RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550808.5

MTA1-218, Transcript of metastasis associated 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTA1, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTA1-218ENST00000550808 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.55■■■■■ 6.8
MTA1-218ENST00000550808 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.55■■■■■ 5.84
MTA1-218ENST00000550808 ABCC9O60706 1549 aa51.31■■■■■ 5.8
MTA1-218ENST00000550808 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.92■■■■■ 5.42
MTA1-218ENST00000550808 NACADO15069 1562 aa48.63■■■■■ 5.38
MTA1-218ENST00000550808 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.55■■■■■ 5.36
MTA1-218ENST00000550808 MYO15BQ96JP2 1530 aa47.98■■■■■ 5.27
MTA1-218ENST00000550808 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.93■■■■■ 5.26
MTA1-218ENST00000550808 DNAJC5BQ9UF47 199 aa47.84■■■■■ 5.25
MTA1-218ENST00000550808 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.81■■■■■ 5.243e-6■■■□□ 16.5
MTA1-218ENST00000550808 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP47.75■■■■■ 5.23
MTA1-218ENST00000550808 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.5■■■■■ 5.19
MTA1-218ENST00000550808 BICRAQ9NZM4 1560 aa47.49■■■■■ 5.19
MTA1-218ENST00000550808 SCRIBQ14160 1630 aa47.05■■■■■ 5.12
MTA1-218ENST00000550808 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.77■■■■■ 5.08
MTA1-218ENST00000550808 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.36■■■■■ 5.01
MTA1-218ENST00000550808 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP46.3■■■■■ 5
MTA1-218ENST00000550808 CECR2Q9BXF3 1484 aa46.15■■■■■ 4.98
MTA1-218ENST00000550808 SMARCA4P51532 1647 aa44.87■■■■■ 4.77
MTA1-218ENST00000550808 NCAPD3P42695 1498 aa44.86■■■■■ 4.77
MTA1-218ENST00000550808 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.79■■■■■ 4.76
MTA1-218ENST00000550808 SMARCA2P51531 1590 aa44.7■■■■■ 4.75
MTA1-218ENST00000550808 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.66■■■■■ 4.74
MTA1-218ENST00000550808 HMGXB3Q12766 1538 aa44.58■■■■■ 4.73
MTA1-218ENST00000550808 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.41■■■■■ 4.7
MTA1-218ENST00000550808 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.39■■■■■ 4.7
MTA1-218ENST00000550808 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.37■■■■■ 4.69
MTA1-218ENST00000550808 ERCC6Q03468 1493 aa44.27■■■■■ 4.68
MTA1-218ENST00000550808 NESP48681 1621 aa44.16■■■■■ 4.66
MTA1-218ENST00000550808 CUX2O14529 1486 aa44.02■■■■■ 4.64
MTA1-218ENST00000550808 WIZO95785 1651 aa43.92■■■■■ 4.62
MTA1-218ENST00000550808 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.84■■■■■ 4.61
MTA1-218ENST00000550808 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa43.68■■■■■ 4.58
MTA1-218ENST00000550808 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.65■■■■■ 4.58
MTA1-218ENST00000550808 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.63■■■■■ 4.58
MTA1-218ENST00000550808 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.56■■■■■ 4.56
MTA1-218ENST00000550808 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.53■■■■■ 4.56
MTA1-218ENST00000550808 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.53■■■■■ 4.56
MTA1-218ENST00000550808 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.52
MTA1-218ENST00000550808 MRC2Q9UBG0 1479 aa43.19■■■■■ 4.51
MTA1-218ENST00000550808 CFTRP13569 1480 aa43.09■■■■■ 4.49
MTA1-218ENST00000550808 CEP164Q9UPV0 1460 aa43.09■■■■■ 4.49
MTA1-218ENST00000550808 WDR62O43379 1518 aa43.07■■■■■ 4.49
MTA1-218ENST00000550808 FANCD2Q9BXW9 1451 aa43.07■■■■■ 4.49
MTA1-218ENST00000550808 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.83■■■■■ 4.45
MTA1-218ENST00000550808 PRDM2Q13029 1718 aa42.81■■■■■ 4.44
MTA1-218ENST00000550808 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.71■■■■■ 4.43
MTA1-218ENST00000550808 TOPBP1Q92547 1522 aa42.3■■■■■ 4.36
MTA1-218ENST00000550808 IFT140Q96RY7 1462 aa42.19■■■■■ 4.34
MTA1-218ENST00000550808 ABCC8Q09428 1581 aa42.17■■■■■ 4.34
MTA1-218ENST00000550808 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.17■■■■■ 4.34
MTA1-218ENST00000550808 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP42.15■■■■■ 4.34
MTA1-218ENST00000550808 OSCARQ8IYS5 282 aa42.08■■■■■ 4.33
MTA1-218ENST00000550808 TRIM41Q8WV44 630 aa41.98■■■■■ 4.31
MTA1-218ENST00000550808 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
MTA1-218ENST00000550808 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP41.92■■■■■ 4.3
MTA1-218ENST00000550808 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
MTA1-218ENST00000550808 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.87■■■■■ 4.29
MTA1-218ENST00000550808 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.8■■■■■ 4.283e-9■■■■□ 24
MTA1-218ENST00000550808 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.75■■■■■ 4.27
MTA1-218ENST00000550808 SOGA1O94964 1423 aa41.69■■■■■ 4.26
MTA1-218ENST00000550808 CUX1P39880 1505 aa41.68■■■■■ 4.26
MTA1-218ENST00000550808 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.67■■■■■ 4.26
MTA1-218ENST00000550808 CHD1O14646 1710 aa41.64■■■■■ 4.26
MTA1-218ENST00000550808 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
MTA1-218ENST00000550808 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
MTA1-218ENST00000550808 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
MTA1-218ENST00000550808 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa41.57■■■■■ 4.25
MTA1-218ENST00000550808 FBLN2P98095 1184 aa41.51■■■■■ 4.24
MTA1-218ENST00000550808 WDR97A6NE52 1622 aa41.44■■■■■ 4.22
MTA1-218ENST00000550808 ARHGEF11O15085 1522 aa41.43■■■■■ 4.22
MTA1-218ENST00000550808 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.38■■■■■ 4.21
MTA1-218ENST00000550808 GRIN2BQ13224 1484 aa41.28■■■■■ 4.2
MTA1-218ENST00000550808 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
MTA1-218ENST00000550808 PBRM1Q86U86 1689 aa41.23■■■■■ 4.19
MTA1-218ENST00000550808 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
MTA1-218ENST00000550808 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.19■■■■■ 4.18
MTA1-218ENST00000550808 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.18■■■■■ 4.18
MTA1-218ENST00000550808 CYB5RLQ6IPT4 315 aa41.13■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.13■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 SYNJ2O15056 1496 aa41.11■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.11■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 SYNJ1O43426 1573 aa41.09■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 TOP2BQ02880 1626 aa41.09■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.08■■■■■ 4.17
MTA1-218ENST00000550808 CLASP1Q7Z460 1538 aa41.07■■■■■ 4.16
MTA1-218ENST00000550808 ARAP1Q96P48 1450 aa41.04■■■■■ 4.16
MTA1-218ENST00000550808 ADAMTS12P58397 1594 aa40.8■■■■■ 4.12
MTA1-218ENST00000550808 GRIN2AQ12879 1464 aa40.77■■■■■ 4.12
MTA1-218ENST00000550808 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.67■■■■■ 4.1
MTA1-218ENST00000550808 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.66■■■■■ 4.1
MTA1-218ENST00000550808 CEP170Q5SW79 1584 aa40.64■■■■■ 4.1
MTA1-218ENST00000550808 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
MTA1-218ENST00000550808 NUP160Q12769 1436 aa40.59■■■■■ 4.09
MTA1-218ENST00000550808 ERCC6L2Q5T890 1561 aa40.51■■■■■ 4.08
MTA1-218ENST00000550808 SHROOM2Q13796 1616 aa40.42■■■■■ 4.06
MTA1-218ENST00000550808 KIF27Q86VH2 1401 aa40.27■■■■■ 4.04
MTA1-218ENST00000550808 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.22■■■■■ 4.03
MTA1-218ENST00000550808 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
MTA1-218ENST00000550808 IGF1RP08069 1367 aa40.22■■■■■ 4.03
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