RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550790.1

PACS2-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene PACS2, Length 1,163 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS2-210ENST00000550790 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.2■■■■■ 6.11
PACS2-210ENST00000550790 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa47.54■■■■■ 5.2
PACS2-210ENST00000550790 ABCC9O60706 1549 aa47.47■■■■■ 5.19
PACS2-210ENST00000550790 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.22■■■■■ 4.83
PACS2-210ENST00000550790 NACADO15069 1562 aa44.99■■■■■ 4.79
PACS2-210ENST00000550790 DCAF8L2P0C7V8 631 aa44.81■■■■■ 4.76
PACS2-210ENST00000550790 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.58■■■■■ 4.73
PACS2-210ENST00000550790 MYO15BQ96JP2 1530 aa44.5■■■■■ 4.71
PACS2-210ENST00000550790 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.3■■■■■ 4.681e-6■■■■□ 24.5
PACS2-210ENST00000550790 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.13■■■■■ 4.66
PACS2-210ENST00000550790 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
PACS2-210ENST00000550790 BICRAQ9NZM4 1560 aa43.97■■■■■ 4.63
PACS2-210ENST00000550790 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa43.97■■■■■ 4.63
PACS2-210ENST00000550790 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa43.37■■■■■ 4.53
PACS2-210ENST00000550790 SCRIBQ14160 1630 aa43.32■■■■■ 4.53
PACS2-210ENST00000550790 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa42.87■■■■■ 4.45
PACS2-210ENST00000550790 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP42.83■■■■■ 4.45
PACS2-210ENST00000550790 CECR2Q9BXF3 1484 aa42.76■■■■■ 4.44
PACS2-210ENST00000550790 NCAPD3P42695 1498 aa41.62■■■■■ 4.25
PACS2-210ENST00000550790 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.48■■■■■ 4.23
PACS2-210ENST00000550790 SMARCA4P51532 1647 aa41.39■■■■■ 4.22
PACS2-210ENST00000550790 SMARCA2P51531 1590 aa41.3■■■■■ 4.2
PACS2-210ENST00000550790 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.22■■■■■ 4.19
PACS2-210ENST00000550790 HMGXB3Q12766 1538 aa41.22■■■■■ 4.19
PACS2-210ENST00000550790 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.05■■■■■ 4.16
PACS2-210ENST00000550790 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.01■■■■■ 4.16
PACS2-210ENST00000550790 MROH2BQ7Z745 1585 aa40.99■■■■■ 4.15
PACS2-210ENST00000550790 ERCC6Q03468 1493 aa40.92■■■■■ 4.14
PACS2-210ENST00000550790 CUX2O14529 1486 aa40.86■■■■■ 4.13
PACS2-210ENST00000550790 NESP48681 1621 aa40.85■■■■■ 4.13
PACS2-210ENST00000550790 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.8■■■■■ 4.12
PACS2-210ENST00000550790 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa40.55■■■■■ 4.08
PACS2-210ENST00000550790 WIZO95785 1651 aa40.43■■■■■ 4.06
PACS2-210ENST00000550790 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.36■■■■■ 4.05
PACS2-210ENST00000550790 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.35■■■■■ 4.05
PACS2-210ENST00000550790 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.34■■■■■ 4.05
PACS2-210ENST00000550790 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.24■■■■■ 4.03
PACS2-210ENST00000550790 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.21■■■■■ 4.03
PACS2-210ENST00000550790 MRC2Q9UBG0 1479 aa39.96■■■■□ 3.99
PACS2-210ENST00000550790 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP39.95■■■■□ 3.99
PACS2-210ENST00000550790 CFTRP13569 1480 aa39.92■■■■□ 3.98
PACS2-210ENST00000550790 WDR62O43379 1518 aa39.86■■■■□ 3.97
PACS2-210ENST00000550790 FANCD2Q9BXW9 1451 aa39.82■■■■□ 3.97
PACS2-210ENST00000550790 CEP164Q9UPV0 1460 aa39.81■■■■□ 3.96
PACS2-210ENST00000550790 CCDC88BA6NC98 1476 aa39.57■■■■□ 3.93
PACS2-210ENST00000550790 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.51■■■■□ 3.92
PACS2-210ENST00000550790 PRDM2Q13029 1718 aa39.31■■■■□ 3.88
PACS2-210ENST00000550790 OSCARQ8IYS5 282 aa39.11■■■■□ 3.85
PACS2-210ENST00000550790 TOPBP1Q92547 1522 aa39.09■■■■□ 3.85
PACS2-210ENST00000550790 IFT140Q96RY7 1462 aa39.05■■■■□ 3.84
PACS2-210ENST00000550790 ABCC8Q09428 1581 aa39.03■■■■□ 3.84
PACS2-210ENST00000550790 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39■■■■□ 3.83
PACS2-210ENST00000550790 TRIM41Q8WV44 630 aa38.93■■■■□ 3.82
PACS2-210ENST00000550790 DNMBPQ6XZF7 1577 aa38.92■■■■□ 3.82
PACS2-210ENST00000550790 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
PACS2-210ENST00000550790 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
PACS2-210ENST00000550790 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP38.69■■■■□ 3.78
PACS2-210ENST00000550790 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP38.68■■■■□ 3.78
PACS2-210ENST00000550790 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa38.58■■■■□ 3.77
PACS2-210ENST00000550790 SOGA1O94964 1423 aa38.57■■■■□ 3.77
PACS2-210ENST00000550790 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP38.52■■■■□ 3.76
PACS2-210ENST00000550790 CUX1P39880 1505 aa38.48■■■■□ 3.75
PACS2-210ENST00000550790 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.48■■■■□ 3.75
PACS2-210ENST00000550790 FGD5Q6ZNL6 1462 aa38.47■■■■□ 3.75
PACS2-210ENST00000550790 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.45■■■■□ 3.75
PACS2-210ENST00000550790 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.45■■■■□ 3.75
PACS2-210ENST00000550790 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.45■■■■□ 3.75
PACS2-210ENST00000550790 ARHGEF11O15085 1522 aa38.38■■■■□ 3.74
PACS2-210ENST00000550790 FBLN2P98095 1184 aa38.36■■■■□ 3.73
PACS2-210ENST00000550790 CHD1O14646 1710 aa38.33■■■■□ 3.73
PACS2-210ENST00000550790 WDR97A6NE52 1622 aa38.3■■■■□ 3.72
PACS2-210ENST00000550790 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.22■■■■□ 3.71
PACS2-210ENST00000550790 GRIN2BQ13224 1484 aa38.18■■■■□ 3.7
PACS2-210ENST00000550790 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.16■■■■□ 3.7
PACS2-210ENST00000550790 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.15■■■■□ 3.7
PACS2-210ENST00000550790 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.14■■■■□ 3.7
PACS2-210ENST00000550790 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.07■■■■□ 3.69
PACS2-210ENST00000550790 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.07■■■■□ 3.68
PACS2-210ENST00000550790 SYNJ2O15056 1496 aa38.03■■■■□ 3.68
PACS2-210ENST00000550790 ARAP1Q96P48 1450 aa38.03■■■■□ 3.68
PACS2-210ENST00000550790 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.02■■■■□ 3.68
PACS2-210ENST00000550790 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP37.95■■■■□ 3.67
PACS2-210ENST00000550790 SYNJ1O43426 1573 aa37.94■■■■□ 3.66
PACS2-210ENST00000550790 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa37.94■■■■□ 3.66
PACS2-210ENST00000550790 PBRM1Q86U86 1689 aa37.9■■■■□ 3.66
PACS2-210ENST00000550790 TOP2BQ02880 1626 aa37.87■■■■□ 3.65
PACS2-210ENST00000550790 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa37.84■■■■□ 3.65
PACS2-210ENST00000550790 GRIN2AQ12879 1464 aa37.68■■■■□ 3.62
PACS2-210ENST00000550790 ADAMTS12P58397 1594 aa37.62■■■■□ 3.61
PACS2-210ENST00000550790 FHAD1B1AJZ9 1412 aa37.61■■■■□ 3.61
PACS2-210ENST00000550790 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
PACS2-210ENST00000550790 NUP160Q12769 1436 aa37.6■■■■□ 3.61
PACS2-210ENST00000550790 ERICH3Q5RHP9 1530 aa37.57■■■■□ 3.61
PACS2-210ENST00000550790 CEP170Q5SW79 1584 aa37.52■■■■□ 3.6
PACS2-210ENST00000550790 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.44■■■■□ 3.58
PACS2-210ENST00000550790 SHROOM2Q13796 1616 aa37.35■■■■□ 3.57
PACS2-210ENST00000550790 JPH4Q96JJ6 628 aa37.27■■■■□ 3.56
PACS2-210ENST00000550790 IGF1RP08069 1367 aa37.26■■■■□ 3.55
PACS2-210ENST00000550790 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
PACS2-210ENST00000550790 KIF27Q86VH2 1401 aa37.17■■■■□ 3.54
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