RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552489.5

NUBPL-211, Transcript of nucleotide binding protein like, humanhuman

TSL 4

Gene NUBPL, Length 541 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBPL-211ENST00000552489 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.8■■■■■ 4.44
NUBPL-211ENST00000552489 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.3■■■■□ 3.72
NUBPL-211ENST00000552489 ABCC9O60706 1549 aa37.85■■■■□ 3.65
NUBPL-211ENST00000552489 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.29■■■■□ 3.4
NUBPL-211ENST00000552489 NACADO15069 1562 aa36.14■■■■□ 3.38
NUBPL-211ENST00000552489 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.96■■■■□ 3.35
NUBPL-211ENST00000552489 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.78■■■■□ 3.32
NUBPL-211ENST00000552489 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
NUBPL-211ENST00000552489 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.43■■■■□ 3.26
NUBPL-211ENST00000552489 UNC13AQ9UPW8 1703 aa35.38■■■■□ 3.25
NUBPL-211ENST00000552489 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.27■■■■□ 3.24
NUBPL-211ENST00000552489 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.11■■■■□ 3.21
NUBPL-211ENST00000552489 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.09■■■■□ 3.21
NUBPL-211ENST00000552489 SCRIBQ14160 1630 aa34.84■■■■□ 3.17
NUBPL-211ENST00000552489 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.84■■■■□ 3.17
NUBPL-211ENST00000552489 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
NUBPL-211ENST00000552489 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.23■■■■□ 3.07
NUBPL-211ENST00000552489 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.1■■■■□ 3.05
NUBPL-211ENST00000552489 NCAPD3P42695 1498 aa33.32■■■□□ 2.92
NUBPL-211ENST00000552489 SMARCA4P51532 1647 aa33.31■■■□□ 2.92
NUBPL-211ENST00000552489 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.25■■■□□ 2.91
NUBPL-211ENST00000552489 SMARCA2P51531 1590 aa33.24■■■□□ 2.91
NUBPL-211ENST00000552489 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.24■■■□□ 2.91
NUBPL-211ENST00000552489 HMGXB3Q12766 1538 aa33.12■■■□□ 2.89
NUBPL-211ENST00000552489 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.01■■■□□ 2.88
NUBPL-211ENST00000552489 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.98■■■□□ 2.87
NUBPL-211ENST00000552489 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.93■■■□□ 2.86
NUBPL-211ENST00000552489 ERCC6Q03468 1493 aa32.74■■■□□ 2.83
NUBPL-211ENST00000552489 NESP48681 1621 aa32.59■■■□□ 2.81
NUBPL-211ENST00000552489 CUX2O14529 1486 aa32.57■■■□□ 2.8
NUBPL-211ENST00000552489 WIZO95785 1651 aa32.56■■■□□ 2.8
NUBPL-211ENST00000552489 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.54■■■□□ 2.8
NUBPL-211ENST00000552489 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.41■■■□□ 2.78
NUBPL-211ENST00000552489 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.35■■■□□ 2.77
NUBPL-211ENST00000552489 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.32■■■□□ 2.77
NUBPL-211ENST00000552489 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
NUBPL-211ENST00000552489 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
NUBPL-211ENST00000552489 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.22■■■□□ 2.75
NUBPL-211ENST00000552489 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.07■■■□□ 2.72
NUBPL-211ENST00000552489 CFTRP13569 1480 aa32.03■■■□□ 2.72
NUBPL-211ENST00000552489 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.01■■■□□ 2.71
NUBPL-211ENST00000552489 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.97■■■□□ 2.71
NUBPL-211ENST00000552489 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.95■■■□□ 2.7
NUBPL-211ENST00000552489 WDR62O43379 1518 aa31.9■■■□□ 2.7
NUBPL-211ENST00000552489 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.83■■■□□ 2.69
NUBPL-211ENST00000552489 PRDM2Q13029 1718 aa31.78■■■□□ 2.68
NUBPL-211ENST00000552489 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.62■■■□□ 2.65
NUBPL-211ENST00000552489 ABCC8Q09428 1581 aa31.43■■■□□ 2.62
NUBPL-211ENST00000552489 TOPBP1Q92547 1522 aa31.37■■■□□ 2.61
NUBPL-211ENST00000552489 IFT140Q96RY7 1462 aa31.33■■■□□ 2.61
NUBPL-211ENST00000552489 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.31■■■□□ 2.6
NUBPL-211ENST00000552489 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.25■■■□□ 2.59
NUBPL-211ENST00000552489 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.14■■■□□ 2.58
NUBPL-211ENST00000552489 OSCARQ8IYS5 282 aa31.14■■■□□ 2.58
NUBPL-211ENST00000552489 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.07■■■□□ 2.56
NUBPL-211ENST00000552489 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
NUBPL-211ENST00000552489 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.05■■■□□ 2.56
NUBPL-211ENST00000552489 SOGA1O94964 1423 aa30.96■■■□□ 2.55
NUBPL-211ENST00000552489 CUX1P39880 1505 aa30.93■■■□□ 2.54
NUBPL-211ENST00000552489 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.93■■■□□ 2.54
NUBPL-211ENST00000552489 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.92■■■□□ 2.54
NUBPL-211ENST00000552489 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.9■■■□□ 2.54
NUBPL-211ENST00000552489 WDR97A6NE52 1622 aa30.87■■■□□ 2.53
NUBPL-211ENST00000552489 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.8■■■□□ 2.52
NUBPL-211ENST00000552489 TRIM41Q8WV44 630 aa30.8■■■□□ 2.52
NUBPL-211ENST00000552489 CHD1O14646 1710 aa30.73■■■□□ 2.51
NUBPL-211ENST00000552489 FBLN2P98095 1184 aa30.71■■■□□ 2.51
NUBPL-211ENST00000552489 GRIN2BQ13224 1484 aa30.67■■■□□ 2.5
NUBPL-211ENST00000552489 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.65■■■□□ 2.5
NUBPL-211ENST00000552489 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.65■■■□□ 2.5
NUBPL-211ENST00000552489 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.63■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.63■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.63■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.63■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.62■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 TOP2BQ02880 1626 aa30.59■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.59■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.58■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 ARHGEF11O15085 1522 aa30.58■■■□□ 2.49
NUBPL-211ENST00000552489 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
NUBPL-211ENST00000552489 PBRM1Q86U86 1689 aa30.55■■■□□ 2.48
NUBPL-211ENST00000552489 SYNJ2O15056 1496 aa30.52■■■□□ 2.48
NUBPL-211ENST00000552489 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.52■■■□□ 2.48
NUBPL-211ENST00000552489 SYNJ1O43426 1573 aa30.5■■■□□ 2.47
NUBPL-211ENST00000552489 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.39■■■□□ 2.46
NUBPL-211ENST00000552489 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.33■■■□□ 2.45
NUBPL-211ENST00000552489 ARAP1Q96P48 1450 aa30.28■■■□□ 2.44
NUBPL-211ENST00000552489 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.27■■■□□ 2.44
NUBPL-211ENST00000552489 ADAMTS12P58397 1594 aa30.27■■■□□ 2.44
NUBPL-211ENST00000552489 GRIN2AQ12879 1464 aa30.25■■■□□ 2.43
NUBPL-211ENST00000552489 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.24■■■□□ 2.43
NUBPL-211ENST00000552489 NUP160Q12769 1436 aa30.13■■■□□ 2.41
NUBPL-211ENST00000552489 CEP170Q5SW79 1584 aa30.09■■■□□ 2.41
NUBPL-211ENST00000552489 KIF27Q86VH2 1401 aa30.04■■■□□ 2.4
NUBPL-211ENST00000552489 SHROOM2Q13796 1616 aa29.96■■■□□ 2.39
NUBPL-211ENST00000552489 CUL7Q14999 1698 aa29.92■■■□□ 2.38
NUBPL-211ENST00000552489 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
NUBPL-211ENST00000552489 IGF1RP08069 1367 aa29.91■■■□□ 2.38
NUBPL-211ENST00000552489 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.87■■■□□ 2.37
NUBPL-211ENST00000552489 JPH4Q96JJ6 628 aa29.84■■■□□ 2.37
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