ 5.21
GRASP-208ENST00000552963 CLIP1P30622 1438 aa47.58■■■■■ 5.21
GRASP-208ENST00000552963 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.54■■■■■ 5.2
GRASP-208ENST00000552963 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.53■■■■■ 5.2
GRASP-208ENST00000552963 CUL7Q14999 1698 aa47.53■■■■■ 5.2
GRASP-208ENST00000552963 ERCC6Q03468 1493 aa47.52■■■■■ 5.2
GRASP-208ENST00000552963 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
GRASP-208ENST00000552963 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.41■■■■■ 5.18
GRASP-208ENST00000552963 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
GRASP-208ENST00000552963 IFT140Q96RY7 1462 aa47.33■■■■■ 5.17
GRASP-208ENST00000552963 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP47.33■■■■■ 5.17
GRASP-208ENST00000552963 PCGF6Q9BYE7 350 aa47.32■■■■■ 5.17
GRASP-208ENST00000552963 VPS8Q8N3P4 1428 aa47.25■■■■■ 5.15
GRASP-208ENST00000552963 PBRM1Q86U86 1689 aa47.13■■■■■ 5.14
GRASP-208ENST00000552963 ARAP1Q96P48 1450 aa47.05■■■■■ 5.12
GRASP-208ENST00000552963 GRIN2BQ13224 1484 aa47.04■■■■■ 5.12
GRASP-208ENST00000552963 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP47.01■■■■■ 5.12
GRASP-208ENST00000552963 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa46.99■■■■■ 5.11
GRASP-208ENST00000552963 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.99■■■■■ 5.11
GRASP-208ENST00000552963 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP46.99■■■■■ 5.11
GRASP-208ENST00000552963 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.94■■■■■ 5.11
GRASP-208ENST00000552963 ADAMTS12P58397 1594 aa46.91■■■■■ 5.1
GRASP-208ENST00000552963 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP46.9■■■■■ 5.1
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