RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551707.5

DGKA-233, Transcript of diacylglycerol kinase alpha, human

TSL 5

Gene DGKA, Length 605 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DGKA-233	ENST00000551707	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		55.39	■■■■■ 6.46
DGKA-233	ENST00000551707	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		49.59	■■■■■ 5.53
DGKA-233	ENST00000551707	ABCC9	O60706	1549 aa		49.48	■■■■■ 5.51
DGKA-233	ENST00000551707	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		47.12	■■■■■ 5.13
DGKA-233	ENST00000551707	NACAD	O15069	1562 aa		46.84	■■■■■ 5.09
DGKA-233	ENST00000551707	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		46.75	■■■■■ 5.07
DGKA-233	ENST00000551707	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		46.25	■■■■■ 4.99
DGKA-233	ENST00000551707	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		46.23	■■■■■ 4.99
DGKA-233	ENST00000551707	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	46.12	■■■■■ 4.97
DGKA-233	ENST00000551707	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		46.09	■■■■■ 4.97
DGKA-233	ENST00000551707	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	45.94	■■■■■ 4.95
DGKA-233	ENST00000551707	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		45.77	■■■■■ 4.92
DGKA-233	ENST00000551707	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		45.72	■■■■■ 4.91
DGKA-233	ENST00000551707	SCRIB	Q14160	1630 aa		45.26	■■■■■ 4.84
DGKA-233	ENST00000551707	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		45.1	■■■■■ 4.81
DGKA-233	ENST00000551707	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		44.68	■■■■■ 4.74
DGKA-233	ENST00000551707	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	44.62	■■■■■ 4.73
DGKA-233	ENST00000551707	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		44.53	■■■■■ 4.72
DGKA-233	ENST00000551707	NCAPD3	P42695	1498 aa		43.25	■■■■■ 4.51
DGKA-233	ENST00000551707	SMARCA4	P51532	1647 aa		43.18	■■■■■ 4.5
DGKA-233	ENST00000551707	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		43.17	■■■■■ 4.5
DGKA-233	ENST00000551707	SMARCA2	P51531	1590 aa		43.03	■■■■■ 4.48
DGKA-233	ENST00000551707	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	42.97	■■■■■ 4.47
DGKA-233	ENST00000551707	HMGXB3	Q12766	1538 aa		42.94	■■■■■ 4.46
DGKA-233	ENST00000551707	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	42.76	■■■■■ 4.44
DGKA-233	ENST00000551707	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		42.72	■■■■■ 4.43
DGKA-233	ENST00000551707	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		42.71	■■■■■ 4.43
DGKA-233	ENST00000551707	ERCC6	Q03468	1493 aa		42.68	■■■■■ 4.42
DGKA-233	ENST00000551707	NES	P48681	1621 aa		42.57	■■■■■ 4.4
DGKA-233	ENST00000551707	CUX2	O14529	1486 aa		42.5	■■■■■ 4.39
DGKA-233	ENST00000551707	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		42.28	■■■■■ 4.36
DGKA-233	ENST00000551707	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		42.24	■■■■■ 4.35
DGKA-233	ENST00000551707	WIZ	O95785	1651 aa		42.22	■■■■■ 4.35
DGKA-233	ENST00000551707	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	42.05	■■■■■ 4.32
DGKA-233	ENST00000551707	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		42	■■■■■ 4.31
DGKA-233	ENST00000551707	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		42	■■■■■ 4.31
DGKA-233	ENST00000551707	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		41.96	■■■■■ 4.31
DGKA-233	ENST00000551707	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	41.88	■■■■■ 4.3
DGKA-233	ENST00000551707	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	41.66	■■■■■ 4.26
DGKA-233	ENST00000551707	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		41.63	■■■■■ 4.25
DGKA-233	ENST00000551707	WDR62	O43379	1518 aa		41.52	■■■■■ 4.24
DGKA-233	ENST00000551707	CFTR	P13569	1480 aa		41.52	■■■■■ 4.24
DGKA-233	ENST00000551707	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		41.52	■■■■■ 4.24
DGKA-233	ENST00000551707	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		41.49	■■■■■ 4.23
DGKA-233	ENST00000551707	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		41.21	■■■■■ 4.19
DGKA-233	ENST00000551707	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	41.15	■■■■■ 4.18
DGKA-233	ENST00000551707	PRDM2	Q13029	1718 aa		41.1	■■■■■ 4.17
DGKA-233	ENST00000551707	TOPBP1	Q92547	1522 aa		40.73	■■■■■ 4.11
DGKA-233	ENST00000551707	IFT140	Q96RY7	1462 aa		40.66	■■■■■ 4.1
DGKA-233	ENST00000551707	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	40.62	■■■■■ 4.09
DGKA-233	ENST00000551707	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		40.62	■■■■■ 4.09
DGKA-233	ENST00000551707	ABCC8	Q09428	1581 aa		40.61	■■■■■ 4.09
DGKA-233	ENST00000551707	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		40.59	■■■■■ 4.09
DGKA-233	ENST00000551707	TRIM41	Q8WV44	630 aa		40.57	■■■■■ 4.09
DGKA-233	ENST00000551707	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	40.39	■■■■■ 4.06
DGKA-233	ENST00000551707	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	40.34	■■■■■ 4.05
DGKA-233	ENST00000551707	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	40.33	■■■■■ 4.05
DGKA-233	ENST00000551707	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	40.28	■■■■■ 4.04	6e-7	■■■■■ 33
DGKA-233	ENST00000551707	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	40.24	■■■■■ 4.03
DGKA-233	ENST00000551707	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		40.21	■■■■■ 4.03
DGKA-233	ENST00000551707	SOGA1	O94964	1423 aa		40.16	■■■■■ 4.02
DGKA-233	ENST00000551707	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		40.12	■■■■■ 4.01
DGKA-233	ENST00000551707	CUX1	P39880	1505 aa		40.11	■■■■■ 4.01
DGKA-233	ENST00000551707	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		40.09	■■■■■ 4.01
DGKA-233	ENST00000551707	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		40.09	■■■■■ 4.01
DGKA-233	ENST00000551707	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		40.09	■■■■■ 4.01
DGKA-233	ENST00000551707	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	40.07	■■■■■ 4
DGKA-233	ENST00000551707	CHD1	O14646	1710 aa		40.05	■■■■■ 4
DGKA-233	ENST00000551707	FBLN2	P98095	1184 aa		40	■■■■□ 3.99
DGKA-233	ENST00000551707	ARHGEF11	O15085	1522 aa		39.97	■■■■□ 3.99
DGKA-233	ENST00000551707	WDR97	A6NE52	1622 aa		39.9	■■■■□ 3.98
DGKA-233	ENST00000551707	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		39.87	■■■■□ 3.97
DGKA-233	ENST00000551707	GRIN2B	Q13224	1484 aa		39.76	■■■■□ 3.96
DGKA-233	ENST00000551707	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	39.74	■■■■□ 3.95
DGKA-233	ENST00000551707	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	39.71	■■■■□ 3.95
DGKA-233	ENST00000551707	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		39.7	■■■■□ 3.95
DGKA-233	ENST00000551707	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		39.67	■■■■□ 3.94
DGKA-233	ENST00000551707	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		39.65	■■■■□ 3.94
DGKA-233	ENST00000551707	PBRM1	Q86U86	1689 aa		39.64	■■■■□ 3.94
DGKA-233	ENST00000551707	SYNJ2	O15056	1496 aa		39.61	■■■■□ 3.93
DGKA-233	ENST00000551707	ARAP1	Q96P48	1450 aa		39.61	■■■■□ 3.93
DGKA-233	ENST00000551707	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		39.59	■■■■□ 3.93
DGKA-233	ENST00000551707	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		39.58	■■■■□ 3.93
DGKA-233	ENST00000551707	SYNJ1	O43426	1573 aa		39.57	■■■■□ 3.92
DGKA-233	ENST00000551707	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	39.53	■■■■□ 3.92
DGKA-233	ENST00000551707	TOP2B	Q02880	1626 aa		39.5	■■■■□ 3.91
DGKA-233	ENST00000551707	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		39.5	■■■■□ 3.91
DGKA-233	ENST00000551707	ADAMTS12	P58397	1594 aa		39.27	■■■■□ 3.88
DGKA-233	ENST00000551707	GRIN2A	Q12879	1464 aa		39.26	■■■■□ 3.88
DGKA-233	ENST00000551707	TRH	P20396	242 aa	Predicted RBP	39.2	■■■■□ 3.87
DGKA-233	ENST00000551707	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		39.15	■■■■□ 3.86
DGKA-233	ENST00000551707	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		39.14	■■■■□ 3.86
DGKA-233	ENST00000551707	CEP170	Q5SW79	1584 aa		39.12	■■■■□ 3.85
DGKA-233	ENST00000551707	NUP160	Q12769	1436 aa		39.12	■■■■□ 3.85
DGKA-233	ENST00000551707	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		39.04	■■■■□ 3.84
DGKA-233	ENST00000551707	SHROOM2	Q13796	1616 aa		38.91	■■■■□ 3.82
DGKA-233	ENST00000551707	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	38.74	■■■■□ 3.79
DGKA-233	ENST00000551707	JPH4	Q96JJ6	628 aa		38.74	■■■■□ 3.79
DGKA-233	ENST00000551707	KIF27	Q86VH2	1401 aa		38.73	■■■■□ 3.79
DGKA-233	ENST00000551707	IGF1R	P08069	1367 aa		38.72	■■■■□ 3.79

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