RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550652.1

ANKRD33-208, Transcript of ankyrin repeat domain 33, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD33, Length 925 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD33-208ENST00000550652 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.72■■■□□ 2.35
ANKRD33-208ENST00000550652 ABCC9O60706 1549 aa27.06■■□□□ 1.92
ANKRD33-208ENST00000550652 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.61■■□□□ 1.85
ANKRD33-208ENST00000550652 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.67■■□□□ 1.7
ANKRD33-208ENST00000550652 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.6■■□□□ 1.69
ANKRD33-208ENST00000550652 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.41■■□□□ 1.66
ANKRD33-208ENST00000550652 NACADO15069 1562 aa25.32■■□□□ 1.64
ANKRD33-208ENST00000550652 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
ANKRD33-208ENST00000550652 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.82■■□□□ 1.56
ANKRD33-208ENST00000550652 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.81■■□□□ 1.56
ANKRD33-208ENST00000550652 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.71■■□□□ 1.55
ANKRD33-208ENST00000550652 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
ANKRD33-208ENST00000550652 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.5■■□□□ 1.51
ANKRD33-208ENST00000550652 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.46■■□□□ 1.51
ANKRD33-208ENST00000550652 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.44■■□□□ 1.5
ANKRD33-208ENST00000550652 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.35■■□□□ 1.49
ANKRD33-208ENST00000550652 SCRIBQ14160 1630 aa24.33■■□□□ 1.49
ANKRD33-208ENST00000550652 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD33-208ENST00000550652 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.94■■□□□ 1.42
ANKRD33-208ENST00000550652 ERCC6Q03468 1493 aa23.48■■□□□ 1.35
ANKRD33-208ENST00000550652 CUX2O14529 1486 aa23.47■■□□□ 1.35
ANKRD33-208ENST00000550652 NCAPD3P42695 1498 aa23.4■■□□□ 1.34
ANKRD33-208ENST00000550652 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.25■■□□□ 1.31
ANKRD33-208ENST00000550652 SMARCA2P51531 1590 aa23.19■■□□□ 1.3
ANKRD33-208ENST00000550652 SMARCA4P51532 1647 aa23.18■■□□□ 1.3
ANKRD33-208ENST00000550652 HMGXB3Q12766 1538 aa23.13■■□□□ 1.29
ANKRD33-208ENST00000550652 NESP48681 1621 aa23.08■■□□□ 1.29
ANKRD33-208ENST00000550652 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
ANKRD33-208ENST00000550652 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
ANKRD33-208ENST00000550652 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.94■■□□□ 1.26
ANKRD33-208ENST00000550652 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD33-208ENST00000550652 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.91■■□□□ 1.26
ANKRD33-208ENST00000550652 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.89■■□□□ 1.26
ANKRD33-208ENST00000550652 TRIM41Q8WV44 630 aa22.83■■□□□ 1.25
ANKRD33-208ENST00000550652 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
ANKRD33-208ENST00000550652 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.73■■□□□ 1.23
ANKRD33-208ENST00000550652 WIZO95785 1651 aa22.71■■□□□ 1.23
ANKRD33-208ENST00000550652 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.7■■□□□ 1.22
ANKRD33-208ENST00000550652 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.63■■□□□ 1.21
ANKRD33-208ENST00000550652 WDR62O43379 1518 aa22.52■■□□□ 1.19
ANKRD33-208ENST00000550652 OSCARQ8IYS5 282 aa22.51■■□□□ 1.19
ANKRD33-208ENST00000550652 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.49■■□□□ 1.19
ANKRD33-208ENST00000550652 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
ANKRD33-208ENST00000550652 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.43■■□□□ 1.18
ANKRD33-208ENST00000550652 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ANKRD33-208ENST00000550652 CFTRP13569 1480 aa22.32■■□□□ 1.16
ANKRD33-208ENST00000550652 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
ANKRD33-208ENST00000550652 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.13■■□□□ 1.13
ANKRD33-208ENST00000550652 PRDM2Q13029 1718 aa22.09■■□□□ 1.13
ANKRD33-208ENST00000550652 IFT140Q96RY7 1462 aa22.07■■□□□ 1.12
ANKRD33-208ENST00000550652 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD33-208ENST00000550652 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD33-208ENST00000550652 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.01■■□□□ 1.11
ANKRD33-208ENST00000550652 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22■■□□□ 1.11
ANKRD33-208ENST00000550652 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
ANKRD33-208ENST00000550652 ABCC8Q09428 1581 aa21.97■■□□□ 1.11
ANKRD33-208ENST00000550652 ARHGEF11O15085 1522 aa21.95■■□□□ 1.1
ANKRD33-208ENST00000550652 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ANKRD33-208ENST00000550652 FBLN2P98095 1184 aa21.93■■□□□ 1.1
ANKRD33-208ENST00000550652 TOPBP1Q92547 1522 aa21.92■■□□□ 1.1
ANKRD33-208ENST00000550652 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
ANKRD33-208ENST00000550652 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
ANKRD33-208ENST00000550652 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.8■■□□□ 1.08
ANKRD33-208ENST00000550652 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 CHD1O14646 1710 aa21.69■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 SOGA1O94964 1423 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 ARAP1Q96P48 1450 aa21.68■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
ANKRD33-208ENST00000550652 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ANKRD33-208ENST00000550652 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.62■■□□□ 1.05
ANKRD33-208ENST00000550652 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD33-208ENST00000550652 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD33-208ENST00000550652 CUX1P39880 1505 aa21.54■■□□□ 1.04
ANKRD33-208ENST00000550652 SYNJ1O43426 1573 aa21.51■■□□□ 1.03
ANKRD33-208ENST00000550652 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
ANKRD33-208ENST00000550652 WDR97A6NE52 1622 aa21.5■■□□□ 1.03
ANKRD33-208ENST00000550652 GRIN2BQ13224 1484 aa21.49■■□□□ 1.03
ANKRD33-208ENST00000550652 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.45■■□□□ 1.02
ANKRD33-208ENST00000550652 SYNJ2O15056 1496 aa21.44■■□□□ 1.02
ANKRD33-208ENST00000550652 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.37■■□□□ 1.01
ANKRD33-208ENST00000550652 PBRM1Q86U86 1689 aa21.31■■□□□ 1
ANKRD33-208ENST00000550652 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.26■□□□□ 0.99
ANKRD33-208ENST00000550652 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.25■□□□□ 0.99
ANKRD33-208ENST00000550652 TOP2BQ02880 1626 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD33-208ENST00000550652 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.21■□□□□ 0.99
ANKRD33-208ENST00000550652 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.21■□□□□ 0.99
ANKRD33-208ENST00000550652 GRIN2AQ12879 1464 aa21.17■□□□□ 0.98
ANKRD33-208ENST00000550652 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
ANKRD33-208ENST00000550652 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.1■□□□□ 0.97
ANKRD33-208ENST00000550652 NUP160Q12769 1436 aa21.09■□□□□ 0.97
ANKRD33-208ENST00000550652 ADAMTS12P58397 1594 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD33-208ENST00000550652 CEP170Q5SW79 1584 aa21.08■□□□□ 0.97
ANKRD33-208ENST00000550652 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.06■□□□□ 0.96
ANKRD33-208ENST00000550652 JPH4Q96JJ6 628 aa21.04■□□□□ 0.96
ANKRD33-208ENST00000550652 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP21.01■□□□□ 0.95
ANKRD33-208ENST00000550652 FAM69CQ0P6D2 419 aa20.99■□□□□ 0.95
ANKRD33-208ENST00000550652 ERICH3Q5RHP9 1530 aa20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms