RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552403.5

TNS2-218, Transcript of tensin 2, humanhuman

TSL 3

Gene TNS2, Length 576 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS2-218ENST00000552403 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.24■■■■□ 3.87
TNS2-218ENST00000552403 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.1■■■■□ 3.21
TNS2-218ENST00000552403 ABCC9O60706 1549 aa34.93■■■■□ 3.18
TNS2-218ENST00000552403 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.3■■■□□ 2.92
TNS2-218ENST00000552403 NACADO15069 1562 aa33.13■■■□□ 2.89
TNS2-218ENST00000552403 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.01■■■□□ 2.87
TNS2-218ENST00000552403 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.76■■■□□ 2.83
TNS2-218ENST00000552403 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.66■■■□□ 2.82
TNS2-218ENST00000552403 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.6■■■□□ 2.81
TNS2-218ENST00000552403 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.57■■■□□ 2.8
TNS2-218ENST00000552403 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.57■■■□□ 2.8
TNS2-218ENST00000552403 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.42■■■□□ 2.78
TNS2-218ENST00000552403 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.4■■■□□ 2.78
TNS2-218ENST00000552403 SCRIBQ14160 1630 aa32.01■■■□□ 2.72
TNS2-218ENST00000552403 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.91■■■□□ 2.7
TNS2-218ENST00000552403 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.57■■■□□ 2.64
TNS2-218ENST00000552403 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
TNS2-218ENST00000552403 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.44■■■□□ 2.62
TNS2-218ENST00000552403 NCAPD3P42695 1498 aa30.62■■■□□ 2.49
TNS2-218ENST00000552403 SMARCA4P51532 1647 aa30.57■■■□□ 2.48
TNS2-218ENST00000552403 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.55■■■□□ 2.48
TNS2-218ENST00000552403 SMARCA2P51531 1590 aa30.45■■■□□ 2.46
TNS2-218ENST00000552403 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.42■■■□□ 2.46
TNS2-218ENST00000552403 HMGXB3Q12766 1538 aa30.38■■■□□ 2.45
TNS2-218ENST00000552403 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.27■■■□□ 2.44
TNS2-218ENST00000552403 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.27■■■□□ 2.44
TNS2-218ENST00000552403 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
TNS2-218ENST00000552403 ERCC6Q03468 1493 aa30.1■■■□□ 2.41
TNS2-218ENST00000552403 NESP48681 1621 aa30.09■■■□□ 2.41
TNS2-218ENST00000552403 CUX2O14529 1486 aa29.99■■■□□ 2.39
TNS2-218ENST00000552403 WIZO95785 1651 aa29.9■■■□□ 2.38
TNS2-218ENST00000552403 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.86■■■□□ 2.37
TNS2-218ENST00000552403 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.79■■■□□ 2.36
TNS2-218ENST00000552403 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
TNS2-218ENST00000552403 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
TNS2-218ENST00000552403 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.69■■■□□ 2.34
TNS2-218ENST00000552403 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.68■■■□□ 2.34
TNS2-218ENST00000552403 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.68■■■□□ 2.34
TNS2-218ENST00000552403 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.32
TNS2-218ENST00000552403 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.42■■■□□ 2.3
TNS2-218ENST00000552403 CFTRP13569 1480 aa29.4■■■□□ 2.3
TNS2-218ENST00000552403 WDR62O43379 1518 aa29.36■■■□□ 2.29
TNS2-218ENST00000552403 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.35■■■□□ 2.29
TNS2-218ENST00000552403 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.34■■■□□ 2.29
TNS2-218ENST00000552403 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.2■■■□□ 2.26
TNS2-218ENST00000552403 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TNS2-218ENST00000552403 PRDM2Q13029 1718 aa29.08■■■□□ 2.25
TNS2-218ENST00000552403 TOPBP1Q92547 1522 aa28.82■■■□□ 2.2
TNS2-218ENST00000552403 IFT140Q96RY7 1462 aa28.75■■■□□ 2.19
TNS2-218ENST00000552403 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.74■■■□□ 2.19
TNS2-218ENST00000552403 ABCC8Q09428 1581 aa28.73■■■□□ 2.19
TNS2-218ENST00000552403 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.72■■■□□ 2.19
TNS2-218ENST00000552403 OSCARQ8IYS5 282 aa28.67■■■□□ 2.18
TNS2-218ENST00000552403 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.56■■■□□ 2.16
TNS2-218ENST00000552403 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.55■■■□□ 2.16
TNS2-218ENST00000552403 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TNS2-218ENST00000552403 TRIM41Q8WV44 630 aa28.53■■■□□ 2.16
TNS2-218ENST00000552403 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
TNS2-218ENST00000552403 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.48■■■□□ 2.152e-8■■■■■ 35.6
TNS2-218ENST00000552403 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.45■■■□□ 2.14
TNS2-218ENST00000552403 CUX1P39880 1505 aa28.42■■■□□ 2.14
TNS2-218ENST00000552403 SOGA1O94964 1423 aa28.41■■■□□ 2.14
TNS2-218ENST00000552403 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.39■■■□□ 2.13
TNS2-218ENST00000552403 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TNS2-218ENST00000552403 CHD1O14646 1710 aa28.3■■■□□ 2.12
TNS2-218ENST00000552403 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.29■■■□□ 2.12
TNS2-218ENST00000552403 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.29■■■□□ 2.12
TNS2-218ENST00000552403 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.29■■■□□ 2.12
TNS2-218ENST00000552403 WDR97A6NE52 1622 aa28.23■■■□□ 2.11
TNS2-218ENST00000552403 FBLN2P98095 1184 aa28.22■■■□□ 2.11
TNS2-218ENST00000552403 ARHGEF11O15085 1522 aa28.22■■■□□ 2.11
TNS2-218ENST00000552403 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa28.18■■■□□ 2.1
TNS2-218ENST00000552403 GRIN2BQ13224 1484 aa28.13■■■□□ 2.09
TNS2-218ENST00000552403 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
TNS2-218ENST00000552403 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.08■■■□□ 2.09
TNS2-218ENST00000552403 GAPVD1Q14C86 1478 aa28.06■■■□□ 2.08
TNS2-218ENST00000552403 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
TNS2-218ENST00000552403 PBRM1Q86U86 1689 aa28.03■■■□□ 2.08
TNS2-218ENST00000552403 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.02■■■□□ 2.08
TNS2-218ENST00000552403 SYNJ2O15056 1496 aa28.02■■■□□ 2.08
TNS2-218ENST00000552403 CYB5RLQ6IPT4 315 aa28■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 CLASP1Q7Z460 1538 aa28■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 TOP2BQ02880 1626 aa28■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 SYNJ1O43426 1573 aa27.99■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 ARAP1Q96P48 1450 aa27.97■■■□□ 2.07
TNS2-218ENST00000552403 ADAMTS12P58397 1594 aa27.78■■■□□ 2.04
TNS2-218ENST00000552403 GRIN2AQ12879 1464 aa27.77■■■□□ 2.04
TNS2-218ENST00000552403 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.72■■■□□ 2.03
TNS2-218ENST00000552403 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.71■■■□□ 2.03
TNS2-218ENST00000552403 CEP170Q5SW79 1584 aa27.69■■■□□ 2.02
TNS2-218ENST00000552403 NUP160Q12769 1436 aa27.68■■■□□ 2.02
TNS2-218ENST00000552403 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.6■■■□□ 2.01
TNS2-218ENST00000552403 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.59■■■□□ 2.01
TNS2-218ENST00000552403 SHROOM2Q13796 1616 aa27.55■■■□□ 2
TNS2-218ENST00000552403 IGF1RP08069 1367 aa27.45■■□□□ 1.98
TNS2-218ENST00000552403 KIF27Q86VH2 1401 aa27.43■■□□□ 1.98
TNS2-218ENST00000552403 JPH4Q96JJ6 628 aa27.4■■□□□ 1.98
TNS2-218ENST00000552403 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms